关键区别-蛋白质组学与转录组学
组学技术是当前的一种趋势,在这种技术中,生物体的不同生物分子被视为一个整体,涉及其性质和功能。omic技术有着广泛的应用。生物样品的不同组学包括基因组学、蛋白质组学、转录组学和代谢组学。蛋白质组学是对生物体内所有蛋白质的全面研究。它被定义为生物体内所有表达的蛋白质的集合,它的结构和功能特性。因此,全套蛋白质形成了蛋白质组。转录组学是对生物体内所有信使RNA(mRNA)分子的完整研究。因此,转录组学研究的是在生物体内活跃表达的基因。一个生物体内的全部mRNA被称为转录组。蛋白质组学和转录组学的关键区别在于生物分子的类型。在蛋白质组学中,研究的是一个活的有机体中表达的全部蛋白质,而在转录组学中,研究的是一个活的有机体的总mRNA。
目录
1. 概述和主要区别
2. 什么是蛋白质组学
3. 什么是转录组学
4. 蛋白质组学与转录组学的相似性
5. 并列比较-蛋白质组学与表格式转录组学
6. 摘要
什么是蛋白质组学(proteomics)?
蛋白质组学一词于1995年提出,最初定义为细胞、组织或有机体中的总蛋白补体。随着蛋白质组学研究的进展,它被修改为一个包含许多研究领域的总括术语。目前,蛋白质组学主要研究蛋白质的结构、取向、功能、相互作用、修饰、应用和重要性。因此,目前在蛋白质组学领域进行了大量的研究。
首次进行蛋白质组学研究,以鉴定大肠杆菌中的蛋白质含量。用二维凝胶绘制总蛋白含量。在这项研究成功之后,科学家们开始研究豚鼠和老鼠等动物体内的总蛋白质含量。目前,人类蛋白质定位是用二维凝胶电泳进行的。
蛋白质组学应用
蛋白质组学的研究有很多优点,因为蛋白质的催化特性决定了蛋白质是大多数活性的控制分子。因此,对整个蛋白质的研究可以提供有关生物体健康状况的信息。一些应用是;
- Genome annotation: By studying the protein content of an organi**, the exact genomes resp***ible for the active protein compound can be determined. In this scenario results from all genomics, Transcriptomics and proteomics are important.
- Disease identification / Diagnostics: Proteomics is used in the identification of the disease condition, by comparing the healthy and the diseased
- To carry out protein expression studied during experimentation.
- Protein modificati*** and interaction studies: In order to use proteins in vitro conditi*** or and in vivo conditi***, to decide the storage conditi*** of these extracted proteins and to study the behaviour of the protein in in vitro, in vivo and in – silico methods.
蛋白质组学涉及不同的技术
- Extraction of the total protein and separating the proteins using 2D gel electrophoresis. Proteins can also be separated using High-Performance Liquid Chromatography (HPLC).
- Sequencing of the extracted proteins using methods such as Edmund’s sequencing method or Mass spectrometry.
- Once the sequences are identified, structural and functional properties of the protein content are ****yzed using computer-based software and bioinformatics tools.
什么是转录组学(transcriptomics)?
转录组这一术语是最近发明的。转录组学是研究有机体总mRNA含量的学科。总mRNA是生物体或细胞中表达的DNA。完整的mRNA集合称为转录组。
分析转录组的步骤包括:,
- Extraction of RNA, separation of mRNA using column gel chromatography with poly DT beads.
- The sequencing of the mRNA is done.
微阵列技术是鉴定生物体转录组的一种常用方法。微阵列技术包括一个带有转录组互补链的探针板。杂交后,可以对存在于生物体或细胞中的mRNA进行鉴定。
转录组学已广泛应用于医学领域。疾病诊断和疾病分析是转录组学应用的主要领域。通过分析一个有机体的转录组,可以识别出外来的mRNA,如果有感染,就可以鉴定出来。非编码RNA可以使用转录组技术分离。并可监测不同环境胁迫下基因的表达。
蛋白质组学(proteomics)和转录组学(transcriptomics)的共同点
- 两者都构成了经济技术概念的一部分。
- 二者都用于疾病诊断和生物体的疾病特征描述。
- 这两个研究领域都涉及生物分子的提取、分离和测序步骤。
蛋白质组学(proteomics)和转录组学(transcriptomics)的区别
蛋白质组学与转录组学 | |
蛋白质组学是对生物体内所有蛋白质的全面研究。 | 转录组学是对生物体内所有信使RNA(mRNA)分子的完整研究。 |
研究生物分子类型 | |
蛋白质组学研究蛋白质。 | mRNA在转录组学中被研究。 |
研究因素 | |
蛋白质组学主要研究蛋白质的结构、功能、相互作用、修饰和应用。 | 研究了mRNA的序列结构、与环境的相互作用及其在转录组学中的应用。 |
总结 - 蛋白质组学(proteomics) vs. 转录组学(transcriptomics)
组学在生命科学领域发挥着重要作用。蛋白质组学是指在细胞或生物体内形成完整的蛋白质集合的蛋白质组学。转录组学是指对转录组的研究,转录组是以mRNA形式表达的一整套DNA。蛋白质组学和转录组学这两个研究领域是在引入基因组学之后发展起来的,目前广泛应用于医学诊断和生物体的鉴定和筛选。这就是蛋白质组学和转录组学的区别。
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引用
1.霍根、理查德·P和路易丝·C·肯尼。“组学技术:基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学”,《妇产科医生》,Blackwell出版公司,2011年7月18日。可在2.Graves,Paul R.和Timothy A.J.Haystead获取。“蛋白质组学分子生物学家指南”,《微生物学和分子生物学评论》,美国微生物学学会,2002年3月。可在此处查阅3。Lowe,Rohan等人。“转录组学技术”,《公共科学图书馆公共科学》计算生物学,2017年5月。可在此处查阅
2.格雷夫斯,保罗·R.和蒂莫西·A·J·海斯特德。“蛋白质组学分子生物学家指南”,《微生物学与分子生物学评论》,美国微生物学学会,2002年3月
3.Lowe,Rohan等人。“转录组学技术”,公共科学图书馆,公共科学图书馆,2017年5月