分子對接(molecular docking)和得分(scoring)的區別

分子對接和計分的關鍵區別在於，對接是一種用於確定兩個分子之間結合親和力的技術，而計分是通過計算分子間有利相互作用的數量來評估特定姿勢的過程。

分子對接和計分這兩個術語在分子模擬領域被使用。分子模擬是一種用來確定不同分子在給定物質中可能排列的技術。這項技術在創造新的穩定化合物方面很重要。

什麼是分子對接(molecular docking)？

分子對接是對一個候選配體與受體結合的計算模擬。這種方法預測了一個分子與另一個分子結合形成穩定絡合物時的擇優取向。這項技術的結果可以用來預測兩個分子之間的結合強度或結合親和力。在這裡，分子計分功能也很重要。

圖01：顯示生物系統中分子相互作用過程的簡單圖表

一般來說，這項技術考慮到生物相關的分子，如蛋白質、肽、核酸、碳水化合物和脂類。這些分子非常重要，在我們體內的信號轉導機制中起著重要作用。因此，這兩個分子的方向，這兩個將要結合的信號轉導過程，影響了在此產生的信號類型。這意味著，分子對接在決定生物系統中信號傳導過程中產生的信號強度和類型方面都很重要。

此外，分子對接技術在設計基於結構的藥物時非常重要。這是因為它可以預測小分子如配體與合適的結合位點的構象。

分子評分是評價分子對接過程的一種數學函數。在計算化學領域，評分函數用於預測兩個分子對接後的結合親和力。例如，如果我們有一個微粒藥物的小分子，並且有一個生物靶點，例如蛋白質，我們可以評估藥物對結合位點的親和力。此外，分子計分可以用來預測兩個蛋白質之間或一個蛋白質與DNA分子之間的分子間相互作用。

圖02：評分函數簡介

分子計分技術主要應用於藥物設計過程，如虛擬篩選、從頭設計、先導優化等。

分子對接和評分在分子模擬中非常重要。分子對接和計分的關鍵區別在於，對接是一種用於確定兩個分子之間結合親和力的技術，而計分是通過計算分子間有利相互作用的數量來評估特定姿勢的過程。

下面的信息圖總結了分子對接和評分之間的區別。

分子對接(molecular docking)和得分(scoring)的區別

分子對接和評分在分子模擬中具有重要意義。分子對接與評分的關鍵區別在於對接是一種用於確定兩個分子之間結合親和力的技術，而評分是通過計算有利分子間相互作用的數量來評估特定姿勢的過程。

1“對接（分子）。”對接（分子）–概述|科學直接主題，
2達爾，阿亞茲·馬哈茂德。“分子對接：方法、類型、應用和基本挑戰”，《經濟學國際》，經濟學國際，2017年3月27日，