ターゲットプロテオミクスとアンターゲットプロテオミクスの大きな違いは、ターゲットプロテオミクスが特定のタンパク質の存在量の測定を目的としているのに対し、アンターゲットプロテオミクスは特定のタンパク質をターゲットとしていないことである。

プロテオミクスは、タンパク質とその構造や機能を大規模に研究する学問である。特定の条件下で、細胞、組織、生物に含まれるタンパク質の全体像を研究するものです。プロテオミクスには、ターゲットプロテオミクスとアンターゲットプロテオミクスという2つのタイプがあります。

内容

1 概要と主な違い 2. ターゲットプロテオミクスとは 3. アンターゲットプロテオミクスとは 4. ターゲットプロテオミクスとアンターゲットプロテオミクスの類似点 5. ターゲットとアンターゲットを表形式で比較する 6.概要

ターゲットプロテオミクスは何ですか？

ターゲットプロテオミクスは、その名の通り、タンパク質混合物中の特定のタンパク質やペプチドを解析の対象とするものです。そして、あらかじめ選択された特定のタンパク質の存在と量を分析する。この方法は、1つの試料または複数の試料にのみ適用されます。この方法は、特定のプロテオームへの適用も可能です。より正確で定量的、かつ繊細なデータが得られます。また、質量分析とターゲットプロテオミクスを組み合わせることで、より正確で信頼性の高い測定が可能になります。分析にはトリプル四重極型質量分析計（QQQ）を使用します。

図01：プロテオミクス

ターゲットプロテオミクスは、ノックダウンした標的が実際にノックダウンされているかどうかを確認したい場合や、血清、脳脊髄液、細胞内ライセートなどの特定のタンパク質/ペプチドを定量したい場合に適した方法です。また、サンプル間やタイムコース実験で特定のタンパク質が差分的に発現しているかどうかを確認したい場合にも使用できます。

アンターゲットプロテオミクスは何ですか？

ノンターゲットプロテオミクスは、その名の通り、特定のタンパク質やペプチドを解析の対象としないものである。ディスカバリープロテオミクスは、ノンターゲットプロテオミクスの別称である。むしろ、より "グローバル "な分析である。一般に、アンターゲットプロテオミクスは、"このサンプルにはどんなタンパク質が含まれているのか？"という疑問に答えるために行われます。.この方法は、標的プロテオミクスほど高感度ではありません。しかし、新規のタンパク質を含む多くのタンパク質を同定・測定することができます。ノンターゲットプロテオミクスは、定量的な測定と定性的な測定の両方を行うことができます。

的を射たとアンターゲットプロテオミクスの共通点

• ターゲットプロテオミクスとアンターゲットプロテオミクスは、どちらも試料中のタンパク質を測定するものです。
• プロテオミクス解析において重要な役割を担っています。
• これらの方法は、質量分析法を用いています。

的を射たとアンターゲットプロテオミクスの違い

まず、ターゲットプロテオミクスとは、特定のタンパク質やペプチドを含む複雑なタンパク質混合物**の存在と量を決定することである。一方、ノンターゲットプロテオミクスは、特定のタンパク質をターゲットとせず、試料中に存在するタンパク質を定量的・定性的に調べるものである。ターゲットプロテオミクスは、あらかじめ選択されたタンパク質や標的タンパク質を用いて行われるのに対し、ノンターゲットプロテオミクスは、試料中にどのようなタンパク質が存在するかを調べるものである。また、ターゲットプロテオミクスは、ノンターゲットプロテオミクスよりも感度が高い。

概要 - 的を射た vs. アンターゲットプロテオミクス

要約すると、プロテオミクスにはターゲットとアンターゲットの2種類があり、ターゲットとアンターゲットは、タンパク質研究の2つのタイプである。ターゲットプロテオミクスはその名の通り、特定のタンパク質をターゲットとするのに対し、ノンターゲットプロテオミクスは特定のタンパク質をターゲットとしない。これが、ターゲットプロテオミクスとノンターゲットプロテオミクスの違いである。

引用

1 "Targeted Proteomics", UC Davis Proteomics Core, available here."プロテオミクス/プロテオミクス入門"、音楽理論/モデルウィキブックス、オープンワールドオープンブックス、こちらで購入できます。 2 "プロテオミクス/プロテオミクス入門"、音楽理論/モデルウィキブックス、オープンワールドオープンブックス、こちらで購入できます。書籍のご紹介です。