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プロトプラストとキャプシドの大きな違いは、プロトプラストがオリゴマー蛋白質の構造単位であるのに対し、キャプシドはウイルスのキャプシドの構造サブユニットであることである。
ウイルスとは、細胞内に寄生する特殊な感染性粒子である。キャプシドは、ウイルス粒子の2つの主要な構成要素のうちの1つである。ウイルスのゲノムを包み込んで保護するタンパク質の殻である。キャプシドは、オリゴマー蛋白質の構造単位であるプロトプラストからなる。キャプシドの構造サブユニットであるカプソメアは、複数のプロトプラストが一体となった本体である**。このように、原形質が自己組織化してキャプシドを形成し、キャプシドが自己組織化してキャプシドを形成する。
1 概要と主な違い 2. プロトプラストとは 3.キャップソメアとは4.プロトプラストとキャップソメアの類似点5.プロトプラストとカプソメアの横並び比較表6.まとめ
プロトプラストは、オリゴマー蛋白質の構造単位である。プロトマーは少なくとも2種類のポリペプチド鎖を含む。より一般的には、複数のポリペプチドを含んでいる。ウイルスカプシドでは、プロトプラストが自己集合してカプレットを形成しており、これがカプシドの形態的な単位となっている。プロトプラストは、特異的な結合と自己組織化によって相互に結合している。
図01:プロトプラスト
タバコモザイクウイルスでは、プロトプラスト**が集まってダブルディスクを形成し、RNAゲノムを包んでいる。その結果、このタバコモザイクウイルスのプロトプラストは、やがて長く硬い中空チューブを形成し、螺旋状の外観を呈するようになる。20面体対称で、原形質**は5つか6つのキャプシドユニットになり、それが20の正三角形と20の頂点に合体する。
キャプシドベシクルは、ウイルスカプシドの構造タンパク質サブユニットである。また、ウイルスの形態的なサブユニットでもある。構造的には、キャプシドはキャプシド小胞の集合体である。各キャップソメアには複数のプロトプラストがあり、互いに自己集合している。さらに、カプシドに含まれる小胞がさまざまに配置され、ウイルスの殻の形状を提供している。そこで、ウイルスのキャプシドの配置として、ヘリックス、正20面体、複合体の3つがある。しかし、キャプシド小胞の配置は、特定のウイルスに特徴的である。カプシド小胞は、タンパク質の2コピーともう1コピーからなるカプシド間三重鎖によって相互接続されている。
図02:ソメア
また、それぞれのウイルスが持つカプシドの数には限りがある。B型肝炎ウイルスは、180個のカプシドを含む正20面体のカプシドを持っています。リコンビナント・アデノウイルスは、252個のカプシド小胞を含むカプシドを持っています。ヘルペスウイルスは162個のカプシドを持っている。また、エンテロウイルスはキャプシドを60個持っています。繰り返しになるが、ウイルスによってタンパク質の殻であるキャプシドの数は異なる。
エンベロープは、ウイルスの中でさまざまな機能を持っています。カプシドは、物理的、化学的、酵素的なダメージからウイルスのゲノムを保護する。また、カプシド小胞は宿主の細胞表面に容易に付着するため、ウイルスゲノムの宿主への導入に重要である。
原形質はオリゴマー蛋白質を形成する構造単位であり、キャプシド小胞はウイルスカプシドの形態単位である。これがプロトプラストとエンベロープの決定的な違いなんですね。また、プロトプラスト**はエンベロープを形成し、キャプシドベシクル**はキャプシドを形成する。
プロトプラストとカプソメアの違いをまとめたインフォグラフィックは以下の通りです。
プロトフィラメントは、ウイルスカプシドのタンパク質サブユニットである。したがって、キャプソミアはプロトフィラメントの**であり、キャプシドはキャプソマーの**である。プロトプラストやキャプシド小胞の配列は、特定のウイルスに形や対称性を与える。エンベロープの配置から、スピロヘータと正二十面体は、ウイルスに共通する形状または対称性である。そこで、本稿では、プロトプラストとエンベロープの違いについてまとめる。
1. "Clotheshell", Wikipedia, Wikimedia Foundation, 2019年9月3日, こちらから入手可能。