ジニトロトルエン(dntp)とDDT (ddntp)の違い

dntpとddntpの主な違いは、dntpまたはデオキシリボヌクレオチドが五炭糖構造上に3ʹ-OH基を持つdnaの成分であるのに対し、ddntpまたはジデオキシリボヌクレオシド三リン酸は3ʹ-OH基を持たないヌクレオチドで、異なる長さのdna配列を作るサンガーダブルデオキシDNAシーケンス技術に使用されており...（以下略）。

dNTPとddNTPの大きな違いは、dNTPまたはデオキシリボヌクレオチドがペントース構造上に3ʹ-OH基を持つDNAの成分であるのに対し、ddNTPまたはジデオキシリボヌクレオシド三リン酸は3ʹ-OH基を欠く核酸で、サンガー式ジデオキシDNAシーケンス法において異なる長のDNA配列にするために用いられることだ。

dNTP、ddNTPはヌクレオチド、dNTPはデオキシリボヌクレオチドです。DNAの合成にはdNTPが使われる。一方、dNTPはジデオキシリボヌクレオシド三リン酸のことで、DNAの構成単位である。サンガーシークエンスでは、異なる長さのDNA合成を終了させるために使用されます。3ʹの位置にOH基がない。水素はOH基ではなく、3ʹ位に存在する。dNTPはDNA合成を行うことができるが、ddNTPはDNAの重合を終了させることができる。

カタログ

1. 概要と主な違い 2. dNTPとは 3. DdNTPとは 4. dNTPとDdNTPの類似点 5. 横並びの比較 - 表形式でのdNTPとDdNTP 6. 要約

ジニトロトルエン(dntp)は何ですか？

dNTPはdeoxyribonucleotideまたはdeoxyribonucleotideの略です。DNAの構成要素である。dATP、dTTP、dCTP、dGTPは、プリンやピリミジンの窒素塩基であるアデニン（A）、グアニン（G）、チミン（T）、シトシン（C）にちなんで命名された。

図01：dNTP

アデニンとグアニンはプリン塩基、チミンとシトシンはピリミジン塩基である。また、リン酸基もあります。このようにdNTPは、窒素塩基、デオキシリボース糖、リン酸基の3つの部分から構成されている。これらのdNTPは、互いにホスホジエステル結合で結合している。dNTPでは、五炭糖の3ʹ位にOH基があり、次のヌクレオチド糖の5ʹ炭素上のリン酸基と結合を形成するために必要である。すべてのDNAに3ʹ-OH基があるため、DNA鎖の合成や伸長が可能である。このように、dNTPはDNAや遺伝化学物質の基本的な繰り返し単位であり、dNTPの合成は常に5ʹから3ʹへと進む。

DDT (ddntp)は何ですか？

サンガーシークエンスは、1977年にFrederick Sangerとその研究所によって開発された第一世代のDNA配列決定法である。ddNTPはサンガーシーケンスに用いられるヌクレオチドです。サンガーシーケンスは、in vitroのDNA複製とDNA合成の終了の間にddNTPを選択的に取り込むことに基づいており、ddNTPはその点で特異的です。は、ペントースの3ʹ-OH基を欠き、隣接するヌクレオチドの5ʹリン酸基の間でホスホジエステル結合を形成し続ける。したがって、伸長した鎖にddNTPが付着すると、その時点から鎖の伸長が止まり、終了する。サンガーシーケンス法では、ddNTPはDNAポリメラーゼの鎖伸長阻害剤として作用する。

図02：ddNTP

サンガーシークエンスでは、ddATP、ddCTP、ddGTP、ddTTPの4つのddntpが使用されます。これらのヌクレオチドが成長中のDNA鎖に取り込まれると、DNA複製プロセスを停止させます。キャピラリーゲル電気泳動は、これらの短いDNA鎖の大きさを1つのゲルの中で整理するために使用される。DNA配列の解析を容易にするために、ddNTPは放射性同位元素や蛍光色で標識されている。このゲルを分析することで、未知のDNA鎖の塩基配列を決定することができる。

ジニトロトルエン(dntp)とDDT (ddntp)の共通点

サンガーシークエンスには、dNTPとddNTPの両方を使用した。
dNTPとddNTPは4種類あります。
窒素基、デオキシリボース基、リン酸基の3つの成分から構成されている。