外顯子(exome)和rna測序(rna sequencing)的區別

關鍵區別-外顯子組與rna測序

核酸測序是一種技術，它決定了一個有機體的特定DNA或RN**段中核苷酸的順序。測序在識別細胞的DNA和RNA組成以及區分編碼功能蛋白的某些基因方面非常重要；因此，測序可以用來理解這些基因和基因表達的突變。桑格測序法或更先進的下一代測序方法是常用的測序方法。外顯子測序是對生物體內存在的一整套外顯子或編碼DNA區域的測序，而RNA測序是核糖核酸（RNA）的測序過程。這是外顯子組和RNA測序的關鍵區別。

什麼是外顯子組測序(exome sequencing)？

外顯子組是由特定生物體的編碼基因組成的基因組的一個子集。編碼基因被命名為外顯子，被轉錄成mRNA，然後翻譯成氨基酸序列。在轉錄後修飾過程中，真核生物的RNA剪接機制去除了內含子（非編碼區），而外顯子則保留下來。外顯子組測序主要有兩種技術：基於解的和基於陣列的。

在基於溶液的外顯子組測序中，DNA樣品通過限制性內切酶或機械方法破碎並通過熱變性。在這項技術中，生物素化寡核苷酸探針（baits）被用來選擇性地與基因組中的靶區雜交。結合步驟使用磁性鏈黴親和素珠。綁定之後是一個清洗步驟，其中未綁定和非目標序列被沖走。然後用聚合酶鏈反應（PCR）擴增結合靶點，然後用Sanger測序或下一代測序技術進行測序。

圖01：外顯子組測序

基於陣列的方法也類似於基於溶液的方法，只是DN**段被捕獲到一個微陣列中，然後在測序之前進行結合和洗滌步驟。

外顯子組測序被廣泛應用於疾病的遺傳診斷、基因治療、識別新的遺傳標記、農業中鑑定各種有益的農藝性狀和植物育種過程。

什麼是rna測序(rna sequencing)？

RNA測序是以轉錄組為基礎的，轉錄組是細胞的完整轉錄物。RNA測序的關鍵目標是對轉錄物的所有種類進行分類，包括mRNA、非編碼RNA和小RNA，以確定基因的轉錄結構並量化發育過程中每個轉錄物的表達水平。在RNA測序過程中，最初使用雜交技術（從成熟的mRNA序列中衍生出互補DNA）進行測序。目前，RNA測序採用了一種更為精確和先進的穿透技術。

圖02:RNA測序

在RNA測序中，RNA樣品可以是總RNA，也可以是分餾RNA，通過反轉錄將其轉化為互補DNA（cDNA），並建立cDNA文庫。每一個cDN**段在兩側（雙端測序）或單側（單端測序）與接合器相連。這些標記序列是通過Sanger測序或下一代測序，如外顯子測序。

外顯子(exome)和rna測序(rna sequencing)的共同點

短片段或全套DNA/RNA可用於外顯子或RNA測序。
序列片段保存在庫中。
可以使用桑格測序或下一代測序。
兩者都是體外測序方法。
測序片段可由熒光標記確定。

外顯子(exome)和rna測序(rna sequencing)的區別

外顯子與RNA測序
外顯子測序是對生物體內存在的一整套外顯子或編碼DNA區域的測序。	RNA測序是指核糖核酸（RNA）的測序程序；轉錄組。
起始樣品
基因組DNA是外顯子組測序的起始樣本。	RNA是RNA測序的開始。
組成
它只包含DNA的編碼區，即外顯子	它包含RNA mRNA/轉錄組。
排序
外顯子組測序主要有兩種方法：基於解決方案的方法和基於陣列的技術。	RNA測序是通過提取總RNA或片段RNA製備cDNA文庫來完成的。

總結 - 外顯子(exome) vs. rna測序(rna sequencing)

外顯子組是生物體內完整的編碼區，決定外顯子精確核苷酸順序的技術稱為外顯子組測序。RNA測序是測定生物體RNA核苷酸序列的技術。這就是外顯子組和RNA測序的區別。

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引用

1.王忠等。“RNA序列：轉錄組學的革命性工具”，《自然評論》。遺傳學，美國國家醫學圖書館，2009年1月，可在這裡查閱。2017年9月3日查閱。2.Warr，Amanda等人。“外顯子組測序：當前和未來前景。”G3：基因|基因組|遺傳學，美國遺傳學學會，2015年8月，可在這裡查閱。2017年9月3日訪問。
2.沃爾、阿曼達等。“外顯子組測序：當前和未來前景”，G3：基因|基因組|遺傳學，美國遺傳學學會，2015年8月，