モチーフと領域の違い

モチーフとドメインの大きな違いは、モチーフが独立した安定性を持たないのに対して、ドメインは...

モチーフとドメインの大きな違いは、モチーフは独立して安定しないのに対して、ドメインは独立して安定することです。

タンパク質は、人体における重要な生体高分子である。一方、タンパク質のアミノ酸配列は、遺伝子の遺伝暗号によって決定されます。また、タンパク質には一次構造、二次構造、三次構造があります。一次構造とは、ポリペプチド鎖のアミノ酸配列のことである。ポリペプチド鎖が折り重なることで、タンパク質の二次構造が形成される。αヘリックス、βシート、超二次構造などが二次構造に属する。ある種の超二次要素は、タンパク質のモチーフとして知られています。タンパク質の三次構造は、タンパク質の機能を決定する三次元構造である。構造ドメインとは、タンパク質分子の折り畳まれた部分のことで、球状をしており、離散的な機能を持っている。タンパク質の基本的な機能と三次元構造のことである。

カタログ

1. 概要と主な違い 2. 親トピックとは 3. ドメインとは 4. 親トピックとドメインの類似点 5. 横並びの比較 - 表形式でのモチーフとドメイン 6. まとめ

動機（モティーフ）は何ですか？

モチーフとは、αヘリックスやβ構造など、タンパク質の超2次要素群のことである。これは、さまざまなタンパク質に存在する特定のパターンです。モチーフは、二次構造要素の折り畳みパターンとその相互作用を記述する。これらの折り畳みパターンは、3次構造に存在する同様の接続によって安定化されている。しかし、3次構造ほど複雑ではない。

図01：テーマ

タンパク質の二次構造の単純な組み合わせである。親構造そのものが安定していない。また、モジュロはタンパク質の構造を説明することはできても、タンパク質の機能を予測することはできない。タンパク質のモチーフの例としては、β-α-βモチーフ、ギリシャ結合モチーフ、β-バレルモチーフ、β-カーブモチーフなどがある。

ドメインは何ですか？

構造ドメインは、タンパク質の基本的、機能的、三次元的な単位である。特定の機能を果たすものです。タンパク質は、いくつかの異なる構造ドメインを持つことができます。各ドメインは独立した単位です。球状構造になっています。特定の機能または相互作用を担当する。構造ドメインは、特徴を持たないタンパク質の機能仮説を立てるために使われることがあります。タンパク質を分析する際、構造ドメインがタンパク質の機能単位であることを考慮することが重要である。

図02：ピルビン酸キナーゼの3つの異なる構造ドメイン

ドメインは非常に安定したコンパクトな構造です。他のドメインと容易に区別できる。ピルビン酸キナーゼには、図02に示すように、3種類の構造ドメインがある。構造ドメインの長さは様々で、平均100アミノ酸の長さである。各構造ドメインには、二次構造単位からなる疎水性の核が存在する。いくつかの構造ドメインが一緒になって、タンパク質の三次構造を形成している。

モチーフと領域の共通点

モジュールや構造ドメインは、タンパク質分子そのものの単位である。
タンパク質のファミリーを分類する際に有用である。