主要區別
外毒素是細菌分泌並釋放到細胞外的有毒物質。而內毒素是由位於細胞內的脂類構成的細菌毒素。
什麼是外毒素(exotoxins)？
當生物體生長時，細胞外釋放的毒素稱為外毒素。外毒素可能會從感染點傳播到身體的遠處並造成損害。E、 神經毒素（肉毒毒素、破傷風毒素）、腸毒素（霍亂毒素）、細胞毒素。外毒素是細菌分泌的毒素。外毒素可以透過破壞細胞或破壞正常的細胞代謝而對宿主造成損害。它們的效力很強，能對宿主造成嚴重損害。外毒素可以分泌，或者類似於內毒素，可以在細胞溶解過程中釋放出來
什麼是內毒素(endotoxins)？
內毒素是革蘭氏陰性菌產生的脂多糖毒素。內毒素這個名字來源於這樣一個事實：這些毒素通常是細胞結合的，只有當細胞溶解時才會釋放出來。一種與某些革蘭氏陰性菌外膜有關的熱穩定毒素，包括布魯氏菌、奈瑟菌和弧菌屬。內毒素不分泌，但只有在細胞被破壞時才會釋放；它們的效力和特**不如外毒素；而且它們不形成類毒素。大量產生失血性休克和嚴重腹瀉；少量會引起發燒、對細菌感染的抵抗力改變、白細胞減少，隨後出現白細胞增多，以及許多其他生物效應。
主要區別
- 外毒素通常是某些細菌分泌的不耐熱蛋白質，可擴散到周圍環境中培養基.內毒素是一種熱穩定的脂多糖蛋白複合物，形成革蘭氏陰性菌細胞壁的結構成分，僅在細菌細胞溶解或死亡時釋放。
- 外毒素是生物體排出的，活細胞、內毒素是細胞壁的組成部分。
- 外毒素存在於革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌中。內毒素主要存在於革蘭氏陰性菌中。
- 外毒素可透過許多試驗（中和、沉澱等）檢測。內毒素透過鱟試劑檢測。
- 與內毒素相比，外毒素沒有酶活性。
- 與內毒素相比，外毒素是可過濾的。
- 外毒素是高度抗原性的。內毒素是弱免疫原性的。
- 化學成分外毒素：蛋白質，化學成分內毒素。
