苯並酶(benzonase)和DNA酶(dnase)的區別
核酸降解是許多分子生物學技術的重要組成部分。它被廣泛應用於重組DNA技術中,以去除不需要的DNA和RN**段。核酸降解酶被稱為核酸酶,根據需要的功能可以有不同的類型。降解DNA的核酸酶稱為脫氧核糖核酸酶,而降解核糖核酸的核酸酶稱為核糖核酸酶。這些酶主要用於體外實驗,在體外分子試驗中分離出純DNA、RNA或蛋白質。苯並酶是一種同時降解DNA和RNA的核酸酶,而dnase只降解DNA。這是苯並酶和脫氧核糖核酸酶的關鍵區別。
目錄
1. 概述和主要區別
2.什麼是苯並酶
3. 什麼是DNase
4. 苯並酶與DNase的相似性
5. 並列比較-苯並酶與DNA酶的表格形式
6. 摘要
什麼是苯並酶(benzonase)?
苯並酶是一種來源於粘質沙雷氏菌的基因工程內切酶。這種酶是在大腸桿菌中工業化生產的。苯並酶能切割雙鏈DNA、線形DNA、環狀DNA和單鏈RNA。因此苯並酶具有重要的商業價值。苯並酶是一種蛋白質二聚體,有245個相同的氨基酸,約30kda的亞基和兩個必需的二硫鍵。苯並酶在5'端裂解核酸,產生5'端遊離的片段。苯並酶可以在任何序列上裂解核酸,但偏愛富含GC的區域。
苯並酶在-20℃下保存,酶活力的最適pH值為8.0~9.2。苯並酶的應用包括蛋白質二維凝膠電泳的樣品製備,其中苯並酶去除結合核酸和從重組蛋白製劑中去除核酸汙染物。它還用於降低蛋白質提取物的粘度,防止細胞在細胞混合物中**。
什麼是DNA酶(dnase)?
脫氧核糖核酸酶(DNase)是一種核酸水解酶,只能切割雙鏈DNA。DNase主要有兩種類型:DNaseⅠ和DNaseⅡ。DNaseⅠ參與切割雙鏈DNA,產生5'自由端的多核苷酸。DNaseⅡ參與切割雙鏈DNA,產生具有3'自由端或懸垂的多核苷酸鏈。
DNA酶i
DNaseⅠ在7.0-8.0的最佳pH值下起作用。酶的活性依賴於許多離子輔助因子,包括Ca2+、Mg2+或Mn2+。Mg2+和Mn2+的活性決定了dna酶I的功能,在Mg2+存在下,DNase I獨立地切割dsDNA的每條鏈。這是隨機發生的。相反,在Mn2+存在的情況下,這種酶在幾乎相同的位置切割兩條DNA鏈。這種切割會產生兩種類型的DN**段:一種是鈍端,另一種是有一個或兩個核苷酸懸置。
DNA酶ii
DNaseⅡ在最適pH為4.5-5.0時起作用,其活性需要二價金屬離子,與DNaseⅠ相似。DNaseⅡ的作用機制主要包括三個步驟。
- Multiple single strand breaks are induced within the DNA backbone.
- Acid soluble nucleotides and oligonucleotides are produced.
- Non-linear hyperchromic shift occurs in the last phase.
DNase酶的主要抑制劑包括金屬螯合劑、過渡金屬和十二烷基硫酸鈉、β-巰基乙醇等。
DNA酶的主要應用包括製備無DNA RNA和蛋白質提取物,以及在體外轉錄實驗中去除模板DNA。
苯並酶(benzonase)和DNA酶(dnase)的共同點
- 兩者都是水解酶。
- 兩者都是核酸酶。
- 兩者都是通過裂解核酸的磷酸二酯鍵來參與的。
- 兩者都需要一個最佳的pH值和儲存溫度來維持酶的活性。
- 酶抑制劑包括螯合劑、過渡金屬和洗滌劑化學品。
- 應用主要集中在獲得高純度的DNA、RNA和蛋白質提取物上。
- 這兩種酶都可以通過基因工程產生。
苯並酶(benzonase)和DNA酶(dnase)的區別
苯並酶vs脫氧核糖核酸酶 | |
苯並酶是一種能夠切割雙鏈DNA、線形DNA、環狀DNA和RNA的酶。 | DNase是一種能夠切割雙鏈DNA的酶。 |
酶的底物 | |
DNA和RNA都是苯並酶的底物。 | DNA是DNA酶的底物。 |
結構 | |
苯甲酸酶的最適pH範圍為7.0~8.0 | DNaseⅠ的最適pH範圍為7.0~8.0,DNaseⅡ的最適pH範圍為4.5~5.0。 |
總結 - 苯並酶(benzonase) vs. DNA酶(dnase)
核酸酶廣泛應用於分子生物學和基因工程的不同實驗過程中。苯甲酸酶和脫氧核糖核酸酶有兩種類型。苯並酶參與降解DNA和RNA,而DNase參與切割雙鏈DNA。這就是苯並酶和脫氧核糖核酸酶的基本區別。目前,這兩種核酸酶都是通過重組DNA技術生產的,這種技術可以產生更高質量的酶,並且可以最大限度地提高產量。
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引用
1.“來自牛胰腺的脫氧核糖核酸酶I D5025。”西格瑪·奧爾德里奇,可在這裡買到。訪問日期:2017年9月19日。“脫氧核糖核酸酶II。”脫氧核糖核酸酶II–沃辛頓酶手冊,可在這裡獲得。訪問日期:2017年9月19日。
2《脫氧核糖核酸酶II》——沃辛頓酶手冊,