NGS和WGS的关键区别在于,下一代测序(NGS)是一种大规模并行的第二代测序技术,具有高通量、低成本和快速的特点,而全基因组测序(WGS)是一种利用Sanger测序、shotgun测序或高通量NGS测序等测序技术一次性分析细胞全基因组DNA的综合方法。
在过去的几十年里,由于快速测序技术和生物信息学工具的发现,人们对人类和其他动物基因组的理解有了很大的提高。传统的测序技术如Sanger测序有其局限性,这就要求开发新的快速测序方法,如下一代测序(NGS)和纳米孔测序。全基因组测序(WGS)技术是近年来发展起来的一种新技术,已经应用于许多基因组研究项目中,如英国基因组研究所的100000基因组计划。因此,NGS和WGS是两种测序方法,目前已被纳入许多基因组项目。
1. 概述和主要区别 2. 什么是NGS 3. 什么是WGS 4. 相似性–NGS和WGS 5. 表格形式的NGS与WGS 6. 总结-NGS与WGS
NGS(next-generati***equencing)是一种大规模并行的第二代测序技术,具有高通量、低成本、快速等优点。下一代测序没有精确的定义。但我们可以清楚地将其与传统的毛细管测序技术区分开来。下一代测序允许在一次实验中对总大小大于100万碱基对的DNA分子进行测序。它提供了前所未有的速度和高通量的选择,例如允许同时对多个个体的DNA进行测序。这是通过缩小单个测序反应的体积来实现的。此外,这也限制了仪器的尺寸,并将每个反应的试剂成本降至最低。
图01:NGS平台
NGS是一种短阅读测序方法,已经彻底改变了生物学研究领域。此外,NGS还应用于多个领域,如从头基因组测序、全基因组测序、转录组分析、小RNA和微RNA测序、靶向重测序和全外显子组测序。
WGS(whole genome sequencing,全基因组测序)是一种利用Sanger测序、shotgun测序或高通量NGS测序等测序技术一次性分析细胞全基因组DNA的综合方法。它也被称为全基因组测序或全基因组测序。全基因组测序需要对一个有机体的所有染色体DNA以及线粒体中的DNA进行测序,而对植物来说,则需要对叶绿体中的DNA进行一次测序。WGS使科学家能够读取构成完整DNA的所有字母的精确序列。使用NGS平台的WGS有望彻底改变临床设置。
图02:WGS与分层鸟枪排序
全基因组测序于2014年引入临床护理。此外,WGS的应用包括SNP水平的基因测序,以确定关联研究中的功能性变体,个性化医学中的治疗干预,进化生物学,比较基因组分析,突变和重排研究,罕见变异关联研究,预测疾病易感性和药物反应。
NGS是一种高通量、低成本、快速的大规模并行第二代测序技术,而WGS是一种利用Sanger测序、shotgun法或高通量NGS测序等测序技术一次性分析细胞全基因组DNA的综合方法。所以,这就是NGS和WGS之间的关键区别。此外,NGS只包括第二代测序方法,而WGS包括第一代、第二代和第三代测序方法。
下表以表格形式列出了与NGS和WGS之间的差异,以便进行并列比较。
在过去的几十年里,不同的测序技术在现代分子研究中得到了广泛的应用。甚至对于许多临床应用来说,它们也是非常强大的工具。NGS和WGS是两种测序方法,目前已被纳入许多基因组项目。NGS是一种高通量、低成本、快速的第二代测序技术。另一方面,WGS是一种通过使用测序技术(如Sanger测序、shotgun法或高通量NGS测序)一次性分析细胞的整个基因组DNA或全基因组DNA的方法。所以,这是NGS和WGS之间差异的总结。
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