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ゲル電気泳動は、電場で大きな分子を分離する技術である。分子生物学において、RNAとタンパク質をサイズに基づいて分離することは一般的な方法である。 SDS-Pageは、ゲル電気泳動の一種で、タンパク質混合物からタンパク質をサイズに基づいて分離するために使用される。ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質の分離に用いられる従来の技術であり、SDS-Pageはゲル電気泳動の一種である。これがゲル電気泳動とSDS-Pageの大きな違いである。
目次 1. 概要と主な違い 2. ゲル電気泳動とは 3. SDSとは p. 4.横並び比較 - ゲル電気泳動とSDS p. 5.概要
ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質などの荷電分子をその混合物から分離するために実験室でよく使われる技術である。このゲルはゲル電気泳動に使用されます。分子のふるいとして機能する。ゲル電気泳動用のゲルには、アガロースとポリアクリルアミドの2種類があります。ゲル電気泳動で分子を良好に分離するためには、ゲルの孔径を慎重に制御する必要があり、ゲルの選択とゲルの調製は重要な要素である。ゲル電気泳動では、ゲルの両端に電場が付着している。ゲルの一端は正に帯電し、もう一端は負に帯電しています。
DNAとRNAは負に帯電した分子である。ゲルのマイナス端からゲルにロードされ、電界が印加されると、ゲルの孔を通ってプラスに帯電した端に向かって移動する。移動速度は、電荷と分子の大きさに依存する。小さな分子は大きな分子に比べてゲルの孔を移動しやすい。そのため、小さな分子はゲル内を長い距離移動し、大きな分子は短い距離で移動する。ゲル上での分子の動きを観察するために、特殊な色素が使用される。電界を一定時間かけては止め、分子の消失を防ぎ、分子を移動させたままの状態にする。ゲルには異なるバンドが観察される。これらのバンドは、異なるサイズの分子を表しています。このように、ゲル電気泳動は分子の大きさによって区別するのに役立つ。
ゲル電気泳動は、PCR、RFLP、クローニング、DNAシークエンス、サザンブロッティング、ゲノムマッピングなど、分子生物学における調製技術として広く用いられている。
図01:アガロースゲル電気泳動法
ドデシル硫酸ナトリウム-ポリアクリルアミドゲル電気泳動法(SDS-Page)は、タンパク質の分離に用いられるゲル電気泳動法の一種である。ゲル電気泳動でタンパク質を分離する場合、タンパク質はDNAやRNAのようにマイナスに帯電しておらず、プラスやマイナスの端に移動しないため、特別な処理が必要になります。そのため、ゲル電気泳動前に、タンパク質は変性し、負に帯電している。ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)という洗浄剤で行います。SDSゲルやポリアクリルアミドゲルを用いた電気泳動はSDS-Pageと呼ばれ、生化学、遺伝学、法医学、分子生物学などで広く用いられている技術である。
SDS-Pageプロセスでは、タンパク質とSDSを混合する。ドデシル硫酸ナトリウムは、タンパク質を線状に展開し、分子量に比例した負の電荷でコーティングする。負の電荷を帯びているため、タンパク質分子はゲルの正の電荷を帯びた端に向かって移動し、分子量に応じて分離されます。SDS-Pageでは、ゲルの固体担体としてポリアクリルアミドが使用されます。実際のタンパク質の分離は、ゲルの性質に大きく依存する。したがって、ポリアクリルアミドゲルの調製には注意が必要で、正しい濃度のポリアクリルアミドを使用する必要があります。ポリアクリルアミドゲルは、アガロースゲルに比べて解像度が高いのが特徴です。そのため、SDS-Pageはタンパク質分離の高分解能技術であると考えられている。
SDS-Pageは、変性ゲル電気泳動法の一種である。タンパク質分析において大きな制約がある。SDSは分離前にタンパク質を変性させるため、酵素活性、タンパク質結合相互作用、タンパク質補因子などを検出することはできません。
図02:SDSページ
SDS-Pageを用いたゲル電気泳動法 | |
ゲル電気泳動は、電場を用いて大きな分子を分離する方法である。 | SDS-Pageは、タンパク質の品質に基づいた高分解能のゲル電気泳動技術です。 |
ゲルフロー | |
これは水平方向にも垂直方向にも可能です。 | SDS-Pageは常に垂直に走ります。 |
分離基準 | |
電荷と大きさによって分離が行われる。 | タンパク質の分離は、質量と電荷に基づいて行われます。 |
解像度 | |
低分解能アガロースゲル電気泳動法、高分解能ポリアクリルアミドゲル電気泳動法 | SDS-Pageの解像度は良好です。 |
性転換 | |
ゲル電気泳動法には、変性法と非変性法がある。 | SDS-Pageは、分離前にタンパク質を変性させます。 |
ゲル電気泳動は、DNA、RNA、タンパク質をそのサイズと電荷に基づいて分離・分析する一般的な技術である。ゲル電気泳動には、大きく分けてアガロースゲル電気泳動とポリアクリルアミドゲル電気泳動がある。アガロースゲルは主に核酸の分離に用いられ、ポリアクリルアミドゲルはより高い解像度が要求される場合に用いられる。タンパク質分離の高分解能技術として注目されている。これが、ゲル電気泳動とSDS-Pageの違いである。
R 参考文献:1.David Wolkowski, David Wolkowski, William Wolkoskin.Natural SDS-PAGE:結合金属イオンを含む天然物性を保持したタンパク質の高分解能電気泳動分離 www.ncbi.nlm.nih.gov. N, p., May 2014.Web. 2017年4月7日. アガロースゲル、ポリアクリルアミドゲルおよび遊離液におけるDNAの電気泳動〉, Electrophoresis. u, US National Library of Medicine, June 2009.Web. 2017年4月7日。