contig和scaffold的關鍵區別在於contig沒有間隙，而scaffold是由contigs和gaps組成的。
多細胞生物的基因組測序與單細胞生物的測序相比是非常困難的。全基因組鳥槍測序是一種簡單、快速的多細胞基因組測序技術。這是一種將許多重疊的DN**段並行排列的方法。在這種方法中，小碎片被組裝成較大的碎片，然後用計算機組裝成更大的容器。然後將這些contigs組裝成支架，最後形成染色體。因此，contig是核苷酸序列的連續延伸，而scaffold是由contigs和gaps組成的基因組的一部分。contig和scaffold都是重組的基因組序列。
目錄
1. 概述和主要區別
2. 什麼是康蒂格
3. 什麼是腳手架
4. Contig與Scaffold的相似性
5. 並列比較-Contig與表格形式的腳手架
6. 摘要
什麼是繼續(contig)？
Contig是一個基因組序列。它是由a、C、G和T鹼基組成的連續序列。它是通過把幾個小的重疊的DN**段組合成一個較長的序列而形成的。簡單地說，contig是一組序列片段的集合。Contig創建包括基於局部字符串匹配和對齊方法識別重疊序列片段。
CONTIG沒有間隙。它是腳手架的一部分。創建腳手架時，CONTIG被鏈接在一起。它需要更多的信息，有關contigs在基因組中的相對位置和方向。這些縫隙將腳手架中的孔道分開。基本上，contig組裝是全基因組噴槍測序的重要步驟。最後將Contigs組裝成完整的基因組序列。Contig程序集通常需要了解字符串匹配和序列對齊中的算法。
什麼是腳手架(a scaffold)？
支架是從全基因組末端測序的鳥槍克隆中重建的基因組序列。在結構上，腳手架由連接和縫隙組成。因此，腳手架是通過將連接件連接在一起並通過間隙將其隔開而形成的。支架的建立需要關於基因中contigs的相對位置和方向的信息。全基因組鳥槍組裝的目的是在一個支架上代表每個基因組序列。但是，這不太可能。因此，一個染色體可以用幾個支架來表示。有時腳手架可能重疊。此外，在裝配過程中，有些支架可能會被過濾掉。
圖02：全基因組鳥槍裝配概述
腳手架間隙的長度不能顯示其真實長度。一般來說，間隙是任意設置為一定的固定長度。因此，這些間隔和長度上的不確定性給理解基因組**能元素的真正空間關係和信息缺失的實際程度帶來了困難。有時缺口代表缺失的基因組信息。
康蒂格(contig)和腳手架(scaffold)的共同點
- Contig和scaffold是由核苷酸序列組成的基因組序列。
- 腳手架由連接和縫隙組成。
繼續(contig)和腳手架(scaffold)的區別
連續序列是由一組序列片段組合而成的連續序列。相比之下，支架是通過連接contigs來重建基因組序列的一部分。所以，這就是contig和scaffold的關鍵區別。此外，腳手架上的連接件沒有間隙，而腳手架中的連接件則由間隙隔開。
下面的信息圖表列出了contig和scaffold之間的更多差異。
總結 - 康蒂格(contig) vs. 腳手架(scaffold)
contig和scaffold都是全基因組測序項目中的重組核苷酸序列。Contig是一個連續延伸的基因組序列，包含a，C，G和T鹼基，沒有缺口。支架是一個由連接和缺口組成的基因組序列。因此，最短的裝配組件是連續的，而支架是連接的。最後，在全基因組測序中，將支架組裝成染色體。因此，本文總結了contig和scaffold的區別。
引用
1複雜基因組：鳥槍式測序〉，Scitable，自然教育，2008，
