關鍵區別-外顯子組與轉錄組
基因包含編碼區和非編碼區。編碼序列稱為外顯子,非編碼序列稱為內含子。基因外顯子的核苷酸序列代表該基因合成特定蛋白質的遺傳密碼。因此,外顯子保留在mRNA分子中。基因組的外顯子區被稱為外顯子,是基因組的重要組成部分。基因的遺傳密碼被轉換成mRNA分子的遺傳密碼,這是生產蛋白質所必需的。在一個細胞或一個細胞群中一次轉錄的整個mRNA分子被稱為轉錄組。外顯子組和轉錄組的關鍵區別在於外顯子代表基因組外顯子區域的序列,而轉錄組代表細胞或組織在某一特定時間的總mRNA。
內容1。概述和主要區別2。什麼是Exome3。什麼是轉錄本4。並列比較-外顯子組與轉錄組5。摘要
什麼是外顯子(exome)?
基因由外顯子、內含子和調控序列組成。外顯子是在轉錄過程中轉錄成mRNA序列的基因區域。內含子和其他非編碼區在轉錄過程中被移除。外顯子的核苷酸序列決定了基因的遺傳密碼,該基因合成了它編碼的特定蛋白質。只有外顯子存在於蛋白質的mRNA中。基因組中外顯子的集合被稱為生物體的外顯子。它代表基因組的一部分,在基因中表達。在人類中,外顯子佔基因組的1%。它是人類基因組的蛋白質編碼部分。
什麼是轉錄組(transcriptome)?
轉錄組是特定組織中所有編碼和非編碼轉錄物(RNAs)的集合。轉錄組是細胞或組織中由基因表達的總mRNA分子的集合。一個細胞的轉錄組可以隨另一個細胞類型的轉錄組而變化。轉錄組也是動態的-它會隨著時間的推移而變化,以響應內部和外部的**。即使在同一組織或同一細胞類型內,轉錄組在幾分鐘後也會發生變化。
轉錄組不同於生物體的外顯子。轉錄組只包括表達的外顯子序列。雖然一個細胞的外顯子是相同的,但轉錄組在細胞間是不同的,因為所有細胞或組織的基因表達並不相同。只有必需基因在不同的細胞和組織中表達。基因表達是組織或細胞類型特異的過程。它受到包括環境因素在內的各種因素的調節。因此,轉錄組可以隨外界環境條件而變化。
轉錄組被用作蛋白質組學研究的前體。所有的蛋白質都來源於mRNA序列。翻譯修飾可以導致蛋白質的變化。然而,蛋白質組學研究為轉錄組學研究提供了重要的基礎信息。
外顯子(exome)和轉錄組(transcriptome)的區別
外顯子vs轉錄組 | |
外顯子是基因中蛋白質編碼區的集合。 | 轉錄組是包括mRNA在內的所有轉錄RNA的集合。 |
樣品 | |
外顯子利用DNA樣本進行研究。 | 轉錄組是用RNA樣本研究的。 |
研究方法 | |
全外顯子組測序是研究外顯子組的方法。 | RNA測序是研究轉錄組的一種方法。 |
總結 - 外顯子(exome) vs. 轉錄組(transcriptome)
外顯子是基因的編碼序列,決定蛋白質的mRNA序列。這些編碼序列(外顯子)的集合被稱為生物體的外顯子。在**蛋白質之前,基因被轉錄成mRNA分子。一個細胞或一個組織在任何特定時間的總mRNA分子被稱為轉錄組。轉錄組是指在任何給定的時間內被積極表達成mRNA的基因。轉錄組是細胞和組織特**的,並受環境條件的影響。這就是外顯子組和轉錄組的區別。
R參考文獻:1.Sarah et“12個人類外顯子的靶向捕獲和大規模平行測序”,《自然》。U、 美國國家醫學圖書館,2009年9月10日。網狀物。2017年4月1日,Mutz等人。“使用下一代測序進行轉錄組分析”,愛思唯爾:文章定位。N、 p.,2012年9月。網狀物。2017年4月1日