元基因組學和元轉錄組學之間的關鍵區別取決於每個領域研究的生物分子類型。元基因組學研究DNA及其序列及其在生物體中的行為,而metatranscriptomics研究轉錄的DNA,主要是mRNA序列及其在生物體中的行為。
元基因組學和元轉錄組學是近年來與微生物群落相關的兩個頗受歡迎的領域。它們在衛生保健、工業和農業生物技術中很重要。元基因組學和元轉錄組學都允許研究一個群落中的個體有機體及其功能作用,無論是有益的還是有害的。
目錄
1. 概述和主要區別
2. 什麼是元基因組學
3. 什麼是轉錄組學
4. 基因組學與轉錄組學的相似性
5. 並列比較-表格式的宏基因組學與元轉錄組學
6. 摘要
什麼是宏基因組學(metagenomics)?
元基因組學是探索脫氧核糖核酸(DNA)的研究領域。它與微生物群落關係最密切。而且,與基因組學相比,這是一個更先進的領域。在基因組學中,對特定生物體的DNA進行分析。然而,元基因組學涉及到對整個有機體的遺傳物質的分析。因此,這使得研究一個有機體群落與一個條件或一個環境有關的行為成為可能。
元基因組學研究的主要技術是使用微陣列技術的下一代測序技術。NGS方法可以分析單個反應中存在或不存在特定DNA序列的多個生物體。這些DNA序列可能是單一疾病或環境條件的原因。因此,利用亞基因組學知識,可以方便、準確地進行生物篩選。在NGS期間,測序是在短讀和分析有機體的DNA發生。16s DNA序列是近年來在微生物亞基因組學研究中的一個熱門序列。
在生物群落測序之後,應進行序列比對。使用基本局部對準序列工具(BLAST)等工具來完成對準任務。在排列之後,一個系統發生樹提供了群落中每一個有機體之間的關係及其行為的細節。
什麼是轉錄組學(metatranscriptomics)?
元轉錄組學是研究生物體轉錄組的一門學科。轉錄組構成在DNA轉錄過程中轉錄的整個RNA序列。轉錄組中的mRNA序列提供了有關基因表達的信息。元轉錄組學是對不同群體或群體的多個轉錄組的分析。
元轉錄組學研究也使用微陣列技術來尋找短讀序列的序列。此外,元轉錄組學還涉及使用比對工具和樹設計方法進行徹底的生物信息學分析。然而,相比元基因組學,元轉錄組學的研究要困難得多。從整體上提取mRNA或RNA並不像看上去那麼容易。由於RNA極易被破壞,並且生存時間很短,因此這些RNA的保存和保存是一個可能的問題。
宏基因組學(metagenomics)和轉錄組學(metatranscriptomics)的共同點
- 宏基因組學和轉錄組學是分析生物群落(主要是微生物群落)的高通量技術。
- 這兩種技術都使用微陣列技術來推斷研究結果。
- 所獲得的結果通常使用BLAST比對和系統發育樹進行分析。
- 而且,這兩種技術都不是針對一個有機體,而是針對一個群體或群落有機體。
- 除此之外,這兩個概念的研究大多與微生物有關,主要原因是它們扮演著不同的角色。
宏基因組學(metagenomics)和轉錄組學(metatranscriptomics)的區別
元基因組學和元轉錄組學涉及對生物體內遺傳物質的分析。因此,元基因組學關注的是DNA的模式和序列,而亞轉錄組學是指對mRNA或轉錄的DNA的分析。元基因組學和基因組學之間的關鍵區別。
此外,提取過程在這兩種技術中是不同的;元基因組學涉及DNA提取程序,而轉錄組學涉及RNA提取程序。因此,這也是元基因組學和元轉錄組學的一個顯著區別。
下面的信息圖總結了元基因組學和元轉錄組學之間的區別:
總結 - 宏基因組學(metagenomics) vs. 轉錄組學(metatranscriptomics)
元基因組學和元轉錄組學是一個新的研究領域,它分析一個有機體群落的特定條件。因此,元基因組學是指對DNA序列的分析。相反,轉錄組學是指對RNA序列或轉錄的DNA產物的分析。在這方面,轉錄組學能夠識別特定病例的基因表達。兩者在分析突變及其影響時都很重要。這些都是早期診斷中使用的快速、可靠的技術。因此,這是元基因組學和元轉錄組學之間的區別的總結。
引用
1Aguiar Pulido,Vanessa等人。2016年5月12日《代謝組學、微生物組學和代謝組學方法》在線版。