天然气(ngs)和双脱氧测序法(sanger sequencing)的区别
下一代测序(NGS)和Sanger测序是随时间发展起来的两种核苷酸测序技术。Sanger测序法被广泛应用多年,由于其优越性,近年来被NGS取代。NGS和Sanger测序的关键区别在于NGS的工作原理是通过测序系统以快速的方式同时对数百万个序列进行测序,而Sanger测序的原理是由于DNA聚合酶在DNA过程中选择性地加入了双脱氧核苷酸复制和毛细管电泳分离片段。
内容1。概述和主要区别2。什么是核苷酸序列3。什么是NGS4。什么是测序。并列比较——NGS与Sanger测序6。摘要
什么是核苷酸测序(nucleotide sequencing)?
遗传信息储存在生物体的DNA或RNA的核苷酸序列中。在一个给定的片段(在一个基因、一组基因、染色体和整个基因组中)确定核苷酸的正确顺序(使用四个碱基)的过程被称为核苷酸测序。基因的结构和功能分析在基因组学、法医学、病毒学、生物系统学、医学诊断、生物技术等许多领域都具有重要意义。科学家们开发了不同类型的测序方法。其中,由Frederick Sanger于1977年开发的Sanger测序被广泛应用和推广了很长一段时间,直到下一代测序取代了它。
什么是天然气(ngs)?
下一代测序(NGS)是一个用来指代现代高通量测序过程的术语。它描述了许多不同的现代测序技术,这些技术革新了基因组研究和分子生物学。这些技术包括Illumina测序、罗氏454测序、离子质子测序和固体(寡连接检测测序)测序。NGS系统更快、更便宜。四种主要的DNA测序方法用于NGS系统,即焦测序、合成测序、连接测序和离子半导体测序。大量的DNA或RNA链(数百万条)可以并行测序。它允许在短时间内对生物体的整个基因组进行测序,不像桑格测序需要更多的时间。
NGS方法比传统的测序Sanger法有许多优点。它是一种快速、更准确、经济有效的过程,可以在小样本量下进行。NGS可用于亚基因组研究,检测个体基因组内因**和缺失等原因而产生的变异,以及分析基因表达。
什么是双脱氧测序法(sanger sequencing)?
Sanger测序是由Frederick Sanger和他的同事在1977年开发的一种测序方法,用于确定给定DN**段的精确核苷酸顺序。它也被称为链终止测序或双脱氧测序。ddeotp是dd-tp在DNA合成过程中选择性终止DNA链的方法。正常核苷酸有3’OH基团,用于在相邻核苷酸之间形成磷酸二酯键,以继续链的形成。然而,ddNTPs缺乏这个3'OH基团,不能在核苷酸之间形成磷酸二酯键。因此,链伸长停止。
在这种方法中,待测序的单链DNA作为体外DNA合成的模板链。其他要求是寡核苷酸引物,脱氧核苷酸前体和DNA聚合酶酶。当目标片段的侧翼末端已知时,可以很容易地设计引物进行DNA复制。四个不同的DNA合成反应在四个不同的试管中进行。每根管子都有单独的DDNTP和其他要求。从特定的核苷酸中加入dNTPs和ddNTPs的混合物。同样地,在四个管中用四种混合物进行四种不同的反应。反应完成后,进行DN**段的检测和序列信息的转换。产生的DN**段经过热变性并通过凝胶电泳分离。如果使用放射性核苷酸,聚丙烯酰胺凝胶中的带型可以通过放射自显影来观察。当这种方法使用荧光标记的脱氧核苷酸时,它可以减轻凝胶读数并通过激光束被荧光检测器检测。为了避免当一个序列被肉眼读取并手动输入计算机时可能出现的错误,这种方法发展成与计算机耦合的自动测序器的使用。
这是一种从人类基因组计划中提取DNA序列的方法。这种方法在先进的改进中仍在使用,因为它提供了精确的序列信息,尽管这是一个昂贵和缓慢的过程。
天然气(ngs)和双脱氧测序法(sanger sequencing)的区别
NGS与Sanger测序 | |
下一代测序(NGS)是指现代高通量测序过程。现代测序技术描述了许多不同的技术 | Sanger测序是由Frederick Sanger开发的一种测序方法,用于确定给定DN**段的精确核苷酸顺序。 |
成本效益 | |
NGS是一种更便宜的工艺,因为它减少了时间、人力和化学物质。 | 这是一个昂贵的过程,因为它需要时间,人力和更多的化学品。 |
速度 | |
这是更快的,因为化学检测和信号检测的许多股同时发生。 | 这是非常耗时的,因为化学检测和信号检测作为两个独立的过程进行,并且一次只能在链上读取。 |
可靠性 | |
NGS是可靠的。 | 桑格测序不太可靠 |
样本量 | |
NGS需要更少的DNA。 | 这种方法需要大量的模板DNA。 |
每个测序片段的DNA碱基 | |
每个测序片段的DNA碱基数低于Sanger法 | 生成序列比NGS序列长。 |
总结 - 天然气(ngs) vs. 双脱氧测序法(sanger sequencing)
NGS和Sanger测序是广泛应用于分子生物学的核苷酸测序技术。Sanger测序是一种早期测序方法,被NGS取代。NGS和Sanger测序的主要区别在于NGS是一种比Sanger测序更快速、更精确和更具成本效益的过程。这两种技术在遗传学和生物技术领域引起了重大的爆发。
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