如何dna微阵列在基因组学研究中的应用(dna microarrays used in the study of genomics)

DNA微阵列是附着在固体表面的DNA斑点的集合。在基因组学研究中,DNA微阵列既可以用来同时测量大量基因的表达水平,也可以用来研究基因组的不同区域。...

DNA微阵列是附着在固体表面的DNA斑点的集合。在基因组学研究中,DNA微阵列既可以用来同时测量大量基因的表达水平,也可以用来研究基因组的不同区域。

DNA微阵列中使用的显微芯片由高度特**的探针组成,这些探针与目标DNA序列互补。这些探针可能是基因的一部分。因此,每个DNA点都能容纳基因组的特定DN**段。基因组序列的信息可以用来分析特定生物体在发育过程或特定生理反应过程中的完整转录程序。

覆盖的关键领域

1.什么是DNA微阵列-定义、目的、点2.DNA微阵列如何用于基因组学研究-转录分析

关键词:cDNA、DNA微阵列、荧光、基因组序列、mRNA、转录

如何dna微阵列在基因组学研究中的应用(dna microarrays used in the study of genomics)

什么是dna微阵列(dna microarrays)?

DNA微阵列是指一组高密度的单链DNA分子附着在固体表面。它用于同时分析成千上万个基因的表达。一般来说,每个基因编码区约1kb的部分应用于显微镜载玻片表面的密集斑点上。通常,一个数组/基因芯片×2厘米含有大约6000个DNA斑点。DNA微阵列芯片如图1所示。

How are DNA Microarrays Used in the Study of Genomics

Figure 1: DNA Microarray

dna微阵列如何用于基因组学研究

DNA微阵列可以用来鉴定基因在基因组中的表达。这个过程包括在特定的生理条件下分离特定类型细胞的总mRNA。然后进行反转录反应,从mRNA产生cDNA。这里,DNA引物与含有低浓度绿色荧光染料标记核苷酸的DNA核苷酸一起使用。该cDNA与芯片中的互补DNA探针杂交。如果要比较两个基因组,第二个基因组的cDNA可以用另一种颜色的荧光染料(如红色)标记。DNA微阵列的程序如图2所示。

How are DNA Microarrays Used in the Study of Genomics_Figure 2

Figure 2: DNA Microarray Procedure

基因芯片可以在扫描激光显微镜下进行荧光发射分析。在DNA微阵列中,靶DNA与DNA探针的适当杂交产生相应的荧光颜色。由于DNA微阵列是通过应用已知的DNA序列产生的,因此可以识别基因组中表达的基因。通过基因组学获得的DNA序列的知识对于DNA微阵列的生产至关重要,特别是对于特定的目标基因组。

结论

DNA微阵列是包含特定DNA探针斑点的显微芯片。这些斑点可以与从目标基因组制备的DNA杂交,以确定在特定生理条件下的表达水平。

引用

“哈维,洛迪什。”DNA微阵列:分析全基因组表达 分子细胞生物学。第4版,美国国家医学图书馆,1970年1月1日,可在这里获得。

  • 发表于 2021-06-30 13:44
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  • 分类:科学

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