主要區別
原子是一種元素中最小的粒子，它可能獨立存在，也可能不獨立存在；它的化學性質與元素相似。另一方面，這個分子是由另外兩個原子透過化學鍵結合在一起組成的。分子可以以自由狀態存在，並且可以進一步分成由它們組成的原子。例如，水分子由兩個氫原子和一個氧原子結合而成。水分子在分裂時分裂成氫和氧的組成原子。
比較圖
什麼是分子(molecules)？
分子是物質的小單位，它總是以自由狀態存在。它由兩個或兩個以上相似或不同的原子組成。分子的形成涉及到它們之間的化學鍵合。形成分子的鍵有幾種型別；單鍵、雙鍵和三鍵是原子透過化學鍵結合在一起的型別。分子可以進一步分成單個原子。儘管與原子相比，分子是更大的粒子，但肉眼還是看不見它們。像放大顯微鏡這樣的科學裝置被用來觀察分子。分子不僅僅是單位，它們還描述物體的設定和物理狀態。固體是絕對形狀的，因為沒有太大的空間讓分子自由移動，所以被認為是緊密堆積的分子。另一方面，液體在分子之間有自由空間，並且不那麼緊密地堆積，這就導致了液體可以形成任何被注入物體的形狀的物理狀態。在氣態下，分子足夠自由漂浮而不發生碰撞。我們知道分子是原子的結合體，對相同和不同原子結合的誤解一直存在。當相同的原子結合形成分子時，它被稱為元素的分子。與此相反，當不同元素的原子結合形成自由存在的分子時，它被稱為化合物的分子。
什麼是原子(atoms)？
原子是單位中最小的粒子，可以獨立存在，也可以不獨立存在；每個原子都具有與其元素相似的性質。它不能進一步分為亞原子粒子。在這裡提到原子是生物體細胞的組成部分，宇宙中的一切都是由這些原子組成的。原子結合形成分子的比例很重要，就像它的不同可以產生不同的分子一樣。僅僅是原子數量的變化就可以產生完全不同的分子。例如，兩個氧原子結合形成氧分子，而當三個氧原子結合時，形成臭氧。原子不能透過顯微鏡或肉眼看到；它太小了，不能再分成它所組成的粒子。原子核是原子的中心部分，原子中間有質子和中子。質子帶正電荷，而中子不帶電荷。電子是原子的另一個重要粒子，帶負電，它繞著原子核旋轉。質子和中子是由夸克和膠子等化學成分組成的，在化學中沒有太多的描述。
分子(molecules) vs. 原子(atoms)
- 原子是元素中最小的粒子，可以獨立存在也可以不獨立存在。另一方面，分子是化合物中最小的基本單位，總是以自由狀態存在。
- 原子由亞原子粒子組成，如中子、質子和電子。與此相反，分子由兩個或兩個以上的原子組成。
- 原子是球形的，而分子則是角的、線性的或矩形的。
- 分子是在化學鍵抓住原子後形成的。化學鍵可以有各種型別，單鍵、雙鍵或三鍵。
