主な違い - 積層ゲルと分離ゲル

SDS-PAGE（ドデシル硫酸ナトリウム-ポリアクリルアミドゲル電気泳動）とは、分子量に応じてタンパク質分子を分離する実験手法であり、その説明には「スタッキングゲル」「セパレーティングゲル」という用語が使われます。のテクニックを使っています。この技術は、分子量の異なるタンパク質は移動速度が異なり、分子量の低いものは速く、分子量の高いものは遅く移動する、という理論に基づいている。マイグレーションを行う媒体はゲルである。ゲルには、スタッキングゲルとセパレーティングゲルの2種類があります。スタッキングゲルとセパレーションゲルの大きな違いは、スタッキングゲルのpHが6.8であるのに対し、セパレーションゲルのpHは8.8であることです。

カタログ

1. 概要と主な違い 2. 積層ゲルとは 3. 分離ゲルとは 4. 積層ゲルと分離ゲルの関係 5. 横並びの比較 - 積層ゲルと分離ゲルの表形式 6. まとめ

スタッキングゲルは何ですか？

SDS-PAGE法では、高濃度の分離ゲル（セパレーションゲル）の上に低濃度のポリアクリルアミドゲルを重ねたものをスタッキングゲルと呼ぶ。電気泳動の分解能を向上させるために、スタッキングゲルを使用します。スタッキングゲルとブレークアップゲルの濃度が異なるため、試料中のタンパク質に影響を与え、分解能が向上しています。積層ゲル中のポリアクリルアミド濃度が低いため、ポアサイズが大きくなっています。これは、分離性を高めることにもつながります。

積層ゲルは、約7％のポリアクリルアミドの大きな孔を持つ緩いポリアクリルアミドゲルである。この孔は、大きなタンパク質分子に対しては、かなりのバリアとして機能しない。したがって、このゲルはこれらのタンパク質の移動度にわずかな影響を与える。これは、分離のために2つのゲルの間に濃縮されたタンパク質の移動度と大きさに基づくものである。

図01：SDS-PAGEアクリルアミドゲル

積層ゲルのpHは6.8であり、分解ゲルのpHより2pH単位高い。このpH値は、イオン強度が低いことを意味し、その結果、抵抗値が高くなる。これにより、ゲル中の他の荷電粒子よりもタンパク質の運動性が励起される。

シーティングゲルは何ですか？

SDS-page技術における分離ゲルまたはセパレーティングゲルは、低濃度スタッキングゲルの上に高濃度ポリアクリルアミドゲルを載せたものである。分離用ゲルには高濃度のポリアクリルアミド（10％）が含まれています。このゲルのpHは、積層ゲルのpHよりも高いpH＝8.8に保たれている。

図02：ゲル電気泳動装置

タンパク質分子が分離ゲルに到達すると、分離ゲルは細孔径の小さな高濃度ゲルであるため、タンパク質分子の移動に対してかなりの障壁となり、分子の移動が遅くなる。このため、ゆっくり移動する他のタンパク質が追いつき、2つのゲルの間に狭い集中したバンドが形成される。

スタッキングゲルとセパレーティングゲルの関係は何ですか？

• 積層ゲルと分離ゲルは、同じ設置場所で2種類とも使用します。

スタッキングゲルとシーティングゲルの違い

概要 - スタッキングゲル vs. シーティングゲル

積層ゲルと分離ゲルは、試料中のタンパク質分子をよりよく分離するために用いられる2種類のポリアクリルアミドゲルである。スタッキングゲルとセパレーティングゲルの違いは、スタッキングゲルはpH6.8、セパレーティングゲルはpH8.8であることです。

引用

1. 「ポリアクリルアミドゲル電気泳動法」。ポリアクリルアミドゲル電気泳動法（理論）：分子生物学バーチャルラボII：バイオテクノロジーと医用工学：アムリタ・ヴィシュワ・ヴィダペタム バーチャルラボ。こちらから入手可能です 2. "SDS-PAGEのしくみ"一口メモ バイオ』2018年2月16日発売。こちらから入手可能です 3. "SDS-PAGE stacking gel-BICH 608 (Polymanis Pettigrew)".Googleのサイトです。こちらで提供 2.「SDS-PAGEの働き」『Bitesize Bio』2018年2月16日 3.「SDS-PAGE積層ゲル-BICH 608（ポリマニス・ペティグリュー）」です。"Googleサイト