RNA测序是确定一条核糖核酸(或RNA)链中核苷酸序列的过程。RNA由四个核苷酸组成,称为腺嘌呤(A)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(S)和尿嘧啶(S)。核苷酸的特定序列是一个 "代码",包含用于生产不同类型的蛋白质或本身具有某些特定功能的遗传信息。以核苷酸序列形式存在的遗传密码定义了几乎所有涉及生物体发育和功能的生物过程。因此,RNA测序是一种研究,旨在发现该遗传密码的精确性质,并将该密码与生物体内的特定结构和功能联系起来。
科学家对脱氧核糖核酸(或称DNA)进行测序的频率远远高于对RNA的测序。DNA同样是由核苷酸组成的,但它们是以双螺旋方式排列的。RNA "转录本 "实际上是根据DNA链上的核苷酸序列制成的--DNA往往比RNA更坚固,因为许多RNA链必须由单一的DNA序列制成。此外,DNA含有 "内含子",即非编码的DNA片段,在转录过程中被编辑掉,因此不能被RNA测序检测到。RNA测序仍然很重要,尽管在许多情况下,在测序之前有必要首先将RNA "反转录 "为DNA。
事实上,RNA序列不一定与转录它的DNA序列相同,这是科学家实际进行RNA测序实验的主要原因之一。RNA测序使科学家能够发现DNA模板的哪些部分在转录时被编辑掉了。知道了这一点,他们就可以研究该序列是如何以及为什么被编辑掉的。生物学中一个有趣的问题是,大量的基因组,或一个生物体内的遗传信息的总和,似乎没有被使用。准确地了解哪些序列被使用,哪些没有被使用,是探索这些未使用的遗传信息片段的错综复杂的重要一步。
开发更高效和有效的RNA测序方法是生物技术领域许多研究人员的一个重要焦点。研究人员一般必须在实际取序前将RNA反转为DNA。研究人员希望开发出能在不损害RNA链的情况下对RNA进行有效直接测序的方法。此外,研究人员希望找到高通量的方法,使他们能在一次RNA测序过程中对许多RNA链进行测序。
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