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ハプロタイプとの大きな違いは、ハプロタイプが共通の祖先を持つ類似のハプロタイプの集合であるのに対し、ハプロタイプは遺伝的連鎖により世代を超えて受け継がれる対立遺伝子の集合であることである。
遺伝子は主に2つの対立遺伝子から構成されています。染色体には何千もの遺伝子が存在します。分離するときは、プロミスキューティと遺伝子組み換えを示す。しかし、中には対立遺伝子が非常に近接している遺伝子もあります。簡単に言えば、これらの対立遺伝子は遺伝的連鎖を示す。その結果、クロスオーバーや組み換えが起こりにくい。その代わり、常に世代から世代へと伝えられる傾向があります。したがって、ハプロタイプとは、同じ染色体上の対立遺伝子あるいは一塩基多型の組み合わせであり、同じ二親の世代で共有されるものである。ハプロタイプクラスターは、共通の祖先を持つ類似のハプロタイプのグループである。
1. 概要と主な違い 2. ハプロタイプとは 3. ハプロタイプとは 4. ハプロタイプとハプロタイプの類似性 5. 横並び比較-表形式でのハプロタイプとハプロタイプ 6. まとめ
ハプロタイプクラスターは、共通の祖先を持つ類似のハプロタイプのグループである。つまり、ハプロタイプ群とは、異なる染色体上に存在する対立遺伝子の組み合わせで、一緒に遺伝するものである。これらの対立遺伝子は互いに非常に接近している。ハプロタイプ群に含まれるハプロタイプは、共通の祖先を持つため、類似したパターンを持ち、関連した子孫を残すことができます。したがって、ハプロタイプからハプロタイプグループを予測することは容易である。
図01:ハプロタイプ群
ヒトのハプロタイプには、最も一般的な2つのタイプがある。父から子へ受け継がれるY染色体ハプロタイプと、母から娘または息子へ受け継がれるミトコンドリアDNAハプロタイプである。
ハプロタイプとは、一緒に遺伝する対立遺伝子のグループのことである。これらの対立遺伝子は同じ染色体上に存在し、遺伝的連鎖により互いに非常に近い位置にある。したがって、組換えや交叉の可能性がないのです。そのため、世代から世代へと受け継がれていくのです。これらの対立遺伝子は、単一の遺伝子の対立遺伝子である場合もあれば、複数の遺伝子の対立遺伝子である場合もあります。また、ハプロタイプとは、同じ染色体上の一塩基多型の集合を指すこともある。したがって、これらは遺伝性のDNA変異体または多型の集合体である。
図02:一塩基多型(Single Nucleotide Polymorphism
ハプロタイプの情報は、遺伝子が病気に及ぼす影響を調べるのに有効である。ハプロタイプとハプロタイプツリーを分析することで、遺伝学者は疾患と関連するゲノム領域を検出し、疾患と関連する遺伝的変異のパターンを特定することができます。また、遺伝子マーカーを染色体上の正しい位置に配置することで、遺伝子をマッピングする際にも有効である。
ハプロタイプとは、異なる染色体上に存在する対立遺伝子の組み合わせのことである。同じ祖先の類似したハプロタイプから構成されている。同じ世代の対立遺伝子は、同じ染色体上に存在します。これが、ハプロタイプとの決定的な違いなんですね。
以下のインフォグラフィックは、ハプロタイプとの違いをまとめたものです。
ハプロタイプクラスターは、共通の祖先を持つ類似のハプロタイプのグループである。一方、ハプロタイプとは、同一染色体上の対立遺伝子、すなわち一塩基多型の組み合わせであり、これらのハプロタイプは片方の親から受け継がれる。したがって、これがハプロタイプとの重要な違いである。ハプロタイプは類似したハプロタイプから構成されるため、ハプロタイプ群を予測するための簡便な方法を提供する。
1 "ハプロタイプ "のこと。Genome.gov, available here. 2 "Haplogroup," Wikipedia, Wikimedia Foundation, 8 July 2019, available here. 2 "Haplogroup," Wikipedia, Wikimediaメディア財団、2019年7月8日。