Dobzhansky-Muller模型是一种科学解释，解释了为什么自然选择会影响物种形成，当物种之间发生杂交时，产生的后代在遗传上与其起源物种的其他成员不相容。

这是因为自然界中物种形成有几种方式，其中之一是由于某些种群或该物种种群的一部分的生殖隔离，一个共同的祖先可以分裂成许多谱系。

在这种情况下，这些谱系的基因组成随着时间的推移而变化，通过突变和自然选择选择最有利的生存适应。一旦物种分化，很多时候它们就不再相容，也不再能够彼此有性繁殖。

自然界既有合子前的隔离机制，也有合子后的隔离机制，阻止物种进行杂交和产生杂种，而Dobzhansky-Muller模型有助于解释这是如何通过交换独特的新等位基因和染色体突变发生的。

等位基因的新解释

西奥多·多布赞斯基（Theodosius Dobzhansky）和赫尔曼·约瑟夫·穆勒（Hermann Joseph Muller）创建了一个模型来解释新形成的物种中新的等位基因是如何产生和传递的。从理论上讲，在染色体水平上发生突变的个体将无法与任何其他个体繁殖。

Dobzhansky-Muller模型试图从理论上解释，如果只有一个个体具有这种突变，那么一个全新的谱系是如何产生的；在他们的模型中，一个新的等位基因出现并固定在一个点上。

在另一个现已分化的谱系中，一个不同的等位基因出现在基因的不同点上。这两个分化的物种现在互不相容，因为它们有两个等位基因，在同一种群中从未出现过。

这改变了转录和翻译过程中产生的蛋白质，这可能使杂交后代的性不相容；然而，每个谱系仍然可以假设与祖先种群一起繁殖，但是如果谱系中的这些新突变是有利的，最终它们将成为每个种群中的永久等位基因。当这种情况发生时，祖先种群已经成功地分裂成两个新物种。

杂交的进一步解释

Dobzhansky-Muller模型也能够解释这在整个染色体的大水平上是如何发生的。在进化过程中，随着时间的推移，两条较小的染色体可能发生着丝粒融合，成为一条较大的染色体。如果发生这种情况，染色体较大的新谱系将不再与其他谱系兼容，杂交也不会发生。

这本质上意味着，如果两个相同但孤立的群体以AABB基因型开始，但第一个群体进化为AABB，第二个群体进化为AABB，这意味着如果他们杂交形成杂种，a和b或a和b的组合在群体历史上第一次出现，使这种杂交后代无法与祖先生存。

Dobzhansky-Muller模型指出，不亲和性最有可能是由两个或多个群体而不是一个群体的交替固定引起的，杂交过程会在同一个体中产生基因独特的等位基因，并与同一物种的其他个体不亲和。