关键区别-微阵列与下一代测序
DNA测序技术广泛应用于生物技术、病毒学、医学诊断和法医学等领域。它是一个确定DNA分子中核苷酸、腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶和胞嘧啶的确切顺序的过程。DNA测序程序已成为医学和生物学研究中奇迹性发现的促进剂。这些测序方法已经发展到对包括人类和其他生物在内的单个生物体的完整基因组进行测序。微阵列和下一代测序是现代DNA测序程序。微阵列技术是基于包含一组已知靶点的杂交技术。下一代测序是基于合成(利用DNA聚合酶结合核苷酸),并且能够独立于先前选择的靶点对整个基因组进行测序。这是微阵列和下一代测序的关键区别。
目录
1. 概述和主要区别
2. 什么是微阵列
3. 什么是下一代测序
4. 微阵列与下一代测序的相似性
5. 并列比较-微阵列与下一代列表测序
6. 摘要
什么是微阵列(microarray)?
DNA微阵列作为一种实验室工具,可以同时识别数千种不同的基因表达。它是一个固体表面,即显微镜载玻片,上面有一系列微小的DNA斑点。每个印刷点包含一个已知的基因序列或一个基因。这些已知的探针印在载玻片上作为探针,以检测基因表达。这被称为转录组。两条DNA链之间的杂交是微阵列的主要原理。它是核酸序列与氢键形成的互补碱基配对。
最初,信使核糖核酸分子是从实验样本和健康人的参考样本中采集的。实验样本来自患病的个体;例如,患有癌症的个体。一旦获得,两个mRNA样本都转化为cDNA(互补DNA)。接下来,用荧光探针标记每个样品。荧光探针的颜色不同,以区分样本cDNA和参考cDNA。为了启动cDNA分子与微阵列载玻片的结合,将两个样品混合在一起。杂交是将cDNA分子连接到微阵列载玻片上的DNA探针上的过程。一旦杂交完成,就会发生一系列反应,根据基因的表达量来鉴定和测量每个基因的表现,这些基因的颜色不同。微阵列的结果被用来建立一个基因表达谱,可以用来识别不同的疾病状况。
什么是下一代测序(next generation sequencing)?
下一代测序是一种先进的遗传测序方法。其原理类似于桑格测序,后者依赖于毛细管电泳。在NGS中,基因组链片段化并连接到模板链上。每一条链的碱基都是通过连接过程中发出的信号来识别的。Sanger测序法包括测序、分离和检测三个步骤。由于这些单独的步骤,样品制备的自动化在处理量上受到限制。在NGS中,该技术采用基于阵列的测序技术,结合Sanger测序的步骤,可以使数百万个反应序列同时并行执行,从而以较低的成本实现了高速度和吞吐量。
NGS由三个步骤组成:文库准备(使用随机DN**段创建文库)、扩增(使用克隆扩增和PCR扩增文库)和测序。使用Sanger测序程序进行的基因组测序过程可以在使用NGS的几小时内完成。
什么是微阵列与下一代测序的相似性(the similarity between microarray and next generation sequencing)?
- 微阵列和下一代测序都是使用基于阵列的测序技术开发的。
微阵列(microarray)和下一代测序(next generation sequencing)的区别
微阵列与下一代测序 | |
微阵列是附着在固体表面上的微小DNA点的集合,用来同时测量大量基因的表达水平。 | NGS(Next generation sequencing,下一代测序)是一种基于非Sanger的高通量DNA测序技术,它可以使数百万或数十亿条DNA链并行测序。 |
与抗原的相互作用 | |
微阵列是基于由一组已知靶点组成的杂交技术。 | NGS基于DNA聚合酶结合核苷酸的合成,与先前选择的靶点无关。 |
总结 - 微阵列(microarray) vs. 下一代测序(next generation sequencing)
在研究的背景下,DNA测序已经成为一种重要的促进剂。它广泛应用于生物技术、医学诊断和法医学研究。它已经发展成为更高效和快速的测序程序。微阵列和NGS是目前两种先进的DNA测序技术。这两种方法都是基于数组的。微阵列技术依赖于杂交,而NGS则基于合成,即利用DNA聚合酶结合核苷酸。这是微阵列和下一代测序的主要区别。
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引用
1.贝哈提、萨姆和帕特里克的塔皮。“什么是下一代测序?儿童疾病档案。教育与实践版,BMJ出版集团,2013年12月,可在此处获取。访问日期:2017年8月23日。Bumganner,Roger。“dna微阵列概述”,当前分子生物学协议,John Wiley and S*** Inc.,2016年2月9日,可在此处查阅。2017年8月23日查阅。3.“DNA微阵列技术”,国家人类基因组研究所(NHGRI),可在此处查阅。访问日期:2017年8月23日。
2.邦加纳,罗杰。“dna微阵列概述”,《分子生物学中的当前协议》,John Wiley and S*** Inc.,2016年2月9日,
3.“DNA微阵列技术”,国家人类基因组研究所(NHGRI),