在软骨软化症的初始阶段，治疗重点是增加膝关节周围肌肉的力量。这有助于减少对髌骨的压力，并可能防止对软骨造成更多损伤。伸展运动也被用来增加重要肌肉的柔韧性，比如腘绳肌。然而，如果这种治疗不起作用，那么有时需要手术来清理任何可能导致疼痛的受损软骨。让膝盖休息也是软骨软化症治疗的重要组成部分
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软骨软化症的治疗通常从减少膝关节炎症开始。这可以通过使用冰、非甾体抗炎药（NSAIDs）和停止任何导致疼痛的活动来实现。有时软骨软化症被称为跑步者的膝盖，因为它通常是由在硬表面跑步引起的。在炎症期间，应避免任何导致疼痛的活动。在这段时间里，许多运动员通过进行低冲击性活动（如游泳）进行交叉训练
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物理治疗通常是软骨软化症治疗中最重要的部分。在治疗过程中，腘绳肌和股四头肌群进行一系列强化和柔韧性训练，以恢复膝盖周围肌肉的平衡。常见的运动包括直腿抬高和股四头肌等长收缩

患者充分参与软骨软化症治疗非常重要。保守治疗方法通常不会成功，除非在几个月内每天进行。对于膝盖有问题的人来说，这可能是一次令人沮丧的经历，尤其是如果他或她习惯了剧烈运动，但问题不太可能自行消失。如果没有专门的强化和拉伸计划，疼痛通常会变得更严重。

在某些情况下，保守的软骨软化症治疗可能无效。在这种情况下，可能需要手术来修复问题。膝关节镜检查通常用于检查膝盖内部，以判断疼痛来自何处以及可以采取什么措施。有时软骨软化症是由膝盖外侧的紧密组织结构引起的，在这种情况下，可能需要进行外侧松解手术

手术通常是软骨软化症治疗的最后手段。这是因为更保守的治疗往往会取得成功。此外，手术通常不成功，可能会导致其他问题；如果可以避免，外科医生通常更愿意这样做。