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遺伝的距離と物理的距離の重要な違いは、同じ種の2つの集団間の距離を分析するために使用される配列の種類である。遺伝的距離は、種や集団間の遺伝的な違いを測定するもので、物理的距離は2つのマーカー間のヌクレオチドの数を測定するものである。
遺伝的・物理的距離は、ある種の2つの集団間の進化的関係を研究するための視点を提供するものである。したがって、距離地図は遺伝的データに基づいた集団のつながりを提供するものである。ゲノム配列の決定とバイオインフォマティクス解析は、遺伝的・物理的距離の決定に重要な役割を担っています。
1. 概要と主な違い 2. 遺伝的距離とは 3. 物理的距離とは 4. 遺伝的距離と物理的距離の類似点 5. 横並び比較-遺伝的距離と物理的距離の表形式 6. まとめ
遺伝的距離とは、種間や個体群間の遺伝的乖離を示す指標である。この距離は、先祖の関係や進化のパターンを使って測定されます。遺伝的距離の測定には、遺伝子間の類似性が重要である。また、遺伝的距離は、その種の祖先との距離を定義するものである。また、遺伝的距離の主な用途は、世界各地の集団間の関係性評価である。そのため、遺伝子のパターンに基づいて、世界中の人類種の人口***を関連付ける。
遺伝的距離は、種や集団全体の遺伝的な類似性を見つけることで算出されます。したがって、バイオインフォマティクスは、異なる種や集団間の遺伝的距離を決定する上で重要な役割を担っています。
また、集団間の遺伝的距離を表すモデルも様々である。Neiの遺伝的距離、Cavalli-SforzaとEdwardsの尺度、Reynolds、WeirとCockerhamの遺伝的距離などである。
物理的距離とは、2つの種または個体群の間のヌクレオチドの数を示す尺度である。そのため、物理的な距離を計算する場合、測定レベルはさらに個人レベルまで踏み込みます。これは、個々のヌクレオチド配列またはゲノム全体を分析するものである。マーカー遺伝子間の物理的距離は、遺伝子間のヌクレオチド数を決定する上で重要な役割を果たす。
したがって、2つの集団間の物理的距離が長くなれば、遺伝的距離も長くなる。その結果、生物の複雑さが増していくのです。遺伝的距離と物理的距離を合わせて、2つの集団の進化的関係を構成する。
遺伝的距離と物理的距離の重要な違いは、距離マップを導き出すために使用される配列の種類による。遺伝的距離とは、2つの集団間の遺伝的差異に関する距離であり、物理的距離とは2つの集団間のヌクレオチド距離のことである。
遺伝的距離と物理的距離の違いについては、以下のインフォグラフィックで詳しく解説しています。
遺伝的距離も物理的距離も、ある種の2つの集団間の進化的・祖先的な関係を意味している。したがって、進化の距離について結論を出すには、どちらも重要である。遺伝的距離とは、特定の遺伝マーカーに対する2つの集団間の距離であり、物理的距離とは、選択されたマーカー遺伝子の両側にある塩基配列間の距離のことである。したがって、これが遺伝的距離と物理的距離の重要な違いである。
1 Beaumont, Mark A. et al."Measuring Genetic Distances", Springer, Dordrecht, 1998年1月1日, ここで入手できます。"遺伝学における物理的距離"Elibrary, available here.2 "Physical Distances in Genetics" Elibrary.