shRNA vs siRNA
在RNA干扰(RNAi)过程中,靶基因的表达以高度的特**和选择性被抑制。RNA干扰是一个自然过程,涉及小干扰RNA(siRNA)、短发夹RNA(shRNA)和双功能shRNA。目前,RNAi作为个体化癌症治疗的工具被广泛应用。RNAi的应用基本上是通过化学合成的双链siRNA和载体shRNA分子来实现的。尽管这两个分子具有相似的功能结果,但它们的结构不同;因此,这两个分子的作用机制、RNA途径和靶向效应也不同。
什娜
shRNA是一个小RNA分子序列,在RNAi过程中可以用来使靶基因表达沉默。shRNA的表达是通过载体实现的,载体可以是病毒或细菌,也可以是质粒。它们在细胞核中合成,并运输到细胞质中进行进一步的加工。这些分子具有相似的miRNA成熟途径,因此miRNA的合成为理解shRNA的合成提供了基础。RNA聚合酶II或III均可通过RNA聚合酶II或III启动子转录shRNA。使用shRNAs的优点是它们的降解率和周转率相对较低。缺点是它需要一个表达式向量,这可能会导致一些安全问题。
siRNA
sirna是由20-25个碱基组成的双链RNA分子。它们通过沉默RNAi途径中任何具有互补核苷酸序列的基因来抑制基因。转染siRNA的基因敲除通常是不成功的,这是由于短暂的效应;尤其是在快速分裂的细胞中,抑**用不会持续更长时间。为了克服这个问题,siRNA通过引入一个短发夹结构进行了修饰。这种经过修饰的分子被称为shRNA。shRNA应通过骰子转化为siRNA,以继续其正常功能。
shRNA和siRNA的区别是什么?
•与siRNA不同,shRNA具有额外的发夹结构。shRNA是siRNA的改良版本。
•shRNA需要表达载体,而siRNA不需要。
•shRNA可用于长期敲除,而siRNA只能用于基因的短期敲除。
•与siRNA的基因抑制不同,shRNA的抑制是持久的,如果通过适当的病毒载体**,它可能产生永久的基因沉默效果。