關鍵區別——crispr與rnai
基因組編輯和基因修飾是遺傳學和分子生物學中即將出現的一個有趣的領域。基因修飾廣泛應用於基因治療研究,也可用於確定基因的性質、功能以及基因突變如何影響其功能。開發高效可靠的方法對活細胞的基因組進行精確、有針對性的改變是很重要的。CRISPR和RNAi等技術被用來高精度地修飾基因。CRISPR或簇狀規則間隔的短迴文重複序列是一種自然發生的原核免疫防禦機制,最近被用於真核基因的編輯和修飾。RNA干擾(RNAi)是一種序列特**的方法,通過引入小的雙鏈RNA與核酸介導,調控基因表達。這是CRISPR和RNAi的關鍵區別。
目錄
1.概述和主要區別
2. 什麼是CRISPR
3. 什麼是RNAi
4. CRISPR與RNAi的相似性
5.並列比較——CRISPR與RNAi的表格形式
6. 摘要
什麼是清脆的(crispr)?
CRISPR系統是一些細菌(包括大腸桿菌和大腸桿菌)中存在的一種自然機制。它是一種針對外來DNA入侵的適應性免疫保護。它是一種序列特**機制。CRISPR系統包含幾個DNA重複元件。這些元素中**著從外源DNA和多個Cas基因衍生的短“間隔區”序列。有些Cas基因是核酸酶。因此,完整的免疫系統被稱為CRISPR/Cas系統。
CRISPR/Cas系統分四個步驟運行。
- The system is genetically tethering invading phage and pla**id DNA segments (spacers) into CRISPR loci (called the spacer acquisition step).
- crRNA maturation step – The host transcribes and processes CRISPR loci to generate mature CRISPR RNA (crRNA) containing both CRISPR repeat elements and the integrated spacer elements.
- Detection of the crRNA – This is facilitated by complementary base pairing. This is important when an infection is present and an infectious agent is present.
- Target interference step – crRNA detects foreign DNA, forms a complex with the foreign DNA and protects the host against the foreign DNA.
目前,CRISPR/Cas系統主要是通過轉錄抑制或激活來改變或修飾哺乳動物基因組。哺乳動物細胞對CRISPR/Cas9介導的DNA斷裂具有修復機制。它可以使用非同源端接法(NHEJ)或同源定向修復(HDR)來完成。這兩種修復機制都是通過引入雙鏈斷裂來實現的。這導致了哺乳動物基因的編輯。因此,目前CRISPR/Cas系統在治療、生物醫學、農業和科研等領域得到了廣泛的應用。
什麼是rnai(rnai)?
RNA干擾是一種雙鏈RNA介導的調控基因表達的技術。主要涉及的化合物是小干擾rna(siRNAs)。siRNAs是一種特殊類型的雙鏈rna,有兩個核苷酸的3′,磷酸基為5′。RNA誘導沉默複合物(RISC)是在RNA干擾過程中形成的,它會導致與siRNA結合的基因發生降解。
RNAi的程序如下。
- The double-stranded RNA will be processed in the cytopla** by a RNase III-type endoribonuclease called Dicer to generate ~21 nucleotide long siRNAs
- Transfer of siRNA bound Dicer to Argonaute, with the help of double-stranded RNA binding proteins (dsRNABP).
- Binding of Argonaute to one strand of the duplex (guide strand). This will displace the other strand. This results in a whole protein – RNA complex which is called RISC.
- The pairing of the RISC complex with single-stranded guide RNA bound to the Argonaute.
- The pairing of the homologous RNA target with the guide RNA.
- Activation of Argonaute resulting in the degradation of the target RNA
什麼是crispr與rnai的相似性(the similarity between crispr and rnai)?
- 它們都被用作基因表達修飾的研究工具
清脆的(crispr)和rnai(rnai)的區別
CRISPR vs RNAi | |
CRISPR是近年來用於真核生物基因編輯和修飾的一種免疫防禦機制。 | RNAi是一種通過引入小的雙鏈來沉默基因的序列特**方法 |
目標序列 | |
合成RNA(引導RNA)是CRISPR的靶向序列。 | siRNA是rna干擾的靶向序列。 |
基因抑制效率 | |
清脆度低 | 高RNAi |
影響 | |
基因敲除發生在CRISPR中。 | RNAi中發生敲除/沉默。 |
總結 - 清脆的(crispr) vs. rnai(rnai)
CRISPR或簇狀規則間隔的短迴文重複序列是一種自然發生的原核免疫防禦機制,最近被用於真核基因的編輯和修飾。RNA干擾(RNAi)是一種序列特**的方法,通過引入小的雙鏈RNA與核酸介導,調控基因表達。這就是CRISPR和RNAi的基本區別。CRISPR/Cas和RNAi都是基因操作的有力工具,儘管CRISPR/Cas肯定比RNAi更優越,因為它可以用來誘導**和缺失。CRISPR/Cas系統的特**也很高。
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引用
1.新英格蘭生物實驗室。“CRISPR/Cas9和靶向基因組編輯:分子生物學的新紀元。”CRISPR/Cas9和靶向基因組編輯:分子生物學的新時代|內布拉斯加州大學,2017年9月22日查閱。這裡有2。“RNA干擾(RNAi)。”美國國家醫學圖書館國家生物技術信息中心。2017年9月22日訪問。可在這裡查閱3.Unniyampurath,Unnikrishnan等人。CRISPR時代的RNA干擾:CRISPR會干擾RNAi嗎?“國際分子科學雜誌,MDPI,2016年3月。訪問日期:2017年9月22日。此處提供
2.“RNA干擾(RNAi)。”美國國家醫學圖書館國家生物技術信息中心。2017年9月22日訪問。
3.Unniyampurath,Unnikrishnan等人。CRISPR時代的RNA干擾:CRISPR會干擾RNAi嗎?“國際分子科學雜誌,MDPI,2016年3月。2017年9月22日訪問