基底切除修复术(base excision repair)和核苷酸切除修复(nucleotide excision repair)的区别
DNA经常受到各种内外因素的破坏。然而,细胞修复系统会在损伤发生突变或转移到下一代之前立即并不断地纠正损伤。细胞内有三种类型的切除修复系统:核苷酸切除修复(NER)、碱基切除修复(BER)和DNA错配修复(MMR)修复单链DNA损伤。碱基切除修复和核苷酸切除修复的关键区别在于,碱基切除修复是一个简单的修复系统,它在细胞内修复内源性单核苷酸损伤,而核苷酸切除修复是一个复杂的修复系统,在细胞内起到修复的作用相对较大,外来引起的受损区域。
内容1。概述和主要区别2。什么是基底切除修复术3。什么是核苷酸切除修复。并列比较——碱基切除修复与核苷酸切除修复5。摘要
什么是基底切除修复术(base excision repair)?
碱基切除修复是最简单的DNA修复系统。它被用来修复DNA的轻微损伤。DNA碱基由于脱氨或烷基化而被修饰。当有碱基损伤时,DNA糖基化酶识别并激活碱基切除修复系统,并借助AP内切酶、DNA聚合酶和DNA连接酶进行修复。误码率系统包括以下几个步骤。
- 缺失碱基或缺失碱基,造成DNA缺失。
- 无嘌呤/无嘧啶核酸内切酶切基底部
- 用裂解酶或磷酸二酯酶除去剩余的糖碎片
- 用DNA聚合酶填充缝隙
- 用DNA连接酶封闭伤口
什么是核苷酸切除修复(nucleotide excision repair)?
核苷酸切除修复是细胞内重要的DNA切除修复系统。它能够修复和更换受损区域,长度可达30个底座,并且由未损坏的模板钢绞线引导。常见的DNA损伤是由紫外线辐射引起的,而NER通过在DNA发生突变并遗传给后代或引起疾病之前修复这些损伤来保护DNA。内质网特别提供保护,防止由环境和化学致癌物等外源因素间接引起的突变。几乎所有的生物体都能看到内质网,它能识别导致DNA螺旋严重扭曲的损伤。
内质网过程涉及许多蛋白质的作用,如XPA、XPB、XPC、XPD、XPE、XPF、XPG、CSA、CSB等,并通过多种剪切-粘贴机制进行。这些蛋白质是完成修复过程所必需的,其中一种内质网蛋白的缺陷是至关重要的,并可导致罕见的隐性综合征:色素性干皮病(XP)、Cockayne综合征(CS)和光敏感型发质营养不良症(TTD)。
基底切除修复术(base excision repair)和核苷酸切除修复(nucleotide excision repair)的区别
碱基切除修复与核苷酸切除修复 | |
基底切除修复(BER)是一种发生在细胞内的DNA修复系统。 | 核苷酸切除修复(NER)是另一种在细胞中发现的DNA修复系统。 |
识别DNA加合物 | |
BER修复小DNA加合物的损伤。 | 内切除菌修复大的DNA加合物。 |
DNA损伤 | |
BER识别不会对DNA螺旋造成重大扭曲的损伤。 | NER识别导致DNA螺旋显著扭曲的损伤。 |
DNA损伤原因 | |
BER修复内源性诱变引起的损伤。 | NER修复外源诱变引起的损伤。 |
复杂性 | |
BER是最不复杂的维修系统 | 它比BER复杂。 |
蛋白质需求 | |
BER不需要其他蛋白质。 | NER需要多种基因产物,特别是蛋白质,来区分受损和未受损区域。 |
适宜性 | |
BER适用于修正单基损伤。 | NER适用于更换损坏区域。 |
总结 - 基底切除修复术(base excision repair) vs. 核苷酸切除修复(nucleotide excision repair)
NER和BER是细胞中发现的两种DNA切除修复过程。BER能够修复内源性引起的小损伤,而NER能够修复30个碱基对长度的损伤区域。BER与NER的区别在于所识别的基底类型和初始解理事件。BER还可以识别不是由DNA螺旋的显著扭曲引起的损伤,而NER可以识别DNA螺旋的显著扭曲。这就是碱基切除修复和核苷酸切除的区别。
Image Courtesy:
1. “Dna repair base excersion en” By LadyofHats – (Public Domain) via Comm*** Wikimedia
2. “A schematic representation of models for the nucleotide excision repair pathway controlled by Uvr proteins” By Rihito Morita, Shuhei Nakane, Atsuhiro Shimada, Masao Inoue, Hitoshi Iino, Taisuke Wakamatsu, Kenji Fukui, Noriko Nakagawa, Ryoji Masui, and Seiki Kuramitsu – (CC BY 1.0) via Comm*** Wikimedia