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アガロースとポリアクリルアミドは、どちらも水溶性高分子ですが、その成り立ちには多くの違いがあります。アガロースもポリアクリルアミドも、多孔質のゲルマトリックスを形成するという点では共通である。とはいえ、両者には大きな違いがあります。この2つのポリマーの主な違いは、その起源、化学構造、用途の違い、ゲル電気泳動における特性である。
アガロースは、海藻に含まれる寒天という複合高分子から抽出された天然由来の線状高分子である。寒天から寒天アグルチニンと呼ばれるタンパク質成分を除去してアガロースを抽出する。アガロースは、寒天にゲルを形成する能力を与える。
アガロースは、主に微生物学や分子生物学の研究に使用されています。微生物学的研究において、アガロースは適切な栄養素を補充することで、細菌や真菌などの微生物を培養するための強固な土台となります。半固形化した濃度で使用すると、これらの微生物の運動性を評価することができる。分子生物学においては、「ゲル電気泳動」または「アガロースゲル電気泳動」(AGE)と呼ばれる最も基本的な分離プロセスの重要なツールである。ゲル電気泳動は、核酸やタンパク質をその大きさと電荷によって分離するプロセスである。この場合、アガロースは多孔質の篩のようなゲルであり、この中で分離が行われる。
アガロース構造
ポリアクリルアミドは合成高分子で、幅広い産業分野で使用されている。前述のように、その用途はゲルを形成する能力に依存する。しかし、産業によって、水の濃度を維持するための採掘能力も異なる。
ポリアクリルアミドの最も広く一般的な用途は、廃水処理である。ここでは、凝集剤として使用し、浮遊有機物を除去することで、水の濁りを改善し、清澄化する。ポリアクリルアミドのもう一つの用途は製紙業です。ここでは、必要に応じてパルプから水分を保持したり、排出したりする。同様に、農業や建設業界では、土壌浸食防止や土質改善のための土壌改良剤として使用されています。
ポリアクリルアミドもアガロースと同様、分子生物学において「ポリアクリルアミドゲル電気泳動」(PAGE)と呼ばれる重要な分離手段として使用されている。このほか、鉱石加工や凝集剤※2として、浮遊有機物を除去して水の濁りを改善し、清澄化する用途にも使用されています。ポリアクリルアミドのもう一つの用途は製紙業です。ここでは、必要に応じてパルプから水分を保持したり、排出したりする。同様に、農業や建設業界では、土壌浸食防止や土質改善のための土壌改良剤として使用されています。このほか、ポリアクリルアミドは**食品添加物、ソフトコンタクトレンズ、繊維製品などにも使われています。
ポリアクリルアミドの構造
アガロース:海藻から抽出される天然高分子です。
ポリアクリルアミド:ポリアクリルアミドは合成品であり、自然界には存在しない。
アガロース:アガロースの分子式はC24H38O19。
ポリアクリルアミド:ポリアクリルアミドの分子式は(c3h5no)nです。
アガロース:アガロースは、アグリコンと呼ばれる繰り返し単位が水素結合で結合した線状の多糖類である。
ポリアクリルアミド:アクリルアミドモノマーと架橋剤N,N'-メチレンビスアクリルアミドからなる化学的架橋ポリマーです。
アガロース:アガロースおよびその単量体であるアガロースは、いずれも自然界において無毒である。
ポリアクリルアミド:ポリアクリルアミドの単量体であるアクリルアミドは発がん性、神経毒性が推定されているが、その重合体は自然界で無毒である。
アガロース:AGE用アガロースゲルは、開始剤や重合触媒を必要とせず、調製に時間がかからず、簡便です。
ポリアクリルアミド:ポリアクリルアミドゲルの調製には時間と手間がかかり、また開始剤(過硫酸アンモニウム)と重合触媒(N,N,N',N'-tetramethyleethylenediamine-TEMED)が必要です。
ポリアクリルアミドゲルは、アガロースゲルに比べて化学的に安定しています。
同じ濃度であれば、ポリアクリルアミドゲルマトリックスはアガロースゲルマトリックスに比べてポアサイズが小さくなる傾向があります。
ポリアクリルアミドゲルは、アガロースゲルに比べて細孔径を制御して変化させることが可能である。
ポリアクリルアミドゲルは解像度が高く、アガロースゲルは解像度が低い。
ポリアクリルアミドゲルは、アガロースゲルに比べてより多くの核酸を分離するために保持することができます。