关键区别——crispr与rnai
基因组编辑和基因修饰是遗传学和分子生物学中即将出现的一个有趣的领域。基因修饰广泛应用于基因治疗研究,也可用于确定基因的性质、功能以及基因突变如何影响其功能。开发高效可靠的方法对活细胞的基因组进行精确、有针对性的改变是很重要的。CRISPR和RNAi等技术被用来高精度地修饰基因。CRISPR或簇状规则间隔的短回文重复序列是一种自然发生的原核免疫防御机制,最近被用于真核基因的编辑和修饰。RNA干扰(RNAi)是一种序列特**的方法,通过引入小的双链RNA与核酸介导,调控基因表达。这是CRISPR和RNAi的关键区别。
目录
1.概述和主要区别
2. 什么是CRISPR
3. 什么是RNAi
4. CRISPR与RNAi的相似性
5.并列比较——CRISPR与RNAi的表格形式
6. 摘要
什么是清脆的(crispr)?
CRISPR系统是一些细菌(包括大肠杆菌和大肠杆菌)中存在的一种自然机制。它是一种针对外来DNA入侵的适应性免疫保护。它是一种序列特**机制。CRISPR系统包含几个DNA重复元件。这些元素中**着从外源DNA和多个Cas基因衍生的短“间隔区”序列。有些Cas基因是核酸酶。因此,完整的免疫系统被称为CRISPR/Cas系统。
CRISPR/Cas系统分四个步骤运行。
- The system is genetically tethering invading phage and pla**id DNA segments (spacers) into CRISPR loci (called the spacer acquisition step).
- crRNA maturation step – The host transcribes and processes CRISPR loci to generate mature CRISPR RNA (crRNA) containing both CRISPR repeat elements and the integrated spacer elements.
- Detection of the crRNA – This is facilitated by complementary base pairing. This is important when an infection is present and an infectious agent is present.
- Target interference step – crRNA detects foreign DNA, forms a complex with the foreign DNA and protects the host against the foreign DNA.
目前,CRISPR/Cas系统主要是通过转录抑制或激活来改变或修饰哺乳动物基因组。哺乳动物细胞对CRISPR/Cas9介导的DNA断裂具有修复机制。它可以使用非同源端接法(NHEJ)或同源定向修复(HDR)来完成。这两种修复机制都是通过引入双链断裂来实现的。这导致了哺乳动物基因的编辑。因此,目前CRISPR/Cas系统在治疗、生物医学、农业和科研等领域得到了广泛的应用。
什么是rnai(rnai)?
RNA干扰是一种双链RNA介导的调控基因表达的技术。主要涉及的化合物是小干扰rna(siRNAs)。siRNAs是一种特殊类型的双链rna,有两个核苷酸的3′,磷酸基为5′。RNA诱导沉默复合物(RISC)是在RNA干扰过程中形成的,它会导致与siRNA结合的基因发生降解。
RNAi的程序如下。
- The double-stranded RNA will be processed in the cytopla** by a RNase III-type endoribonuclease called Dicer to generate ~21 nucleotide long siRNAs
- Transfer of siRNA bound Dicer to Argonaute, with the help of double-stranded RNA binding proteins (dsRNABP).
- Binding of Argonaute to one strand of the duplex (guide strand). This will displace the other strand. This results in a whole protein – RNA complex which is called RISC.
- The pairing of the RISC complex with single-stranded guide RNA bound to the Argonaute.
- The pairing of the homologous RNA target with the guide RNA.
- Activation of Argonaute resulting in the degradation of the target RNA
什么是crispr与rnai的相似性(the similarity between crispr and rnai)?
- 它们都被用作基因表达修饰的研究工具
清脆的(crispr)和rnai(rnai)的区别
CRISPR vs RNAi | |
CRISPR是近年来用于真核生物基因编辑和修饰的一种免疫防御机制。 | RNAi是一种通过引入小的双链来沉默基因的序列特**方法 |
目标序列 | |
合成RNA(引导RNA)是CRISPR的靶向序列。 | siRNA是rna干扰的靶向序列。 |
基因抑制效率 | |
清脆度低 | 高RNAi |
影响 | |
基因敲除发生在CRISPR中。 | RNAi中发生敲除/沉默。 |
总结 - 清脆的(crispr) vs. rnai(rnai)
CRISPR或簇状规则间隔的短回文重复序列是一种自然发生的原核免疫防御机制,最近被用于真核基因的编辑和修饰。RNA干扰(RNAi)是一种序列特**的方法,通过引入小的双链RNA与核酸介导,调控基因表达。这就是CRISPR和RNAi的基本区别。CRISPR/Cas和RNAi都是基因操作的有力工具,尽管CRISPR/Cas肯定比RNAi更优越,因为它可以用来诱导**和缺失。CRISPR/Cas系统的特**也很高。
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引用
1.新英格兰生物实验室。“CRISPR/Cas9和靶向基因组编辑:分子生物学的新纪元。”CRISPR/Cas9和靶向基因组编辑:分子生物学的新时代|内布拉斯加州大学,2017年9月22日查阅。这里有2。“RNA干扰(RNAi)。”美国国家医学图书馆国家生物技术信息中心。2017年9月22日访问。可在这里查阅3.Unniyampurath,Unnikrishnan等人。CRISPR时代的RNA干扰:CRISPR会干扰RNAi吗?“国际分子科学杂志,MDPI,2016年3月。访问日期:2017年9月22日。此处提供
2.“RNA干扰(RNAi)。”美国国家医学图书馆国家生物技术信息中心。2017年9月22日访问。
3.Unniyampurath,Unnikrishnan等人。CRISPR时代的RNA干扰:CRISPR会干扰RNAi吗?“国际分子科学杂志,MDPI,2016年3月。2017年9月22日访问