纳米孔(nanopore)和illumina测序(illumina sequencing)的区别

纳米孔测序和illumina测序的关键区别在于,纳米孔测序是第三代测序技术,它使用纳米孔来检测DNA分子的序列,而illumina测序是第二代测序技术,它使用可逆染料终止剂技术来检测DNA分子的序列。...

纳米孔测序和illumina测序的关键区别在于,纳米孔测序是第三代测序技术,它使用纳米孔来检测DNA分子的序列,而illumina测序是第二代测序技术,它使用可逆染料终止剂技术来检测DNA分子的序列。

DNA测序是对DNA分子的精确核苷酸或碱基序列的测定。有许多快速测定核酸序列的方法可以加速生物学和医学的研究发现。最早的DNA测序技术之一(Sanger测序)是由Frederick Sanger于1975年在英国剑桥MRC中心采用引物延伸策略开发的。如今,大多数快速DNA测序技术属于第二代(下一代)和第三代DNA测序范畴。纳米孔和illumina测序是两种新的DNA技术。

目录

1. 概述和主要区别 2. 什么是纳米孔测序 3. 什么是Illumina测序 4. 相似之处–纳米孔和Illumina测序 5. 纳米孔与Illumina的列表测序 6. 总结-纳米孔与Illumina测序

什么是新型纳米孔测序法(nanopore sequencing)?

纳米孔测序是第三代测序技术,它利用蛋白质纳米孔来检测DNA分子的核酸序列。在纳米孔测序中,通过纳米孔的DNA改变其电流。这种变化取决于DNA序列的形状、大小和长度。结果信号被解码得到特定的DNA或RNA序列。这种方法不需要修饰核苷酸,而且实时进行。

纳米孔(nanopore)和illumina测序(illumina sequencing)的区别

图01:纳米孔测序

牛津纳米孔技术公司是一家受欢迎的公司,生产许多纳米孔测序设备。大多数牛津纳米孔测序装置都有流动细胞。这种流动池有许多微小的纳米孔,这些孔嵌在电阻膜中。每个纳米孔对应于它自己的电极。该电极连接到通道和传感器芯片。这种电极测量流过纳米孔的电流。当一个分子通过一个纳米孔时,它的电流发生变化或被破坏。此外,这种破坏会产生一种特征性的蠕动。然后对这个波形进行解码,以实时确定DNA或RNA序列。

什么是illumina测序(illumina sequencing)?

Illumina测序是一种第二代测序技术,它使用可逆染料终止剂技术来检测DNA分子的序列。Solexa公司,现在是Illumina公司的一部分,成立于1998年。这家公司发明了这种基于可逆染料终止剂技术和工程聚合酶的测序方法。

纳米孔(nanopore)和illumina测序(illumina sequencing)的区别

图02:Illumina测序

在illumina测序方法中,首先将样品切割成短切片。因此,在illumina测序中,100-150bp的短读取或片段是在开始时产生的。然后将这些片段连接到通用适配器上并退火到载玻片上。PCR扩增每个片段。这将创建一个包含同一片段的多个副本的点。随后,它们被分离成单链并进行测序。测序载玻片包含荧光标记的核苷酸、DNA聚合酶和终止子。因为有终止符,一次只添加一个基。每个循环终止符被移除,并且它允许向站点添加下一个碱基。此外,基于荧光信号,计算机检测每个周期中添加的碱基。Illumina测序技术在4到56小时内构建序列。

纳米孔(nanopore)和illumina测序(illumina sequencing)的共同点

  • 纳米孔测序和illumina测序是两种测序技术。
  • 两者都是快速和新的测序方法。
  • 它们被用来检测DNA和RNA序列。
  • 两者都有很高的精确度。

纳米孔(nanopore)和illumina测序(illumina sequencing)的区别

纳米孔测序是第三代测序技术,它使用纳米孔来检测DNA分子的序列。相比之下,illumina测序是第二代测序技术,它使用可逆染料终止剂技术来检测DNA分子的序列。o、 这是纳米孔和illumina测序的关键区别。此外,纳米孔测序的准确率为92-97%,而illumina测序的准确率为99%。

以下信息图以表格形式列出了纳米孔和illumina测序之间的差异。

总结 - 纳米孔(nanopore) vs. illumina测序(illumina sequencing)

高通量测序技术包括第二代(短读)和第三代(长读)测序方法。纳米孔和illumina测序是两种新的DNA技术,属于第三代和第二代(下一代)DNA测序范畴。纳米孔测序使用纳米孔来检测DNA分子的序列。另一方面,illumina测序使用可逆染料终止技术来检测DNA分子的序列。因此,这是纳米孔和illumina测序之间差异的总结。

引用

1.“DNA测序”,牛津纳米孔技术公司Illumina染料测序。“概述|科学直接主题。 2. “

  • 发表于 2021-07-14 02:30
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  • 分类:科学

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