迪卡里亚亚王国：子囊菌纲和担子菌纲

最常见的真菌可能属于Dikarya亚王国，包括所有蘑菇、大多数病原体、酵母和霉菌。Dikarya亚王国分为两门，子囊菌门和担子菌门。这些门和已经提出的其他五个门主要根据有性生殖结构进行区分。

子囊菌门

最大的真菌门是子囊菌门。这些真菌被称为子囊菌，或囊真菌，因为它们的减数分裂孢子（子囊孢子）是在称为子囊的囊中发现的。这个门包括单细胞酵母、地衣、霉菌、块菌、许多丝状真菌和一些蘑菇。这个门提供用于制造啤酒、面包、奶酪和药物的真菌。例如曲霉菌和青霉。

担子菌门

属于担子菌门的棒状真菌或担子菌在称为担子菌的棒状结构上产生担子孢子。该门包括最常见的蘑菇、黑粉菌和锈菌。许多谷物病原菌属于这个门。新生隐球菌是一种机会性人体寄生虫。玉米黑粉菌是一种玉米病原菌。

糜菌门

属于糜菌门的真菌称为糜菌。它们是为数不多的具有活跃运动能力的真菌类群之一，产生的孢子可以通过单个鞭毛移动。Chytrids通过降解几丁质和角蛋白获得营养。有些是寄生的。这方面的例子包括登状巴氏杆菌，它在两栖动物中引起一种称为糜霉病的传染病。

来源

斯图尔特，S.N。；钱森J.S。；等人（2004年）。“世界范围内两栖动物减少和灭绝的现状和趋势”，《科学》。306 (5702): 1783–1786.

芽生枝菌门

芽生枝菌门的成员与糜菌门有着近亲属关系。事实上，在分子数据导致它们分离之前，它们被认为属于该门。芽生枝菌是腐生菌，以花粉和几丁质等分解有机物为食。有些是其他真核生物的寄生虫。虽然食糜菌能够进行合子减数分裂，但芽囊菌进行孢子减数分裂。该门的成员显示世代交替。

例如，巨雌异源菌、emersonii芽枝菌和maydis藻。

球墨菌门

属于球墨菌门的所有真菌都进行无性繁殖。这些生物与植物形成共生关系，真菌的菌丝与植物的根细胞相互作用。这种关系使植物和真菌能够获得更多的营养。

黑面包霉菌是这一门的一个很好的例子。

微孢子虫门

微孢子虫门包含形成孢子的单细胞寄生虫真菌。这些寄生虫感染动物和原生生物，即单细胞生物。在人类中，这种感染称为微孢子虫病。真菌在宿主细胞中繁殖并释放细胞。与大多数真核细胞不同，微孢子虫缺乏线粒体。能量是在被称为有丝分裂体的结构中产生的。微孢子虫不运动。

一个例子是腓骨小孢子虫颅角溶解症。

新Callimastigomycota门

新Callimastigomycetes属于新Callimastigomycota门，一个厌氧真菌小门。这些生物体缺乏线粒体。相反，它们的细胞含有氢酶体。它们形成具有一个或多个鞭毛的游动孢子。这些真菌存在于富含纤维素的环境中，如食草动物的消化系统或垃圾填埋场。它们也在人类身上被发现。在反刍动物中，真菌在消化纤维方面起着至关重要的作用。

一个例子是额侧新毛蜥（Neocallimastix frontalis）。

类似真菌的有机体

其他的生物看起来和行为都很像真菌，但它们不是这个王国的成员。黏菌不被认为是真菌，因为它们并不总是有细胞壁，而且它们吸收营养而不是吸收营养。水霉菌和丝孢菌是其他看起来像真菌的生物，但不再与它们分类。