患有纤维肌痛的人经常会因为疼痛而感到运动困难，但医生强调，运动不会造成损害，事实上可能有助于缓解该疾病的一些症状。医生通常建议进行心血管锻炼、拉伸和力量训练。运动可能包括水上有氧运动、瑜伽、散步和举重。治疗纤维肌痛的最佳运动取决于个人选择——如果患者喜欢这种运动，他会继续这样做。增加心率的运动，如慢跑、骑自行车或游泳，应以低强度进行，尤其是在新的运动方案开始时
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治疗纤维肌痛最简单的运动之一是步行。患者应该从短距离步行开始，慢慢延长时间。刚开始的速度可能很慢，患者在最初几天可能只能走一点路，甚至是沿着车道走一走。随着时间的推移，距离可以慢慢增加，以增强心血管力量。和朋友或狗一起散步也是一个很好的激励工具。

温水锻炼项目对纤维肌痛患者也有好处。水可以缓冲身体，在温水中锻炼比在冷水池中游泳更容易。许多社区中心和健康俱乐部现在都在提供温水锻炼，有时被称为“aqua cize”，教练会引导参与者进行一系列温和的有氧运动。水提供了阻力，运动可以以个人速度进行。

缓解纤维肌痛运动的另一个重要组成部分是每日拉伸。伸展运动可以帮助减少肌肉紧绷，提高整体运动能力，改善肌肉的氧气流动。拉伸可以在任何地方进行，无需任何特殊设备。瑜伽和太极是很好的锻炼方式，包括伸展和慢动作。课程可以在大多数健身俱乐部找到，甚至可以在家里使用的DVD上找到。

力量训练似乎会产生更多的肌肉疼痛，但轻量训练可以帮助身体整体变得更强壮。最好的方法可能是首先关注目前没有痛苦的领域。例如，如果腿部肌肉有问题，从坐着的二头肌卷曲开始可能是个好主意。或者，如果上半身疼痛，抬腿加强股四头肌可能是一个不错的选择。锻炼可以用很轻的重量或用自己的身体来抵抗。每天只需重复十次就可以增强肌肉力量和控制力
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最重要的是，任何治疗纤维肌痛的锻炼计划都必须切合实际。医生通常建议开始时尽量小，即使一天只有五分钟。纤维肌痛患者应该放慢脚步，倾听自己的身体，因为他们知道有些日子他们做不到这么多。养成锻炼的习惯最终会带来更多的精力和更少的痛苦。