爆炸(blast)和法斯塔(fasta)的區別

BLAST和FastA的主要區別在於BLAST是國家生物技術信息中心網站上的一個基本對齊工具，而FastA是一個可在歐洲生物信息學研究所網站上找到的相似性搜索工具。

BLAST和FastA是兩個廣泛使用的軟件，用於比較不同物種的DNA、氨基酸、蛋白質和核苷酸的生物序列，並尋找它們的相似之處。這些算法都是在考慮速度的前提下編寫的。因為，上世紀80年代中期，當科學家們能夠在實驗室中分離出DNA時，就提出了比較和找到相同基因的需求，以便在高速下進行進一步的研究。因此，這兩個軟件的開發使得用戶可以用他們的查詢序列快速搜索相似的序列。

BLAST是Basic Local Alignment Search Tool的縮寫，它使用本地化方法比較兩個序列。FastA是一個軟件，指的是Fast a，其中a代表所有。在這裡，該軟件與字母表一起工作，如用於DNA測序的Fast A和用於蛋白質的Fast P。BLAST和FastA在比較任何基因組數據庫方面都非常快，因此，在節省時間的同時，在經濟上是非常可行的。

什麼是爆炸(blast)？

BLAST是1990年開發的應用最廣泛的生物信息學軟件之一。從那時起，NCBI站點上的每個人都可以使用它。此外，任何人都可以訪問並使用該軟件。此外，BLAST是一種需要輸入FastA格式數據或序列的軟件。但是，它以純文本、HTML或XML格式提供輸出數據。BLAST的工作原理是搜索兩個序列之間的局部相似性，並將相似序列短列表，然後搜索鄰域相似性。

圖01：爆炸結果

因此，該軟件搜索大量相似的局部區域，並在達到閾值時給出結果。然而，這個過程不同於早期的軟件，它先搜索整個序列，然後進行比較，因此花費了大量的時間。

除了上述相似性檢查，BLAST還有許多其他用途，如DNA定位、比較不同物種的兩個相同基因、創建系統發育樹等。

什麼是法斯塔(fasta)？

FastA是一個蛋白質序列比對軟件。大衛·J·利普曼和威廉·R·皮爾森在1985年描述了這個軟件。雖然這個軟件最初只是用來比較蛋白質序列，但它的改進版也能比較DNA序列。在這裡，這個軟件使用的原理是尋找兩個序列之間的相似性統計。它通過局部序列比對方法將DNA或蛋白質的一個序列與另一個序列相匹配。

圖02:FastA

然而，它搜索局部區域以尋找相似性，而不是兩個序列之間的最佳匹配。由於該軟件有時會比較本地化的相似性，因此也會出現不匹配的情況。在一個序列中，FastA佔用一小部分稱為k元組，其中的元組可以是1到6，並與另一個序列的k元組相匹配。在匹配過程的最後，當它達到一個閾值時，它產生結果。

爆炸(blast)和法斯塔(fasta)的共同點

BLAST和FastA是用於比較蛋白質和DNA序列相似性的生物信息學工具。
另外，兩個程序都使用評分策略來比較序列。
此外，這兩種工具都能產生非常精確的結果。

爆炸(blast)和法斯塔(fasta)的區別

BLAST是一種檢查生物序列相似性的工具。另一方面，FastA是另一個促進蛋白質和DNA序列相似性檢查的程序。然而，與FastA相比，BLAST軟件非常受歡迎，因為它可以產生更準確和更快速的結果。因此，這就是BLAST和FastA之間的區別。此外，與FastA不同，BLAST程序可以根據用戶的需要進行修改。因此，這是BLAST和FastA的另一個區別。

下面關於BLAST和FastA之間差異的信息圖提供了更多細節。

爆炸(blast)和法斯塔(fasta)的區別

總結 - 爆炸(blast) vs. 法斯塔(fasta)

BLAST和FastA是兩個程序，允許用戶將自己的查詢序列與現有數據庫中的序列進行比較並檢查相似性。FastA最初的目的是比較蛋白質序列。但是，這個軟件的改進版便於蛋白質和DNA序列的比較。儘管FastA是一個很好的軟件，但大多數人使用BLAST對齊工具，因為它比FastA更受歡迎，並且產生更精確和更快速的結果。此外，爆炸工具可根據用戶要求進行修改。簡而言之，本文總結了BLAST和FastA的區別。