尽管乳果糖被誉为治疗顽固性便秘的有效药物，但它被认为是一种非常安全的药物。虽然这种碳水化合物分子不能被人体消化或吸收，但天然肠道菌群能够消耗糖，从而产生各种生物活性废物。这些细菌废物包括肠道气体、促进蠕动的酸等粪便填充剂，以及羧酸等间接软化粪便的化学物质，所有这些都有助于肠道排空。乳果糖的细菌代谢产生的增加的肠道酸度也有利于在肠道中产生氨而不是氨，这表明较高的乳果糖剂量可能有助于预防或治疗肝性或门脉系统性脑病。当用于治疗小儿脑病或便秘时，可使用较低剂量的乳果糖
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该药物通常以液体形式给药，口服或直肠灌肠。接受慢性便秘治疗的成年人通常每天口服一次初始乳果糖剂量为15毫升。虽然建议在睡前服用第二次维持剂量，但由于药物倾向于促进排便的迫切需要，这是不可取的。相反，许多医生更喜欢重新评估起始乳果糖剂量，根据需要以小增量增加剂量，以实现症状突破，然后再将剂量降低到足以控制症状的水平。然而，剂量的增加往往伴随着副作用的发生率和严重程度的增加，如肠胃胀气、肠胀气和痉挛
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虽然治疗成人急性便秘可能遵循相同的乳果糖剂量指南，但患有急性或慢性腹泻的儿童应服用较低剂量的乳果糖。儿童患者的建议初始剂量为每天分次给药，每2.2磅（约1千克）体重1至3毫升。儿童或成人在24小时内使用的药物不得超过60毫升，因为过量的症状可能会危及生命。

成人门脉系统性或肝性脑病的治疗为每日三次口服30毫升，远远高于最初建议用于治疗便秘的剂量。30至45毫升的维持剂量也可每天三次。在严重情况下，可每小时服用30至45毫升乳果糖，直到症状消失。14岁以下的儿童通常每天分次服用40毫升至90毫升的药物，而婴儿则应以同样的方式服用2.5毫升至10毫升的药物。如果出现腹泻，患者应停止治疗，直到达到正常肠功能，然后评估较低剂量水平的效果。。