主要区别
原核染色体与真核染色体的主要区别在于，原核染色体存在于细胞的细胞质中，体积较短，含有环状DNA分子，而真核染色体则存在于细胞核中，大小较长，具有线形DNA结构。
原核染色体(prokaryotic chromosomes) vs. 真核染色体(eukaryotic chromosomes)
原核染色体是指在原核生物中发现的双链环状DNA结构的染色体。真核生物染色体是存在于真核生物中的染色体，具有长链DNA，即含有遗传信息的线性形式。原核染色体存在于原核生物开放的细胞质中，而真核染色体存在于细胞核中。
原核生物染色体是单倍体的，即它们的基因组在细胞中单独存在，没有任何同源染色体；然而，真核生物染色体是二倍体的，即它们与细胞中的同源染色体成对出现。原核染色体存在于细胞质中，直接与细胞质接触，从内部附着在细胞质上，而真核染色体则与细胞质没有接触，因为它们存在于细胞核中。
在原核染色体中，基因自身组织成操纵子，然而在真核染色体中，这些基因是作为单一结构来调节的。原核染色体导致只有少数蛋白质在编码时带有它们的信息。真核生物染色体通过基因上携带的信息来编码或编码更大的蛋白质。原核染色体通过水平基因转移进行遗传重组，而真核染色体则通过配子融合和减数分裂进行遗传重组。
原核染色体与帮助自身包装的类核仁相关蛋白结合，而真核染色体与核仁相关蛋白不相关；相反，它们通过与组蛋白结合形成被称为核小体的特殊结构。原核染色体的结构也因端粒和着丝粒的存在而不同，因为它们是短而圆的DNA链；然而，真核染色体有端粒，端粒是每条染色体的末端，着丝粒是两个染色单体的连接点。
原核生物染色体只是单独存在，没有成对存在，构成了生物体的全部遗传信息，但是真核生物染色体是成对存在的，并且在每个真核生物物种中有多个染色体是不同的。原核生物染色体的结构各不相同，因为它们的大小很短，DNA链是圆形的，而真核生物的染色体则是长的，并且有线性的DNA链。原核染色体在细胞分裂初期复制形成姐妹染色单体，而真核细胞染色体在进入细胞周期S期时复制。
比较图
什么是原核染色体(the prokaryotic chromosomes)？
原核染色体是在原核生物中发现的双链环状DNA结构的染色体。它们存在于原核细胞开放的细胞质中，与细胞质直接接触，并从内部附着在细胞质上。这些染色体是单倍体的，也就是说，它们的基因组在细胞中是独一无二的，没有任何同源染色体。这就是为什么这些染色体是单独发现的，没有配对，构成了整个有机体的遗传信息。
原核细胞染色体的结构也不同，因为它们的大小很短，而且有环状的DNA链。它们既没有端粒也没有着丝粒，因为它们体积小，是环状DNA链。这些染色体上的基因将自身组织成操纵子，仅能编码少数蛋白质，而这些信息则存在于它们的结构中。它们还与核仁相关的蛋白质结合，帮助它们自己组装结构。
原核染色体通过水平基因转移进行遗传重组，并在细胞分裂开始时经历复制过程，形成姐妹染色单体。
什么是真核生物染色体(the eukaryotic chromosomes)？
真核生物染色体是真核生物中由较长的DNA链组成的染色体。这些染色体存在于这些生物体细胞的线性结构中。与原核染色体不同的是，这些染色体存在于细胞核中，与细胞质没有接触。这些是奇异的线性结构，包含蛋白质编码的信息，即生物体的遗传信息。这些染色体导致较大蛋白质的编码。
真核生物染色体有端粒和着丝粒。这些端粒是每条染色体的终点，着丝粒是染色体上比其他染色体更密集的地方，它充当两个染色单体的附着点。这些染色体是成对的，并且在每一个真核生物物种中有几个不同的染色体。这就是为什么我们知道它是二倍体。
真核生物染色体不与核仁相关蛋白结合，而是通过与组蛋白结合形成核小体的特殊结构。它们通过配子融合和减数分裂进行基因重组，并在进入细胞周期S期时进行复制，这与原核染色体在细胞周期开始时经历的不同。
主要区别
- 原核染色体存在于原核生物中，呈双链DNA结构，而真核生物染色体则存在于真核生物中，并且有长链DNA。
- 原核生物染色体奇异地出现；另一方面，真核生物的染色体数量更大。
- 原核染色体存在于开放的细胞质中；相反，真核染色体存在于细胞核内。
- 原核染色体是单倍体的，没有同源染色体；然而，真核细胞染色体成对出现时是二倍体。
- 原核染色体与细胞质直接接触，而真核染色体则与细胞质不接触。
- 原核细胞染色体短且有环状DNA链，但真核细胞染色体长且有线状DNA链。
- 原核染色体不具有端粒和着丝粒的结构，相反，真核染色体有端粒和着丝粒。
- 原核生物染色体与核仁相关蛋白相关；另一方面，真核生物染色体与核仁相关蛋白不相关；相反，它们通过与组蛋白结合而形成核小体。
- 原核细胞染色体在细胞分裂初期复制，而真核细胞染色体则在进入细胞周期S期时复制。
- 原核染色体基因自身组织成操纵子，而在真核细胞染色体中，这些基因是作为单一结构来调节的。
- 原核染色体只编码少数蛋白质，而真核染色体则编码较大的蛋白质。
- 原核染色体通过水平基因转移进行遗传重组，而真核染色体则通过配子融合和减数分裂进行遗传重组。
结论
原核染色体存在于细胞的细胞质中，具有短而圆的DNA结构，每个染色体具有单一的复制起源；而真核染色体存在于细胞核中，较长，具有线性DNA结构，具有多重复制来源。
