巨集基因組學(metagenomics)和轉錄組學(metatranscriptomics)的區別

元基因組學和元轉錄組學之間的關鍵區別取決於每個領域研究的生物分子型別。元基因組學研究DNA及其序列及其在生物體中的行為,而metatranscriptomics研究轉錄的DNA,主要是mRNA序列及其在生物體中的行為。...

元基因組學和元轉錄組學之間的關鍵區別取決於每個領域研究的生物分子類型。元基因組學研究DNA及其序列及其在生物體中的行為,而metatranscriptomics研究轉錄的DNA,主要是mRNA序列及其在生物體中的行為。

元基因組學和元轉錄組學是近年來與微生物群落相關的兩個頗受歡迎的領域。它們在衛生保健、工業和農業生物技術中很重要。元基因組學和元轉錄組學都允許研究一個群落中的個體有機體及其功能作用,無論是有益的還是有害的。

目錄

1. 概述和主要區別
2. 什麼是元基因組學
3. 什麼是轉錄組學
4. 基因組學與轉錄組學的相似性
5. 並列比較-表格式的宏基因組學與元轉錄組學
6. 摘要

什麼是宏基因組學(metagenomics)?

元基因組學是探索脫氧核糖核酸(DNA)的研究領域。它與微生物群落關係最密切。而且,與基因組學相比,這是一個更先進的領域。在基因組學中,對特定生物體的DNA進行分析。然而,元基因組學涉及到對整個有機體的遺傳物質的分析。因此,這使得研究一個有機體群落與一個條件或一個環境有關的行為成為可能。

宏基因組學(metagenomics)和轉錄組學(metatranscriptomics)的區別

圖01:元基因組學

元基因組學研究的主要技術是使用微陣列技術的下一代測序技術。NGS方法可以分析單個反應中存在或不存在特定DNA序列的多個生物體。這些DNA序列可能是單一疾病或環境條件的原因。因此,利用亞基因組學知識,可以方便、準確地進行生物篩選。在NGS期間,測序是在短讀和分析有機體的DNA發生。16s DNA序列是近年來在微生物亞基因組學研究中的一個熱門序列。

在生物群落測序之後,應進行序列比對。使用基本局部對準序列工具(BLAST)等工具來完成對準任務。在排列之後,一個系統發生樹提供了群落中每一個有機體之間的關係及其行為的細節。

什麼是轉錄組學(metatranscriptomics)?

元轉錄組學是研究生物體轉錄組的一門學科。轉錄組構成在DNA轉錄過程中轉錄的整個RNA序列。轉錄組中的mRNA序列提供了有關基因表達的信息。元轉錄組學是對不同群體或群體的多個轉錄組的分析。

宏基因組學(metagenomics)和轉錄組學(metatranscriptomics)的區別

圖02:轉錄組分析

元轉錄組學研究也使用微陣列技術來尋找短讀序列的序列。此外,元轉錄組學還涉及使用比對工具和樹設計方法進行徹底的生物信息學分析。然而,相比元基因組學,元轉錄組學的研究要困難得多。從整體上提取mRNA或RNA並不像看上去那麼容易。由於RNA極易被破壞,並且生存時間很短,因此這些RNA的保存和保存是一個可能的問題。

宏基因組學(metagenomics)和轉錄組學(metatranscriptomics)的共同點

  • 宏基因組學和轉錄組學是分析生物群落(主要是微生物群落)的高通量技術。
  • 這兩種技術都使用微陣列技術來推斷研究結果。
  • 所獲得的結果通常使用BLAST比對和系統發育樹進行分析。
  • 而且,這兩種技術都不是針對一個有機體,而是針對一個群體或群落有機體。
  • 除此之外,這兩個概念的研究大多與微生物有關,主要原因是它們扮演著不同的角色。

宏基因組學(metagenomics)和轉錄組學(metatranscriptomics)的區別

元基因組學和元轉錄組學涉及對生物體內遺傳物質的分析。因此,元基因組學關注的是DNA的模式和序列,而亞轉錄組學是指對mRNA或轉錄的DNA的分析。元基因組學和基因組學之間的關鍵區別。

此外,提取過程在這兩種技術中是不同的;元基因組學涉及DNA提取程序,而轉錄組學涉及RNA提取程序。因此,這也是元基因組學和元轉錄組學的一個顯著區別。

下面的信息圖總結了元基因組學和元轉錄組學之間的區別:

宏基因組學(metagenomics)和轉錄組學(metatranscriptomics)的區別

總結 - 宏基因組學(metagenomics) vs. 轉錄組學(metatranscriptomics)

元基因組學和元轉錄組學是一個新的研究領域,它分析一個有機體群落的特定條件。因此,元基因組學是指對DNA序列的分析。相反,轉錄組學是指對RNA序列或轉錄的DNA產物的分析。在這方面,轉錄組學能夠識別特定病例的基因表達。兩者在分析突變及其影響時都很重要。這些都是早期診斷中使用的快速、可靠的技術。因此,這是元基因組學和元轉錄組學之間的區別的總結。

引用

1Aguiar Pulido,Vanessa等人。2016年5月12日《代謝組學、微生物組學和代謝組學方法》在線版。

  • 發表於 2020-10-17 07:08
  • 閱讀 ( 53 )
  • 分類:科學

你可能感興趣的文章

結構的(structural)和功能基因組學(functional genomics)的區別

結構基因組學和功能基因組學的關鍵區別在於,結構基因組學是研究基因組的物理性質,包括基因組的測序和作圖,而功能基因組學是研究基因組的表達和功能。 基因組學是生物學的一個領域,它涉及生物體的結構、組織、...

  • 發佈於 2020-09-16 00:27
  • 閲讀 ( 47 )

塔塔(tata)和caat箱(caat box)的區別

...T一致序列的保守核苷酸區域。 TATA-box和CAAT-box是影響真核基因轉錄的兩個核苷酸區。它們是在轉錄起始點上游發現的非編碼DNA序列。事實上,它們存在於調控區域,即啟動子。TATA盒和CAAT盒都對轉錄效率負責。它們是一致序列,...

  • 發佈於 2020-09-21 20:31
  • 閲讀 ( 46 )

基因複製(genocopy)和物候學(phenocopy)的區別

基因組學和表型學的主要區別在於,在基因組學上,表型表現出相似性,基因型發生變化;而在表型上,表型不同,基因型不變。 遺傳複製與物候學的差異,是解釋遺傳罕見現象的重要原因。這兩個概念展示了傳統遺傳學或...

  • 發佈於 2020-09-24 14:15
  • 閲讀 ( 35 )

同步(synteny)和共線性(collinearity)的區別

...一目的不同物種中的物理共定位。 共線性和共線性是在基因組學中可以互換使用的兩個術語。這兩個術語都描述了不同物種染色體上的基因定位模式。這些分類群間的相關基因排列在推斷基因共祖時是有價值的資訊。同一性是...

  • 發佈於 2020-09-24 22:43
  • 閲讀 ( 41 )

蛋白質組學(proteomics)和代謝組學(metabolomics)的區別

...研究,而代謝組學是對生物體內所有代謝產物的研究。 基因組學是研究有機體基因組成的學科。蛋白質組學和代謝組學是與基因組學相關的兩門組學。蛋白質組是指細胞或生物體內的所有蛋白質。另一方面,代謝組是指有機體...

  • 發佈於 2020-10-14 18:04
  • 閲讀 ( 43 )

外顯子(exome)和轉錄組(transcriptome)的區別

關鍵區別-外顯子組與轉錄組 基因包含編碼區和非編碼區。編碼序列稱為外顯子,非編碼序列稱為內含子。基因外顯子的核苷酸序列代表該基因合成特定蛋白質的遺傳密碼。因此,外顯子保留在mRNA分子中。基因組的外顯子區...

  • 發佈於 2020-10-15 15:55
  • 閲讀 ( 51 )

霰彈槍測序(shotgun sequencing)和下一代測序(next generation sequencing)的區別

...在單個測序實驗中分析整個人類基因組。此外,NGS可用於巨集基因組研究,檢測單個基因組中由於**和缺失等原因而產生的變異,以及基因表達的分析。此外,NGS可以同時分析大量組織的整個轉錄組。因此,NGS徹底改變了轉錄組...

  • 發佈於 2020-10-16 20:38
  • 閲讀 ( 50 )

有針對性的(targeted)和非靶向蛋白質組學(untargeted proteomics)的區別

靶向蛋白質組學與非靶向蛋白質組學的關鍵區別在於,靶向蛋白質組學旨在測量特定蛋白質的丰度,而非靶向蛋白質組學並不針對特定蛋白質。 蛋白質組學是對蛋白質及其結構和功能的大規模研究。它研究特定條件下細胞、...

  • 發佈於 2020-10-18 11:03
  • 閲讀 ( 32 )

蛋白質組學(proteomics)和轉錄組學(transcriptomics)的區別

...能。omic技術有著廣泛的應用。生物樣品的不同組學包括基因組學、蛋白質組學、轉錄組學和代謝組學。蛋白質組學是對生物體內所有蛋白質的全面研究。它被定義為生物體內所有表達的蛋白質的集合,它的結構和功能特性。因...

  • 發佈於 2020-10-19 18:02
  • 閲讀 ( 56 )

外顯子(exome)和rna測序(rna sequencing)的區別

...序在識別細胞的DNA和RNA組成以及區分編碼功能蛋白的某些基因方面非常重要;因此,測序可以用來理解這些基因和基因表達的突變。桑格測序法或更先進的下一代測序方法是常用的測序方法。外顯子測序是對生物體記憶體在的一...

  • 發佈於 2020-10-20 14:31
  • 閲讀 ( 58 )
stabletalent
stabletalent

0 篇文章

作家榜

  1. admin 0 文章
  2. 孫小欽 0 文章
  3. JVhby0 0 文章
  4. fvpvzrr 0 文章
  5. 0sus8kksc 0 文章
  6. zsfn1903 0 文章
  7. w91395898 0 文章
  8. SuperQueen123 0 文章

相關推薦