主な違い - ジェノタイピングとシーケンシング

ジェノタイピングとシーケンシングは、核酸（主に生物のDNA）に関する情報を得るための2つの技術です。ジェノタイピングとシーケンシングの大きな違いは、ジェノタイピングがマーカーを用いて個体が持つ遺伝子変異を決定するプロセスであるのに対し、シーケンスでは与えられたDN○セグメント内の正しい塩基配列を決定するプロセスであることです。

目次1. 概要と主な違い2. ジェノタイピングとは3. シーケンスとは4. 並べて比較：ジェノタイピングとシーケンス5. まとめ

ジェノタイピングは何ですか？

ジェノタイピングとは、DNA配列やマーカーを用いて個体の遺伝的構成を把握し、遺伝の比較・同定を行うことです。ジェノタイピングは、生物の進化生物学、集団生物学、分類学、生態学、遺伝学において重要である。DNAシークエンス、ポリメラーゼチェーン反応、制限断片長多型（RFLP）、ランダム増幅多型検出、増幅断片長多型（AFLP）、DNAマイクロアレイなどの手法で行うことができる。

ジェノタイピングでは、DNA配列の特定の小さなセグメントの配列を決定し、遺伝子マーカーを使用して、遺伝子組成と他の個体との相関を発見します。個人間または特定の対立遺伝子間の一塩基多型（snp）を決定するものである。ジェノタイピングは、ヒトを含む幅広い生物に適用可能です。また、ウイルスや菌類などの微生物にも適用可能で、参照プロファイルを用いた遺伝的変異の測定に利用できる。分子疫学や法微生物学において、病原体、特に微生物の制御は、ジェノタイピングによって得られる情報によって実現される。系図解析において、ジェノタイピングは非常に重要です。ヒトは遺伝子型を取って、母親と父親を特定します。ジェノタイピングにより、特定の形質を決定する遺伝子の優性・劣性対立遺伝子が明らかになります。

図1：RFLPジェノタイピング

シーケンシングは何ですか？

シーケンシングとは、与えられたDNAまたはRN**セグメントにおけるヌクレオチドの正しい順序を決定するプロセスである。生物の成長・発達に必要な情報は、事実上すべてゲノムにコード化されています。数百ヌクレオチド長の核酸断片を生成・分離する技術が利用可能になったことで、与えられたDNAやRN**セグメントの正確なヌクレオチド配列を決定する手順が開発された。現在、さまざまなタイプのシーケンサーが利用可能です。これらの配列決定法と、生物の全ゲノムを代表するゲノムライブラリーの構築技術を組み合わせることで、その生物の全ゲノムの配列決定が容易になり、遺伝子構造、遺伝子機能、遺伝子局在、遺伝子発現、遺伝子位置、遺伝子調節領域などの詳細な解析が可能となります。

多くのウイルス、数種のバクテリア、古細菌、酵母、その他いくつかの生物の全ゲノムが解読され、マッピングされています。ヒトゲノム・プロジェクトは、ヒトの全ゲノムの配列と地図を作成することを可能にし、2003年に最初のドラフトを発表しました。これは、生物学の進歩にとって重要な出来事であった。現在、ヒトゲノム配列は、希少疾患の遺伝的原因の究明、新生児の疾患リスクのスクリーニング、さまざまながんの遺伝的詳細の特定、新しい治療法の開発、新しい診断ツールの開発など、医療の現場で活用されています。

植物の世界では、イネゲノムとシロイヌナズナゲノムが解読されました。これらの配列を知ることで、細胞や生物の機能に対する理解が大きく変わることは間違いない。

図2：サンガーシーケンサーのX線オートラジオグラム

ジェノタイピングと順序制御の違い

概要 - ジェノタイピング vs. 順序制御

ジェノタイピングとシーケンシングは、生物の遺伝情報を調べるのに有効です。ジェノタイピングとは、個体間の遺伝子型の違いを判定し、そのクラスを見つける作業です。塩基配列の決定とは、目的のDNAの断片や領域に含まれるヌクレオチドの正しい順序を決定するプロセスである。遺伝子技術やゲノム技術は重要な情報を提供してくれます。

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