美沙酮最重要的长期效果通常是减少对海洛因和吗啡等药物的渴求。然而，不幸的是，美沙酮的一些长期效果远不如人意。例如，一个人在长时间服用该药物时可能会出现呼吸问题，如呼吸不足。同样，一些人经历了与美沙酮使用相关的性变化和激素失衡。成瘾也是美沙酮使用的长期影响之一，当人们停止服用美沙酮时，可能会出现戒断症状。
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美沙酮的长期效应之一是它能够帮助人们对抗药物添加。这种药物经常被用来帮助人们克服对其他被归类为阿片剂的药物的渴望，阿片剂是从鸦片中提取的麻醉品。为了达到这种效果，医生通常会开出逐渐增加的美沙酮剂量，并仔细监测患者对美沙酮的反应，最终使剂量趋于稳定。这种逐步引入高剂量美沙酮的方法用于预防或尽量减少药物的副作用。例如，这种逐渐增加可能有助于降低药物对患者产生类似镇静剂效果的可能性；引起恶心、呕吐或便秘；或影响患者的大脑功能
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大多数服用美沙酮的人没有经历严重的健康问题。然而，在某些情况下，长期服用这种药物的人会遇到与呼吸系统有关的问题。这种药物也可能引起某些患者的激素变化。例如，它有时和睾丸激素的减少有关。一些服用它的女性可能也会改变月经周期

对一些人来说，美沙酮的长期影响包括与性功能相关的影响。有些人在服用时可能会明显减少性欲望。其他人可能会经历身体问题，从而妨碍他们享受满意的性交。例如，一名男子可能因美沙酮治疗而阳痿。然而，这些问题并不会影响每一个服用这种药物的人，而且这些副作用可能取决于个人服用的剂量。

成瘾也是美沙酮使用的长期影响之一。虽然美沙酮被用来减少瘾君子对其他药物的渴求，但它也会上瘾。如果一个人在长期使用美沙酮后试图停止服用美沙酮，他很可能会出现戒断症状。这些症状包括恶心呕吐、寒战、药物渴求和肌肉痉挛。

美沙酮戒断的一个症状是个人可能会经历过多的出汗和发冷。尽管这些症状令人不快，但它们往往不如人们在戒除海洛因等毒品时所遭受的严重。此外，逐渐使患者脱离美沙酮可能有助于减少戒断的副作用。