α螺旋(alpha helix)和貝塔褶皺床單(beta pleated sheet)的區別

α螺旋和β摺疊片是多肽鏈中最常見的兩種二級結構。這兩個結構成分是摺疊多肽鏈過程中的第一個主要步驟。Alpha螺旋和Beta褶皺片的主要區別在於它們的結構;它們有兩種不同的形狀來完成特定的工作。...

α螺旋(alpha helix)和貝塔褶皺床單(beta pleated sheet)的區別

α螺旋和β摺疊片是多肽鏈中最常見的兩種二級結構。這兩個結構成分是摺疊多肽鏈過程中的第一個主要步驟。Alpha螺旋和Beta褶皺片的主要區別在於它們的結構;它們有兩種不同的形狀來完成特定的工作。

什麼是α螺旋(alpha helix)?

α螺旋是多肽鏈上氨基酸殘基的右旋螺旋。氨基酸殘基的範圍從4到40個不等。在頂部線圈的C=O基團的氧和底部線圈的N-H基團的氫之間形成的氫鍵有助於將線圈固定在一起。以上述方式,鏈中每四個氨基酸殘基就形成一個氫鍵。這種均勻的圖案賦予了它明確的特徵,如線圈的厚度,並規定了沿螺旋軸的每一整圈的長度。α-螺旋結構的穩定性取決於幾個因素。

α螺旋(alpha helix)和貝塔褶皺床單(beta pleated sheet)的區別

紅色為O原子,藍色為N原子,綠色虛線為氫鍵

什麼是貝塔褶皺床單(beta pleated sheet)?

β摺疊片,又稱β摺疊片,是蛋白質二級結構的第二種形式。它包含β鏈,這些鏈通過至少兩個或三個主鏈氫鍵橫向連接,形成扭曲的褶皺薄片,如圖所示。β鏈是多肽鏈的延伸,它的長度一般等於3到10個氨基酸,包括延伸確認的主鏈。

α螺旋(alpha helix)和貝塔褶皺床單(beta pleated sheet)的區別

過氧化氫酶晶體結構中的4鏈反平行β片片段。a)顯示相鄰鏈上肽NH和CO基團之間的反平行氫鍵(點)。箭頭表示鏈方向,電子密度輪廓勾勒出非氫原子。O原子是紅色的球,N原子是藍色的,為了簡單起見省略了H原子;側鏈只顯示在中央兩條β鏈的第一個側鏈C原子(綠色)b)邊上

在β-摺疊片中,多肽鏈彼此並排排列。由於結構的波浪狀外觀而得名“褶皺片”。它們通過氫鍵連接在一起。這種結構允許通過伸展多肽鏈形成更多的氫鍵。

α螺旋(alpha helix)和貝塔褶皺床單(beta pleated sheet)的區別

α-螺旋結構和β-摺疊片

α螺旋:

在這個結構中,多肽主鏈緊緊地圍繞著一個假想的軸,形成一個螺旋結構。它也被稱為螺旋鏈排列。

當多肽鏈被扭曲成螺旋狀時,α-螺旋結構的形成就發生了。這使得鏈中的所有氨基酸相互之間形成氫鍵(氧分子和氫分子之間的鍵)。氫鍵使螺旋保持螺旋形狀,形成緊密的線圈。這種螺旋形狀使α螺旋非常強。

α螺旋(alpha helix)和貝塔褶皺床單(beta pleated sheet)的區別

氫鍵用黃點表示。

貝塔褶皺床單:

當兩個或多個多肽鏈片段相互重疊,形成一排氫鍵時,可以發現以下結構。它可以通過兩種方式發生:平行排列和反平行排列。

結構示例:

α螺旋:指甲或腳趾甲可以作為α螺旋結構的一個例子。

β褶片:羽毛的結構與β褶片的結構相似。

結構特點:

α-螺旋:在α-螺旋結構中,每轉一圈有3.6個氨基酸。所有的肽鍵都是反式的和平面的,並且肽鍵中的N-H基團指向同一個方向,與螺旋軸大致平行。所有肽鍵的C=O基團指向相反的方向,它們平行於螺旋軸。每個肽鍵的C=O基團與肽鍵的N-H基團結合形成氫鍵。所有的R-群從螺旋線向外指向。

β摺疊片:β摺疊片中的每個肽鍵都是平面的,具有反式構象。相鄰鏈上肽鍵的C=O和N-H基團在同一平面上,相互指向,在它們之間形成氫鍵。任何鏈中的所有R-群可以交替地出現在薄板平面的上方和下方。

定義:

References: “Protein Structure”. ChemWiki: The Dynamic Chemistry Hypertext “Protein Secondary Structure: α-Helices and β-Sheets” . Proteinstructures.com by Salam Al Karadaghi “Organic Chemistry”. The Virtual Cell Textbook “Beta Sheet”.Wikipedia   Image Courtesy: “Helix electron density myoglobin 2nrl 17-32” By Dcrjsr – Own work (CC BY 3.0) via Comm*** Wikimedia “Protein secondary structure” by en:User:Bikadi (CC BY-SA 3.0) via Comm*** Wikimedia  “1gwe antipar beta Sheet both” by Dcrjsr – Own work (CC BY 3.0) via Comm*** Wikimedia 
  • 發表於 2020-10-28 09:06
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