尼克翻譯公司(nick translation)和底漆延伸(primer extension)的區別

缺口翻譯和引物延伸是分子生物學中的兩項重要技術。缺口翻譯和引物延伸的關鍵區別在於,缺口翻譯過程為其他雜交技術產生了標記探針,而引物延伸法則從混合物中識別出特定的RNA序列,並揭示了mRNA的表達資訊。這兩種技術都非常重要,通常在分子研究實驗室中進行。...

尼克翻譯公司(nick translation)和底漆延伸(primer extension)的區別

缺口翻譯和引物延伸是分子生物學中的兩項重要技術。缺口翻譯和引物延伸的關鍵區別在於,缺口翻譯過程為其他雜交技術產生了標記探針,而引物延伸法則從混合物中識別出特定的RNA序列,並揭示了mRNA的表達信息。這兩種技術都非常重要,通常在分子研究實驗室中進行。

內容1。概述和關鍵差異2。尼克翻譯3是什麼。什麼是底漆延伸4。並排比較–Nick Translation與Primer Extension5。摘要

什麼是尼克翻譯公司(nick translation)?

缺口翻譯是一種重要的DNA標記方法,用於製備各種分子生物學技術,如印跡法、原位雜交法、熒光原位雜交法等。DNA探針用於識別特定的DNA或RNA序列。在標記探針的幫助下,可以從複雜的核酸混合物中標記或可視化特定片段。因此,使用各種技術製備標記探針,以用於不同的技術。缺口翻譯是一種利用DNA酶1和DNA聚合酶1酶產生標記探針的方法。

缺口翻譯過程始於DNase-1酶的活性。DNase 1通過切割核苷酸之間的磷酸二酯鍵,在雙鏈DNA的磷酸主鏈上引入刻痕。一旦缺口形成,就會產生遊離的3'羥基核苷酸,DNA聚合酶1酶將作用於它。DNA聚合酶1的5′至3′核酸外切酶活性從缺口向DNA鏈的3′方向去除核苷酸。同時加入聚合酶1的核苷酸,以取代聚合酶的活性。如果核苷酸被標記,則會被標記的核苷酸取代,並標記DNA以供識別。這種新合成的標記DNA可作為分子生物學中各種雜交反應的探針。

尼克翻譯公司(nick translation)和底漆延伸(primer extension)的區別

圖01:刻痕翻譯過程

什麼是底漆延伸(primer extension)?

引物延伸是一種從RNA混合物中尋找特定RNA序列並定位mRNA轉錄物5'端的技術。它也被用來研究RNA的結構和表達。引物延伸法是用標記引物或標記核苷酸進行的。如果使用標記引物,則不需要標記用於cDNA合成的核苷酸。這項技術有幾個步驟。它首先從樣本中提取RNA。然後將標記的寡核苷酸引物與必要的成分一起添加到混合物中,以合成特定RNA序列的cDNA。底漆退火與互補序列的混合物。以引物退火序列為模板,酶逆轉錄酶合成RNA序列的互補DNA(cDNA)。引物退火和反轉錄只有在樣品中存在特定的RNA序列時才會發生。最後,當進行變性凝膠電泳時,可以確定RNA序列的大小。用引物延伸法也很容易找到mRNA(轉錄起始位點)序列的+1鹼基。如果使用過量的引物,樣品中存在的mRNA量可以用這種方法定量。

尼克翻譯公司(nick translation)和底漆延伸(primer extension)的區別

圖02:底漆延伸

尼克翻譯(nick translation)和底漆延伸(primer extension)的區別

缺口翻譯vs初級延伸
缺口翻譯是一個為各種雜交反應創造標記DNA探針的過程。 引物延伸是一種用來尋找特定RNA或研究基因表達的技術。
使用的酶
DNA酶和脫氧核糖核酸酶1。 使用逆轉錄酶。
重要性
缺口翻譯有助於標記特定的DNA序列。 引物延伸可以檢測特定的mRNA序列大小和樣本中存在的量。

總結 - 尼克翻譯公司(nick translation) vs. 底漆延伸(primer extension)

缺口翻譯是一種基於DNA酶1和大腸桿菌DNA聚合酶1酶活性合成標記探針的方法。它是在不同雜交技術之前在實驗室中使用的一種體外方法。在缺口翻譯過程中,DNA聚合酶1的5'-3'核酸外切酶活性去除缺口前面的核苷酸,DNA聚合酶1的聚合酶活性用缺口後面的標記核苷酸代替去除的核苷酸。引物延伸法是一種從混合物中檢測特定RNA轉錄物並量化感興趣RNA的大小和數量的方法。尼克和引文之間的區別就在於翻譯。

參考文獻1。裡德,亞歷克斯。“尼克翻譯”,斯普林格。N、 p.,N.d.網絡。2017年4月18日。“初級延伸”,國家診斷。N、 p.,N.d.網絡。2013年4月19日。郭,M.T.和W.Plunkett。中期染色體的缺口翻譯:染色體中核酸酶敏感區的體外標記〉,《美國國家科學院學報》。U、 美國國家醫學圖書館,1985年2月。網狀物。20174年4月19日。Raymond等人。直接監測microRNAs和短干擾RNA的簡單定量引物延伸PCR分析。版權所有2005年RNA協會,2005年11月。網狀物。2017年4月19日

  • 發表於 2020-10-25 21:58
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