主要區別
原核染色體與真核染色體的主要區別在於，原核染色體存在於細胞的細胞質中，體積較短，含有環狀DNA分子，而真核染色體則存在於細胞核中，大小較長，具有線形DNA結構。
原核染色體(prokaryotic chromosomes) vs. 真核染色體(eukaryotic chromosomes)
原核染色體是指在原核生物中發現的雙鏈環狀DNA結構的染色體。真核生物染色體是存在於真核生物中的染色體，具有長鏈DNA，即含有遺傳資訊的線性形式。原核染色體存在於原核生物開放的細胞質中，而真核染色體存在於細胞核中。
原核生物染色體是單倍體的，即它們的基因組在細胞中單獨存在，沒有任何同源染色體；然而，真核生物染色體是二倍體的，即它們與細胞中的同源染色體成對出現。原核染色體存在於細胞質中，直接與細胞質接觸，從內部附著在細胞質上，而真核染色體則與細胞質沒有接觸，因為它們存在於細胞核中。
在原核染色體中，基因自身組織成操縱子，然而在真核染色體中，這些基因是作為單一結構來調節的。原核染色體導致只有少數蛋白質在編碼時帶有它們的資訊。真核生物染色體透過基因上攜帶的資訊來編碼或編碼更大的蛋白質。原核染色體透過水平基因轉移進行遺傳重組，而真核染色體則透過配子融合和減數分裂進行遺傳重組。
原核染色體與幫助自身包裝的類核仁相關蛋白結合，而真核染色體與核仁相關蛋白不相關；相反，它們透過與組蛋白結合形成被稱為核小體的特殊結構。原核染色體的結構也因端粒和著絲粒的存在而不同，因為它們是短而圓的DNA鏈；然而，真核染色體有端粒，端粒是每條染色體的末端，著絲粒是兩個染色單體的連線點。
原核生物染色體只是單獨存在，沒有成對存在，構成了生物體的全部遺傳資訊，但是真核生物染色體是成對存在的，並且在每個真核生物物種中有多個染色體是不同的。原核生物染色體的結構各不相同，因為它們的大小很短，DNA鏈是圓形的，而真核生物的染色體則是長的，並且有線性的DNA鏈。原核染色體在細胞分裂初期複製形成姐妹染色單體，而真核細胞染色體在進入細胞週期S期時複製。
比較圖
什麼是原核染色體(the prokaryotic chromosomes)？
原核染色體是在原核生物中發現的雙鏈環狀DNA結構的染色體。它們存在於原核細胞開放的細胞質中，與細胞質直接接觸，並從內部附著在細胞質上。這些染色體是單倍體的，也就是說，它們的基因組在細胞中是獨一無二的，沒有任何同源染色體。這就是為什麼這些染色體是單獨發現的，沒有配對，構成了整個有機體的遺傳資訊。
原核細胞染色體的結構也不同，因為它們的大小很短，而且有環狀的DNA鏈。它們既沒有端粒也沒有著絲粒，因為它們體積小，是環狀DNA鏈。這些染色體上的基因將自身組織成操縱子，僅能編碼少數蛋白質，而這些資訊則存在於它們的結構中。它們還與核仁相關的蛋白質結合，幫助它們自己組裝結構。
原核染色體透過水平基因轉移進行遺傳重組，並在細胞分裂開始時經歷複製過程，形成姐妹染色單體。
什麼是真核生物染色體(the eukaryotic chromosomes)？
真核生物染色體是真核生物中由較長的DNA鏈組成的染色體。這些染色體存在於這些生物體細胞的線性結構中。與原核染色體不同的是，這些染色體存在於細胞核中，與細胞質沒有接觸。這些是奇異的線性結構，包含蛋白質編碼的資訊，即生物體的遺傳資訊。這些染色體導致較大蛋白質的編碼。
真核生物染色體有端粒和著絲粒。這些端粒是每條染色體的終點，著絲粒是染色體上比其他染色體更密集的地方，它充當兩個染色單體的附著點。這些染色體是成對的，並且在每一個真核生物物種中有幾個不同的染色體。這就是為什麼我們知道它是二倍體。
真核生物染色體不與核仁相關蛋白結合，而是透過與組蛋白結合形成核小體的特殊結構。它們透過配子融合和減數分裂進行基因重組，並在進入細胞週期S期時進行復制，這與原核染色體在細胞週期開始時經歷的不同。
主要區別
- 原核染色體存在於原核生物中，呈雙鏈DNA結構，而真核生物染色體則存在於真核生物中，並且有長鏈DNA。
- 原核生物染色體奇異地出現；另一方面，真核生物的染色體數量更大。
- 原核染色體存在於開放的細胞質中；相反，真核染色體存在於細胞核內。
- 原核染色體是單倍體的，沒有同源染色體；然而，真核細胞染色體成對出現時是二倍體。
- 原核染色體與細胞質直接接觸，而真核染色體則與細胞質不接觸。
- 原核細胞染色體短且有環狀DNA鏈，但真核細胞染色體長且有線狀DNA鏈。
- 原核染色體不具有端粒和著絲粒的結構，相反，真核染色體有端粒和著絲粒。
- 原核生物染色體與核仁相關蛋白相關；另一方面，真核生物染色體與核仁相關蛋白不相關；相反，它們透過與組蛋白結合而形成核小體。
- 原核細胞染色體在細胞分裂初期複製，而真核細胞染色體則在進入細胞週期S期時複製。
- 原核染色體基因自身組織成操縱子，而在真核細胞染色體中，這些基因是作為單一結構來調節的。
- 原核染色體只編碼少數蛋白質，而真核染色體則編碼較大的蛋白質。
- 原核染色體透過水平基因轉移進行遺傳重組，而真核染色體則透過配子融合和減數分裂進行遺傳重組。
結論
原核染色體存在於細胞的細胞質中，具有短而圓的DNA結構，每個染色體具有單一的複製起源；而真核染色體存在於細胞核中，較長，具有線性DNA結構，具有多重複制來源。
