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SDS-pageとNative-pageの主な違いは、使用するポリアクリルアミドゲルの種類です。SDS-pageでは変性ゲルを使用するので、分子量に応じて分子が分離されます。一方、ネイティブページでは、非変性ゲルが使用される。そのため、分子の大きさ、電荷、形状が分離を左右する。
ポリアクリルアミドゲル電気泳動法(Page)は、アクリルアミドモノマーとメチレンビスアクリルアミドを重合して作ったゲルを使用する。ポリアクリルアミドはアガロースよりも強靭で耐熱性に優れています。ポリアクリルアミドゲルは細孔径が小さいため、タンパク質を効率的に分離することができます。SDS-Pageはドデシル硫酸ナトリウム-ポリアクリルアミドゲル電気泳動で、分子量に応じてタンパク質を分離する。SDS-Pageは変性ゲルを使用し、native-Pageは非変性ゲルを使用し、サイズ、電荷、形状(3次元コンフォメーション)に基づきタンパク質を分離する。
1. 概要と主な違い 2. SDS-Page とは 3. Native Page とは 4. SDS-Page と Native-Page の類似点 5. 横並び比較 - SDS Page と Native Page の表形式 6. まとめ
SDS-Pageは、タンパク質を分子量に応じて分離するための最も一般的な電気泳動法である。このゲルは、ドデシル硫酸ナトリウム(sodium dodecyl sulphate)を加えることで作られる。sds-dentureは、タンパク質をモノマーに合成するものである。ドデシル硫酸ナトリウムは陰イオン性洗浄剤です。そのため、広いpH領域でタンパク質に正味の負の電荷を付加することができる。タンパク質分子に正味の負の電荷が与えられると、電荷の変化により複合体の構造が乱れる。プラス電荷はマイナス電荷を引き寄せる。その結果、低分子量の分子はゲルマトリックスを高速で移動し、陽極の近くで観察され、高分子量のタンパク質は細孔の近くで観察されるようになる。
図01:SDS-Page
SDSとポリペプチド鎖の結合は、その相対分子量に比例する。SDS-Pageゲルの染色はブロモフェノールブルー染色で行われる。sds-pageは応用範囲が広く、タンパク質混合物中のタンパク質の相対分子量や相対存在量の推定に使用できる。sds-pageはまた、混合物中のタンパク質の分布を決定するのにも使用できる。タンパク質の精製と同定ウェスタンブロッティングやハイブリダイゼーションの前段階として、タンパク質の局在や同定に利用されています。
ナチュラルポリアクリルアミドゲル電気泳動法(Native Page)は、非変性ゲルを使用します。そのため、ゲルマトリックスにはSDSなどの変性剤は添加されていない。天然のポリアクリルアミドゲル電気泳動では、タンパク質の電荷とサイズに基づいて分離される。したがって、タンパク質の移動度は、タンパク質の電荷とサイズに依存する。
タンパク質の電荷は、アミノ酸の側鎖に依存する。側鎖が負に帯電していれば、タンパク質は全体的に負に帯電し、逆もまた然りである。フォールディングの結果、タンパク質は3次元的なコンフォメーションを維持する。フォールディングは、ジスルフィド結合、疎水性相互作用、水素結合など、タンパク質に存在するいくつかの結合タイプの結果である。したがって、中性pHの条件で自然なポリアクリルアミドゲル電気泳動を行えば、タンパク質の分子形状に応じた分離が行われることになる。したがって、天然のポリアクリルアミドゲル電気泳動は、タンパク質の電荷やコンフォメーションの変化を検出する高感度な技術として用いることができる。
天然型ポリアクリルアミドゲル電気泳動法の最大の利点は、ポリアクリルアミドゲル電気泳動分析に用いたタンパク質が、その過程で乱されないため、ポリアクリルアミドゲル電気泳動分析後に元の状態に戻すことができる点である。天然型ポリアクリルアミドゲル電気泳動は、タンパク質の安定性が向上し、比較的ハイスループットな技術です。
図02:ローカルページ
ゲルランが完了したら、Bromophenol Blue または他の適切な染色試薬で染色することにより、天然ポリアクリルアミドゲルを可視化することができます。天然型ポリアクリルアミドゲル電気泳動の用途としては、酸性タンパク質(組み換えヒトエリスロポエチンなどの糖タンパク質を含む)の分離やウシ血清アルブミン(BSA)中のタンパク質の同定などが挙げられる。
SDS-PageとNative-Page | |
SDS-Page(ドデシル硫酸ナトリウム-ポリアクリルアミドゲル電気泳動法)は、タンパク質を分子量に応じて分離し、変性ゲルを使用します。 | Native-Pageは非変性ゲルを用いて、タンパク質をサイズ、電荷、形状(3Dコンフォメーション)に応じて分離します。 |
ゲルタイプ | |
SDS-page用変性ゲル。 | ネイティブページには非変性ゲルが使用されています。 |
SDSの存在 | |
SDSは、SDS-pageで試料に負の電荷を与える洗浄剤である。 | ローカルページにSDSが存在しない。 |
分離基準 | |
タンパク質の分離は、SDS-pageに含まれるタンパク質の分子量に依存します。 | 分離はタンパク質分子の大きさと形状に依存します。 |
タンパク質の安定性 | |
SDS-ページ解析の結果、タンパク質の安定性が低下していることがわかった。 | タンパク質はより安定しています。 |
生タンパク質の回収 | |
SDS-pageで変性してしまうので無理です。 | ネイティブページでの可能性 |
SDS-PageとNative-Pageは、タンパク質の分離に用いられるポリアクリルアミドゲル電気泳動法です。SDS-PageはSDSという洗浄剤で処理します。そのため、タンパク質は分子量に応じて分離される。これに対し、ネイティブページ法は、変性剤を一切使用しない。そのため、これらのタンパク質は、その大きさか形状によって分離される。これがSDS-pageとnative-pageの違いです。
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