主要區別
內孢子與外孢子的主要區別在於，內孢子是在母體細胞壁上形成的，在細胞破裂時釋放到環境中，而外孢子是透過細胞分裂形成的，透過隔膜的形成與母細胞分離。
內孢子(endospore) vs. 外生孢子(exospore)
內孢子被認為是由DNA和少量細胞質組成的細菌在不利條件下生存的一種結構；另一方面，外孢子被認為是透過形成隔膜與母細胞分離的無性孢子。細菌負責產生內孢子，而真菌和藻類產生外孢子。
內孢子通常在母細胞內形成，相反，外孢子通常在母細胞末端附近形成。細胞分裂不發生在內孢子的形成過程中；相反，外孢子是在細胞分裂過程中形成的。內孢子的結構堅固、休眠、不繁殖，有時被稱為外孢子的薄覆蓋層所覆蓋。相比之下，外生孢子的結構包含一種獨特的孢子形式，它是細菌和真菌繁殖的一種手段，它們不包含特殊的覆蓋物。
透過親本細胞的破裂，內孢子被釋放到環境中；另一方面，外孢子通常透過芽接釋放出來。一個有機體只能形成一個內孢子，但恰恰相反，一個有機體可以產生多個外孢子。
內孢子可由梭菌屬、芽孢桿菌屬、擬桿菌屬等細菌屬形成；另一方面，外生孢子由變色龍屬、分生孢子屬、放線菌屬、粘菌屬、鏈黴菌屬、放線菌屬組成。內孢子一般由梭狀芽孢桿菌和孢子絲孢菌產生，相比之下，外孢子通常由放線菌門的一些成員產生。
比較圖
什麼是內孢子(endospore)？
內孢子是細菌在含有DNA和少量細胞質的惡劣和不利條件下產生的一種抗性結構。內孢子被一層薄薄的保護性外殼所覆蓋。
當許多環境條件變得有利時，內孢子開始萌發並形成許多新的有機體。這就是為什麼內孢子被稱為原始生殖細胞的原因。內孢子由細菌屬形成，如梭狀芽孢桿菌、芽孢桿菌和擬桿菌屬。這些細菌能忍受高溫和低溫、紫外線輻射、脫水、化學物質等惡劣條件。
內孢子包含一個由二苯二甲酸形成的細胞壁，它為內孢子提供熱彈性特性。細菌內生孢子經121℃溼熱處理約15分鐘可被破壞。
有“內孢子”的名稱，意思是孢子或類似種子的形狀，但它並不被認為是真正的孢子。內孢子是一種堅韌的、休眠的、剝落的結構，細菌可以從中自我調節。內孢子的形成通常是在營養缺乏時觸發的，主要發生在革蘭氏陽性菌中。
什麼是外生孢子(exospore)？
外生孢子被稱為一種更具彈性的細菌，主要由藻類和真菌在惡劣環境中繁殖形成。透過細胞分裂的過程，外生孢子在母體細胞的末端產生。
外生孢子可以透過產生一個隔膜來分離，它發生在父細胞和子細胞之間。外生孢子形成芽的形狀。當條件成熟時，芽可以從母體細胞中釋放出來，進行萌發。分生孢子被稱為真菌孢子的一種，通常以外孢子形式形成。
外生孢子是由藻類產生的，如粘蟲和海棠。外孢子也可以由放線菌、鏈黴菌和放線桿菌等細菌產生。藍細菌，如變色龍，也會導致外孢子的形成。外孢子是單一型別細菌的永久性結構。
外生孢子沒有孢子殼的保護層。由於幾乎完全調節了外孢子的新陳代謝和它們的低含水量，與營養細胞相比，外生孢子被認為對高溫、脫水、化學脅迫和輻射更具彈性。例如，產孢菌是甲烷，通常使用的是甲氧基菌屬。
主要區別
- 一種由細菌在臨界條件下生存的硬結構，有DNA和少量細胞質，稱為內孢子。相反，無性孢子，通常用於藻類和真菌的繁殖，並透過形成隔膜與母細胞分離，稱為外孢子。
- 內孢子主要由細菌產生，而外孢子主要由真菌和藻類產生。
- 內孢子在母細胞內產生，外孢子在母細胞的末端形成。
- 內孢子不是透過細胞分裂形成的，但相比之下，外孢子的形成是透過細胞分裂形成的。
- 一個內孢子由一個有機體形成，而許多外孢子由一個有機體形成。
- 內孢子可以透過打破親本細胞釋放出來，而外孢子可以通過出芽過程釋放出來。
結論
以上討論認為，內孢子和外孢子是孢子的兩種型別。儘管如此，它們還是不同的，因為內孢子主要由細菌產生，並在母體細胞內產生。外生孢子由藻類、真菌、細菌和藍藻組成，並在母體細胞的末端產生。
