衣原体治疗通常包括使用几种不同类型抗生素中的一种。虽然抗生素治疗通常足以治疗衣原体，但重要的是，受感染的个体在治疗过程结束之前不要进行性活动，其受感染的一方或多方同样接受衣原体治疗。如果不遵守这一方案，衣原体可能再次感染，需要感染者再次接受抗生素治疗。在大多数情况下，衣原体可以用短期甚至一剂抗生素治疗，但在严重情况下，个人可能需要静脉注射抗生素。如果一名妇女的生殖系统因衣原体感染而受到损害，衣原体治疗的一部分可能包括手术恢复她的生育能力。

衣原体检测是一种性传播感染，在许多地方都是常规做法。在美国，疾病控制中心（CDC）通常建议对所有孕妇以及25岁以下的所有性活跃妇女进行衣原体筛查。对于有多个性伴侣或有任何衣原体常见症状的人，也建议进行检测。虽然衣原体通常无症状，但衣原体的早期症状可能包括性交或排尿时的灼热感以及阴道或阴茎分泌物。在某些晚期衣原体感染病例中，女性可能会经历骨盆疼痛，并可能最终因衣原体感染而不育。

如果个人怀疑她可能患有衣原体，她应该立即联系医疗专业人员进行检测并开始衣原体治疗。处方抗生素的类型取决于几个因素，包括患者是否怀孕。用于治疗衣原体的常用抗生素包括强力霉素、阿奇霉素或红霉素。虽然阿奇霉素通常只开一剂，但其他抗生素需要更长的疗程。接受抗生素衣原体治疗的个人应完成抗生素疗程。

一旦衣原体治疗完成，患者应在三个月内返回其医疗专业人员进行后续检测。患者还应告知其所有性伴侣，以便他们自己能够接受衣原体检测和治疗。那些接受过衣原体治疗的人如果与同样感染衣原体的人发生性关系，可能会再次感染衣原体。为了防止衣原体进一步感染，个人可以使用乳胶避孕套，也可以将性活动限制在一夫一妻制关系。