紮根的(rooted)和無根系統發育樹(unrooted phylogenetic tree)的區別

系統發育學是探索地球生命的一個重要領域。它揭示了有機體與其祖先和後代之間的聯繫。生物之間的關係以圖解的方式表示，如登度圖、分支圖、物候圖、系統圖等。系統發育樹是一種分枝樹狀圖，它用進化距離來解釋生物之間的系統發育關係。有兩種主要類型的系統發生樹被稱為有根和無根。有根系統發育樹與無根系統發育樹的主要區別在於，有根樹顯示的是樹的最基本的祖先，而無根的系統發生樹不顯示祖先的根。

內容1。概述和主要區別2。什麼是有根的系統發育樹3。什麼是無根系統發生樹4。並排比較樹狀進化與非樹狀進化。摘要

什麼是有根的系統發育樹(a rooted phylogenetic tree)？

一個有根的系統發生樹是一個有用的圖表，顯示進化歷史。它有一個稱為根的基本節點，代表所有樹組的共同祖先。樹的根被認為是樹中最老的點，它代表樹中所有組的最後一個共同祖先。因此，有根的樹顯示了進化時間的方向。從一棵有根樹的單個物種中，可以通過追溯到基部節點來找到共同的祖先或物種的祖先。因為有根的樹描繪了進化時間的方向，所以很容易找到它所擁有的較老或較新的群體。有根的樹可以用來研究整個生物群。系統發育樹的準確生根是一個重要和關鍵的因素，因為不準確的生根會導致對生物體之間的遺傳變化及其進化方向的錯誤解釋。

紮根的(rooted)和無根系統發育樹(unrooted phylogenetic tree)的區別

圖01：有根的系統發育樹

什麼是無根系統發生樹(an unrooted phylogenetic tree)？

無根系統發生樹是一種缺乏共同祖先或基本節點的系統發育圖。這種類型的樹並不表示興趣群體進化的起源。它只描述了生物之間的關係，而不考慮進化時間線的方向。因此，很難用無根樹來研究種群與時間的演化關係。

有兩種主要的方法來建立一個無根的系統發生樹。他們是

找到一個外群-這需要預先了解分類群之間的關係。然後，一個位於類群之外的分類單元可以作為外類群來繪製有根的系統發育樹

找到中點或距離-樹中最遠的兩個分類群的中點可以假設為系統發育樹的根。

圖02：無根系統發生樹

紮根的(rooted)和無根系統發育樹(unrooted phylogenetic tree)的區別

有根與無根系統發生樹
一個有根的系統發生樹是一個圖表，顯示了最後的共同祖先的群體。	一個沒有樹冠的系統發生樹顯示了有機體之間的關係，而沒有顯示共同的祖先。
節點
它有一個節點（根）。	它沒有節點。
進化方向
它有指示進化時間的方向。	它沒有指明進化關係。
對他人的態度
樹允許確定組之間的祖先-後代關係。	樹不允許談論祖先和後代的關係。