Rho依存性終結とRho非依存性終結の大きな違いは、Rho依存性終結ではRho因子が転写産物に結合し、鋳型と転写産物の間の水素結合を切断して転写を終結させるのに対し、Rho非依存性終結ではヘアピンループ構造を生成し、転写産物にUリッチ領域を書き込んで転写を終結させる点である。

転写は、遺伝子発現の2つの段階のうちの1つである。遺伝子のDNA配列に隠された遺伝情報から、一連のmRNAを生成する過程である。RNAポリメラーゼは、遺伝子のプロモーター配列に結合し、RNA鎖の合成を触媒として開始する。RNAポリメラーゼは、終止配列を見つける前に、ヌクレオチドを付加し、RNA鎖を構築する。原核生物では、Rho依存的な終結とRho非依存的な終結という2つの主要な終結戦略によって終結が行われる。Rho因子はレゾルバーゼ活性を持つタンパク質である。

カタログ

1. 概要と主な違い 2. Rho依存性ターミネーションとは 3. Rho非依存性ターミネーションとは 4. Rho依存性ターミネーションとRho非依存性ターミネーションの類似点 5. 横並び比較 - 表形式で表したRho関連とRho非依存のターミネーション 6. 要約

ロー依存型終端は何ですか？

Rho依存性終結は、原核生物で起こる2つの転写終結戦略のうちの1つで、Rho因子はレゾルバーゼ活性を持つタンパク質である。

図01：Rho関連端子

Rhoタンパク質はRNA転写産物に結合し、RNAポリメラーゼの5'-3'方向に移動して、DNA鋳型とRNA転写産物の間の水素結合の分離を促します。Rho因子が転写小胞に到達すると、DNA/RNAハイブリッドを引き離し、転写物を転写小胞から放出させる。そうすると、転写が終了してしまうのです。

rho独立終了は何ですか？

Rho非依存的な終結は、原核生物の転写終結の第二の戦略である。通常、終端領域は逆反復配列になっている。リバースリピート配列の後に、アデニンに富んだ領域（AAAA）がある。RNAポリメラーゼが前進すると、mRNAの配列が生成される。この2つの領域は逆方向の繰り返し配列領域で相補的であるため、水素結合によりヘアピンループ構造を形成している。次の地域は、ウランが豊富な地域となる。ヘアピン構造はRNAポリメラーゼの活性を停止させる。

図02：Rhoスタンドアロン端末

また、U-rich領域では、転写産物のU塩基と鋳型のA塩基との間に弱い相互作用が存在する。この弱いアデニン-ウラシル結合は、DNA鋳型とRNA転写体を不安定にし、互いに分離させる。最後に、転写産物は転写部位から解放される。

にゅうみんじゅうとrho独立終了の共通点

• 原核生物では、Rho依存性終結とRho非依存性終結の2つが主な終結戦略である。
• どちらの形態も転写物をDNA鋳型から放出し、転写を終了させる。

にゅうみんじゅうとrho独立終了の違い

Rho依存的な終結はRhoタンパク質が仲介し、Rho非依存的な終結はヘアピンループ構造の形成により達成される。これが、Rho依存型とRho非依存型の終端処理の重要な違いなんですね。さらに、Rhoタンパク質はATPエネルギーを利用するが、Rho非依存性終結はRhoタンパク質が関与せず、ATPエネルギーも利用しない。したがって、このこともRho依存的な終結とRho非依存的な終結の大きな違いである。

以下のインフォグラフィックは、Rho依存性終結とRho非依存性終結の違いの比較について詳しく示しています。

概要 - にゅうみんじゅう vs. rho独立終了

Rho依存性終結とRho非依存性終結は、原核生物における2つの主要な転写終結機構である。Rho依存性終結では、Rhoタンパク質が転写終結を担っている。一方、Rho非依存的な終結は、ヘアピンループ構造の形成によって起こる。これが、Rho依存型とRho非依存型の終端処理の重要な違いなんですね。

引用

1 "Stages of transcription," Khan Academy, available here."本源的終了" ウィキペディア、ウィキメディア財団、2019年2月8日、ここで入手可能。 2 "本源的終了" ウィキペディア、ウィキメディア財団、2019年2月8日。