揺らぐとデジェネラシーの違い

振動と単純化の決定的な違いは、振動はmrnaとtrnaのコドンとアンチコドンの結合時に非ワトソンとクリックのペアリングを説明する仮説を指していることです。一方、コドンの単純化とは、複数のコドンから一つのアミノ酸を生成する能力のことである...。

振動と単純化の決定的な違いは、振動とは、mRNAとtRNAのコドンとアンチコドンの結合の際に、ワトソンとクリックのペアリングでないことを説明する仮説のことである。一方、コドンの単純化とは、複数のコドンから一つのアミノ酸を生成する能力のことである。

分子生物学の中心的な法則で、機能性タンパク質が発現する過程を説明しています。さらに、このプロセスは、遺伝物質のコピー、DNA配列のmRNA配列への転写、そしてmRNA配列のアミノ酸配列への翻訳という一連の異なるステップを経て行われます。

翻訳では、振動仮説とコドンの簡潔さの概念が重要な役割を果たす。オシレーションとは、1本のtRNAが複数のコドンを認識する能力のことである。コドン分解につながる。単純化とは、1つのアミノ酸が2つ以上のコドンで特定される現象のことである。つまり、1つのアミノ酸に対して複数のコドンが存在することを「単純化」という。

カタログ

1. 概要と主な違い 2. スイングとは 3. シンプレクスとは 4. スイングとシンプレクスの類似点 5. 並置比較 - スイングとシンプレクスの表形式 6. まとめ

揺ら揺らは何ですか？

振動仮説は、翻訳時に起こる非ワトソン・クリック塩基対を説明するための重要な仮説である。ここでいう翻訳とは、mRNAのコドンをアミノ酸配列に変換する分子プロセスのことである。この仮説によると、tRNAアンチコドンの1塩基目は、mRNA鎖のコドンの3塩基目と、ワトソンとクリックではないペアリング様式で対合することができる。従って、従来のアデニン-ウラシル結合やシトシン-グアニン結合のパターンには当てはまらない。アンチコドン塩基1、コドン塩基3のウィグルパターンとして知られている。

図01：振り子ベースのペアリング

振動するペアリングはアデニンとイノシンのペアリングを含み、ウラシルは含まない。ウラシルはアデニン、グアニン、イノシンと対になる。同様に、グアニンやシトシンはイノシンと対になることができます。このように、イノシンはtRNAの中でウォブル塩基対を起こす珍しい塩基なのです。

Wobbly塩基対結合は、必ずしもWatsonとCrickの相補的結合に従わないため、あまり強くありません。さらに、この概念は、遺伝暗号の劣化の原理を生み出す。

デジェネラシーは何ですか？

遺伝暗号の単純化とは、遺伝暗号の冗長性のことである。したがって、アミノ酸を指定するための塩基対の組み合わせは何通りもあり得る。一般に、生物のコドンは3つの塩基から構成されている。パーシモンという概念では、この3つの塩基の組み合わせは、同じアミノ酸を生成するにもかかわらず、変化する可能性があります。さらに、自然界に存在するアミノ酸は20種類しかないが、コドンは20種類以上ある。このように、特定のアミノ酸に対して複数のコドンが存在することは、パースィモンにて説明可能である。

図02：簡略化

単純化すると、3番目の塩基が2つのコドンの間で変化する可能性があります。したがって、グルタミン酸はコドンGAAとGAGで規定され、ロイシンはコドンUUA、UUG、CUU、CUC、CUA、CUGで規定される。

このように、突然変異率ではパーシモンという概念が非常に重要である。このため、ゲノムに発生した点突然変異は許容され、沈黙を保っているように見える。したがって、この種の点突然変異は、アミノ酸配列の変異や変化につながらない。しかし、点突然変異によってコードされるアミノ酸が変化すると、遺伝型や表現型に深刻な変化をもたらす可能性がある。

揺らぐとデジェネラシーの共通点

この2つは、翻訳プロセスにおける生命の中心的な法則を説明するために使われる重要な前提条件です。
さらに、3塩基のコドン語から20アミノ酸の配列に翻訳する際にも、この2つのプロセスが重要な役割を果たす。
これらのプロセスは、生物の進化パターンにも寄与しています。