主要区别
内孢子与外孢子的主要区别在于，内孢子是在母体细胞壁上形成的，在细胞破裂时释放到环境中，而外孢子是通过细胞分裂形成的，通过隔膜的形成与母细胞分离。
内孢子(endospore) vs. 外生孢子(exospore)
内孢子被认为是由DNA和少量细胞质组成的细菌在不利条件下生存的一种结构；另一方面，外孢子被认为是通过形成隔膜与母细胞分离的无性孢子。细菌负责产生内孢子，而真菌和藻类产生外孢子。
内孢子通常在母细胞内形成，相反，外孢子通常在母细胞末端附近形成。细胞分裂不发生在内孢子的形成过程中；相反，外孢子是在细胞分裂过程中形成的。内孢子的结构坚固、休眠、不繁殖，有时被称为外孢子的薄覆盖层所覆盖。相比之下，外生孢子的结构包含一种独特的孢子形式，它是细菌和真菌繁殖的一种手段，它们不包含特殊的覆盖物。
通过亲本细胞的破裂，内孢子被释放到环境中；另一方面，外孢子通常通过芽接释放出来。一个有机体只能形成一个内孢子，但恰恰相反，一个有机体可以产生多个外孢子。
内孢子可由梭菌属、芽孢杆菌属、拟杆菌属等细菌属形成；另一方面，外生孢子由变色龙属、分生孢子属、放线菌属、粘菌属、链霉菌属、放线菌属组成。内孢子一般由梭状芽孢杆菌和孢子丝孢菌产生，相比之下，外孢子通常由放线菌门的一些成员产生。
比较图
什么是内孢子(endospore)？
内孢子是细菌在含有DNA和少量细胞质的恶劣和不利条件下产生的一种抗性结构。内孢子被一层薄薄的保护性外壳所覆盖。
当许多环境条件变得有利时，内孢子开始萌发并形成许多新的有机体。这就是为什么内孢子被称为原始生殖细胞的原因。内孢子由细菌属形成，如梭状芽孢杆菌、芽孢杆菌和拟杆菌属。这些细菌能忍受高温和低温、紫外线辐射、脱水、化学物质等恶劣条件。
内孢子包含一个由二苯二甲酸形成的细胞壁，它为内孢子提供热弹性特性。细菌内生孢子经121℃湿热处理约15分钟可被破坏。
有“内孢子”的名称，意思是孢子或类似种子的形状，但它并不被认为是真正的孢子。内孢子是一种坚韧的、休眠的、剥落的结构，细菌可以从中自我调节。内孢子的形成通常是在营养缺乏时触发的，主要发生在革兰氏阳性菌中。
什么是外生孢子(exospore)？
外生孢子被称为一种更具弹性的细菌，主要由藻类和真菌在恶劣环境中繁殖形成。通过细胞分裂的过程，外生孢子在母体细胞的末端产生。
外生孢子可以通过产生一个隔膜来分离，它发生在父细胞和子细胞之间。外生孢子形成芽的形状。当条件成熟时，芽可以从母体细胞中释放出来，进行萌发。分生孢子被称为真菌孢子的一种，通常以外孢子形式形成。
外生孢子是由藻类产生的，如粘虫和海棠。外孢子也可以由放线菌、链霉菌和放线杆菌等细菌产生。蓝细菌，如变色龙，也会导致外孢子的形成。外孢子是单一类型细菌的永久性结构。
外生孢子没有孢子壳的保护层。由于几乎完全调节了外孢子的新陈代谢和它们的低含水量，与营养细胞相比，外生孢子被认为对高温、脱水、化学胁迫和辐射更具弹性。例如，产孢菌是甲烷，通常使用的是甲氧基菌属。
主要区别
- 一种由细菌在临界条件下生存的硬结构，有DNA和少量细胞质，称为内孢子。相反，无性孢子，通常用于藻类和真菌的繁殖，并通过形成隔膜与母细胞分离，称为外孢子。
- 内孢子主要由细菌产生，而外孢子主要由真菌和藻类产生。
- 内孢子在母细胞内产生，外孢子在母细胞的末端形成。
- 内孢子不是通过细胞分裂形成的，但相比之下，外孢子的形成是通过细胞分裂形成的。
- 一个内孢子由一个有机体形成，而许多外孢子由一个有机体形成。
- 内孢子可以通过打破亲本细胞释放出来，而外孢子可以通过出芽过程释放出来。
结论
以上讨论认为，内孢子和外孢子是孢子的两种类型。尽管如此，它们还是不同的，因为内孢子主要由细菌产生，并在母体细胞内产生。外生孢子由藻类、真菌、细菌和蓝藻组成，并在母体细胞的末端产生。
