逐克隆測序和鳥槍測序的關鍵區別在於它們的操作方法。逐克隆測序法包括染色體定位和測序前的克隆,而鳥槍測序法省略了測序過程中的染色體定位和克隆步驟。
克隆測序和鳥槍測序是現代基因組測序的兩種方法。逐克隆測序是一種更可靠的測序方法。然而,鳥槍測序法克隆的方法速度快,成本低。本文重點討論逐克隆測序和鳥槍測序之間的細微差別。
目錄
1. 概述和主要區別
2. 什麼是克隆測序
3. 什麼是鳥槍測序克隆
4. 逐克隆測序與鳥槍測序的相似性
5. 並排比較-以表格形式逐個克隆測序與***測序
6. 摘要
什麼是逐克隆測序(clone by clone sequencing)?
逐克隆測序是基因組測序的一種方法。它需要在DNA分裂之前對每個染色體進行定位。在定位之後,DNA應該被分解成150千鹼基長的片段。這些片段就可以進行測序了。下一步是將DN**段**細菌人工染色體(BAC),然後**細菌細胞。由於碎片現在在細菌細胞內,每次細菌分裂時,**的DN**段也會分裂併產生許多相同的拷貝。然後,單個細菌克隆的DNA被分成500個鹼基對長的片段。它們是更小的重疊碎片。接下來,測序是將這些片段**一個已知DNA序列的載體中。從已知的向量序列開始,測序繼續到未知序列。
測序完成後,有必要確定重疊序列的區域。此後,碎片的連接發生以形成最初出現在BACs中的較大片段。接下來,根據基因組圖,將較大的片段組裝到染色體上。
克隆測序的顯著優點是預先準備好的基因組圖有助於更大片段的可靠組裝。但是,這種測序方法的缺點是生成基因組圖和克隆非常耗時。然而,這是“人類基因組計劃”中首選的方法。
什麼是鳥槍測序克隆(clone by shotgun sequencing)?
鳥槍克隆測序法是一種將DNA序列隨機分成多個小片段,通過觀察重疊區域來重組序列的測序方法。較大的哺乳動物基因組很難克隆序列和組裝。這是由於它們的結構複雜性和尺寸。雖然逐克隆測序法是可靠的,但複雜生物的基因組測序需要很長時間。因此,鳥槍克隆測序已成為一種可靠、廉價、快速的測序方法。因此,現代科學家依靠這種測序方法來處理複雜的基因組。
在用鳥槍測序法進行克隆時,沒有常規的基因組定位和克隆步驟。最初,整個基因組被分成從20千鹼基到300千鹼基不等的大小。接下來,進行測序。然後,使用複雜的計算機軟件,有必要通過觀察重疊區域來組裝碎片。
鳥槍式測序有助於提高現有基因組序列的準確性。這種方法的主要優點是它比逐克隆測序法快得多,而且成本低。然而,這個過程並不涉及使用基因圖譜。因此,在組裝過程中更容易發生錯誤。因此,這是鳥槍測序法克隆的一個主要缺點。
逐克隆測序(clone by clone sequencing)和**槍測序(shotgun sequencing)的共同點
- 逐克隆測序和鳥槍測序都是基因組測序的兩種方法。
- 在這兩種測序技術中,分解片段的組裝是通過識別重疊區域來完成的。
- 此外,DNA分解成更小的片段對於克隆和鳥槍測序都是必要的。
逐克隆測序(clone by clone sequencing)和**槍測序(shotgun sequencing)的區別
逐克隆測序技術包括兩個主要步驟:染色體定位和克隆。相比之下,鳥槍式克隆測序不遵循這兩個步驟;它隨機地將DNA序列分解成許多小片段,並通過觀察重疊區域來重組序列。因此,這就是逐克隆測序和***測序的關鍵區別。由於這個因素,逐克隆測序是一個昂貴而耗時的過程,而逐克隆測序則更快、更便宜。
但是,在逐個克隆排序過程中,彙編過程中發生錯誤的可能性較小。因此,它具有很高的可靠性。然而,鳥槍測序法是一種相對不可靠的技術。所以,這也是逐克隆測序和鳥槍測序的一個顯著區別。
下面的信息圖顯示了關於克隆測序和***測序之間區別的更多信息。
總結 - 逐克隆測序(clone by clone sequencing) vs. **槍測序(shotgun sequencing)
在總結逐克隆測序和鳥槍測序的區別時,克隆測序和鳥槍測序是兩種基因組測序方法。然而,逐克隆測序技術涉及基因組定位和克隆過程,而鳥槍式測序則不涉及。所以,這就是逐克隆測序和***測序的關鍵區別。由於基因組作圖是在逐個克隆測序過程中進行的,因此在序列組裝過程中出錯的可能性較小。但是,鳥槍測序克隆是一種更快、更便宜的方法。然而,它的可靠性相對較低。逐克隆測序是“人類基因組計劃”中首選的測序方法。但是,現代分子生物學家更多地依賴於鳥槍式克隆測序。
引用
1“什麼是克隆測序?“事實,Wellcome Genome校區的公眾參與團隊,2014年11月17日,可在此處查閱。“什麼是***測序?“事實,Wellcome Genome校區的公眾參與團隊,2014年11月17日,可在此處查閱。
2“什麼是***測序?“事實,Wellcome Genome校區公眾參與團隊,2014年11月17日,
Image Courtesy: