生物信息学是一个利用计算机存储和分析分子生物信息的领域。利用这些数字格式的信息,生物信息学可以解决分子生物学问题,预测结构,甚至模拟大分子。从更一般的意义上说,生物信息学可以用来描述计算机在生物学中的任何用途,但分子生物学的特定定义是迄今为止最常见的。
21世纪初,科学家开始对整个物种的基因组进行测序,并将其存储在计算机上,从而允许使用生物信息学来模拟和跟踪一些有趣的事情。其中一个应用是推断物种的进化变化。通过检查基因组并观察其随时间的变化,进化生物学家实际上可以追踪进化过程。
生物信息学最著名的应用是序列分析。在序列分析中,各种生物体的DNA序列存储在数据库中,以便检索和比较。被广泛报道的人类基因组计划是序列分析生物信息学的一个例子。使用大型计算机和各种收集序列的方法,整个人类基因组被测序并存储在结构化数据库中。
用于生物信息学的DNA序列可以通过多种方式收集。一种方法是遍历基因组,搜索出要记录和存储的单个序列。另一种方法是简单地抓取大量片段并将其全部进行比较,通过重叠冗余片段找到完整序列。后一种被称为鸟枪测序的方法,由于其简单和快速,目前最受欢迎。
通过将已知的基因组序列与特定的突变进行比较,可以收集到许多关于癌症等不良突变的信息。随着人类基因组图谱的完成,生物信息学在癌症研究中变得非常重要,希望最终治愈癌症。
计算机也被用来收集和存储更广泛的物种数据。例如,物种2000项目旨在收集地球上每种植物、真菌和动物的大量信息。这些信息可以用于许多应用,包括跟踪种群和生物群落的变化。
生物信息学还有许多其他应用,包括预测整个蛋白质链,了解基因如何在不同物种中表达,以及构建整个细胞的复杂模型。随着计算能力的提高和我们的基因和分子信息数据库的扩展,生物信息学领域肯定会急剧增长和变化,使我们能够建立具有难以置信的复杂性和实用性的模型。
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