在遗传学中,什么是鸟枪法?

鸟枪法用于对脱氧核糖核酸(DNA)分子的长链进行测序。它依赖于另一种称为链终止法的DNA测序方法。通过鸟枪法,科学家们对DNA链的部分序列进行排序,并利用结果创建一个连续序列。...
Scientists sequence parts of a DNA strand in the shotgun method.

鸟枪法用于对脱氧核糖核酸(DNA)分子的长链进行测序。它依赖于另一种称为链终止法的DNA测序方法。通过鸟枪法,科学家们对DNA链的部分序列进行排序,并利用结果创建一个连续序列。

测序是找到分子的原子组成并研究将这些原子结合在一起的化学键的过程。在DNA中,测序是用来找出某些分子发生的顺序。这些分子被称为核苷酸。这四个核苷酸碱基是腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶。

Shotgun sequencing is now the preferred method for many kinds of genome sequencing.

测序长链DNA的一种方法是使用鸟枪法。在这种方法中,DNA被分解成随机片段。然后使用称为链终止法的方法对产生的片段进行排序。链终止是短DNA序列的首选方法。与其他短序列方法相比,它使用的化学物质较少,放射性也较低。

The shotgun method has largely been supplanted by other types of sequencing that are less accurate but far faster.

在链终止法中,一条DNA链被分成四个测序反应。每一种都包含所有四个核苷酸和一种起催化剂作用的酶,称为DNA聚合酶。然后在每个测序反应中加入一个双脱氧核苷酸,它基本上是其糖序列缺失部分的核苷酸。在处理这些反应后,科学家们能够对它们进行成像并读取DNA序列。

在DNA测序的鸟枪法中,所有这些都会使用不同的随机DNA片段多次发生。这导致测序DNA的多个重叠部分。然后,一个计算机程序使用重叠的部分来创建一个连续的DNA序列。

鸟枪法的问题在于DNA极其复杂。通常,它包含看起来相同但来自DNA不同部分的重复序列。这套完整的人类DNA称为人类基因组,有超过30亿个碱基对。确保重复序列位置正确的唯一方法是进行更多的随机读数,以便每个零件都被多次排序。即便如此,也会出现错误。

鸟枪测序法一直是DNA测序的前沿,直到2005年左右。从那时起,科学家们创造了下一代测序技术,其工作速度要快得多。与鸟枪测序相比,单个读数的准确度要低,但科学家可以在更短的时间内完成更多读数,从而弥补了这一点。

  • 发表于 2022-02-10 08:46
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  • 分类:科学

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